Reticulon3与Fibulin5的生物信息学分析及相互作用-论文-万方医学网

Reticulon3与Fibulin5的生物信息学分析及相互作用

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摘要目的:以前期研究中，利用酵母双杂交系统筛选出的与Reticulon3(RTN3)相互作用的蛋白为基础，选取Fibulin5(FBLN5)作为进一步研究的对象，从基因水平，蛋白质水平和细胞水平，对RTN3能否与FBLN5相互作用进行预测和验证。相关研究为探究RTN3蛋白除凋亡功能之外的其他功能提供线索。<br>　　方法:(1)通过生物信息学的方法，对RTN3蛋白基因序列进行分析，对RTN3基因启动子序列和转录因子进行预测;(2)通过对RTN3和FBLN5蛋白结构进行模拟和分析，对它们的相互作用可能性进行预测;(3)利用免疫共沉淀技术，从细胞水平证实RTN3与FBLN5能否发生相互作用;(4)依据生物信息学的分析结果，构建RTN3蛋白部分片段缺失的载体，为RTN3功能研究提供条件。<br>　　结果:(1)通过基因序列分析，预测RTN3启动子序列位于47-187bp附近，转录因子为GATA-1;(2)通过蛋白质结构预测，RTN3与FBLN5存在相互作用结构;(3)通过免疫共沉淀实验，证实内源性RTN3与FBLN5可发生相互作用。<br>　　结论:(1)生物信息学分析RTN3与FBLN5的结构与功能，预测它们能相互作用;(2)证实了RTN3在平滑肌细胞中能够与FBLN5结合。