摘要目的:研究昆明地区2002~2004年210例轮状病毒性肠炎患儿的轮状病毒分子基因特征 方法:收集昆明医学院第一附属医院2002年、2003年、2004年9月~12月儿科住院部和门诊的急性肠炎患儿的粪便标本210份。采用聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳法检测轮状病毒基因组,用逆转录一聚合酶链反应(RT-PCR)以及巢式一聚合酶链反应((net-PCR)对五种主要的VP7的血清型(G1,G2,G3,G4和G9)进行分型。并采用RT-PCR对VP7阳性标本进行NSP4(非结构蛋白4)的基因扩增,选取30份标本用net-PCR扩增出NSP4cDNA500bp并送去测序.测序结果用DNAassist软件包进行翻译,并用直接计数法和χ<,2>检验来处理数据. 结果:1、用PAGE电泳法检测的210份标本中,轮状病毒基因阳性有143份,检出率为68[%];其中长型143份(100[%]),未发现短型和混合型。2、143份PAGE阳性标本有134份可以用RT-PCR扩增VP7基因全长,占93.7[%],其中G1,G2,G3,G4,G9血清型检出率分别是28.4[%](38/134),0.00(0/134).54.5[%](73/134).3[%](4/134),0.00(0/134),混合型占6[%](8/134),未分型8.2(11/134),未分型的有待进一步研究进行分型。3、不同年份RV血清型的构成比不同,2002年以G1型为主,2003年以及2004年以G3型为主.4,NSP4cDNASa)bp测序结果显示有变异,用DNAassist软件包进行翻译,结果显示NSP4cDNA500bp第76位,137位和139位氨基酸有变异,其变异位点为V-I,R-S.V-I。三年标本中30株轮状病毒NSP4核酸序列同源性为97[%]~100[%],同属Wa株轮状病毒。 结论:目前A组轮状病毒是昆明地区婴幼儿秋冬季腹泻的主要致病原,2002~2004年流行的A组轮状病毒以电泳长型为主,未发现电泳短型和混合型;血清型优势株3年中有转变,2002年G1血清型为优势株,占47.5[%].2003年G3血清型为优势株,占94[%],2004年均为G3型。3年比较G3血清型呈逐年上升趋势,G4型有少量检出,未发现G2和G9型。三年监测结果显示NSP4存在变异,但未发现轮状病毒肠炎临床症状与NSP4变异有关。本研究提示对轮状病毒的监测有重要流行病学意义。
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