换一批基于虚拟筛选发现4-羟基喹啉类新型IDO1抑制剂
Discovery of novel 4-hydroxyquinolines as indoleamine 2,3-dioxygenase 1 inhibitors by virtual screening
摘要目的 采用药效团模型和分子对接方法对ZINC、Chembridge数据库进行虚拟筛选,并通过酶活性测试进行验证,以发现新骨架结构的IDO1抑制剂.方法 通过分子对接方法靶向IDO1酶活性位点,对ZINC数据库进行虚拟筛选,得到苗头化合物,进行酶活性测试,发现酶活性较好的先导化合物;随后用已进入临床研究的3个IDO1抑制剂构建药效团模型,以此模型对先导化合物类似物进行虚拟筛选,并测定化合物的抑酶活性;通过分子动力学模拟探究化合物与IDO1的结合模式.结果 通过分子对接方法对超过200万个虚拟化合物进行筛选得到11个先导化合物并测酶活性,其中ZINC91657208抑酶活性较好,IC50约为77.15 μmol/L,活性骨架为4-羟基喹啉.亚结构检索4-羟基喹啉的结构得到31个类似物,利用药效团虚拟筛选出10个化合物,并测酶活性,其中3个4-羟基喹啉类化合物均具有明显的抑酶活性,而Chembridge29374490为酶活性最好的IDO1抑制剂,其IC50约为37.78 μmol/L.经分子动力学模拟平衡后,其骨架原子均方差偏根(root mean square deviation,RMSD)分别为1(A)和2.4(A).结论 从ZINC和Chembridge数据库中发现了新型4-羟基喹啉类IDO1抑制剂.
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10.16016/j.1000-5404.201903051
发布时间
2019-10-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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