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锌指蛋白基因ZNF18的克隆和表达特征分析

摘要锌指蛋白(zincfinger protein,ZNF)是真核细胞中最普遍存在的一类DNA结合蛋白,其DNA结合区域是由Cys和/或His残基构成的指状结构.根据锌指蛋白结构上的特征,可把它们分为C2H2型、C3H4型和C4H4型等.其中C2H2型ZNF构成最大的转录因子家族.这种蛋白质的结构特点是含有两个或两个以上的锌指单位.锌指单位的基本模式是含有28~30个氨基酸.在C2H2型ZFP中含有功能性结构域,约有1/3的C2H2型ZNF含有KRAB(Kruppel associated box)型结构域.KRAB结构域是由大约75个氨基酸组成,往往存在于ZFP的氨基端,由两个连续的模件A和B构成.很多C2H2型的锌指结构蛋白还包含一个高度保守的氨基酸序列——SCAN结构域.它由80个氨基酸残基构成,富含亮氨酸区域有三个预测的a-螺旋结构.SCAN结构域介导自身或者是和其他蛋白之间的相互作用.ZNF18基因是该研究所通过电子克隆方法得到的一个功能未知的人类新基因,Thiesen(1990)在人的T细胞cDNA库中分离出约30条有代表性的锌指kruppel家族基因,其中之一就是ZNF18,但尚未见其全长CDS的cDNA的克隆、表达及功能的研究报道.ZNF18基因长2261bp生物信息学预测它含一个1647bp完整阅读框,编码一个含有548个氨基酸的C2H2型锌指蛋白.ZNF18基因定位在人的染色体17p13-p12上,包含7个外显子,6个内含子.ZNF18基因与小鼠ZFP535基因在氨基酸水平上有81.9﹪的同源性.该研究以DIG标记的ZNF18的全长编码区的RNA为探针,对小鼠胚胎整体原位杂交结果显示ZNF18主要在心脏特异表达,在尾端和肢芽也有特异表达.Northern杂交结果显示在成体小鼠各组织中ZNF18基因广泛表达,而在心脏中表达量很低,这提示ZNF18基因与心脏发育过程有密切的关系.心脏是脊椎动物胚胎中最早发育形成的器官之一.原肠胚早期,心脏在来自于内胚层背外侧的信号诱导下开始在中胚层进行分化.对ZNF18基因的空间和时间表达谱的研究将有助于进一步深入研究其在心脏的发育及功能中的作用.

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