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蛋白质结构预测的若干研究

摘要蛋白质是一种重要的生物大分子,是生命活动的重要承担者,因此蛋白质的结构预测是一个非常重要的问题.该文运用两种启发式算法对蛋白质折叠,以及三维结构进行了预测.蛋白质结构预测仍是一个有待解决的问题.在过去的二十几年中,尽管科学家们已经提出了许多预测蛋白质折叠的方法,进展仍然十分缓慢.对于,蛋白质三级结构的预测,特别是基于已有结构数据的三级结构预测,尽管已经有个别成功的例子,总的来说,还远远没有成熟.随着对蛋白质折叠过程复杂性的认识逐步深入,我们不得不承认,实现从蛋白质一级结构序列直接预测其三维结构这一目标,还需要几十年的艰苦努力.全文共分为四章,第一章介绍了此问题的历史起源和已有的一些重要结果.第二章介绍了氨基酸的分类、非格模型、遗传算法、免疫算法以及全交叉遗传算法的一些基本知识.第三章讲述了如何具体将免疫算法用于蛋白质折叠的预测,并与标准的遗传算法和模拟退火算法进行对比,说明该算法的优越性.第四章说明了如何将全交叉遗传算法用于蛋白质三维结构的预测,将结果与Protein Data Bank(PDB)中的真实三维结构进行了对比.

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