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肺癌中SOX4基因的调控网络分析验证和蛋白质预测

SOX4 Gene Regulatory Network Analysis Validation and Protein Prediction

摘要目的:分析SOX4基因的调控网络和蛋白产物特征,并进行验证.方法:利用生物信息学方法预测人SOX4基因的调控网络及其蛋白产物与其他蛋白的相互作用;在肺癌细胞系和肺癌临床样本中通过实时荧光定量PCR对miRNA-30s进行定量分析.结果:人类SOX4蛋白可能与TP53、DICER1和SDCBP2等3种蛋白相互作用;SOX4基因可能受多种lncRNA和miRNA的调控;hsa-miR30s在临床样本中表达模式不完全相同.与癌旁组织相比,hsa-miR30c-5p和hsa-miR30d-5p在癌组织中显示低表达,hsa-miR30d-5p则相反;与正常人胚肺成纤维细胞KMB 17相比,肺癌细胞系A549和H1299中3个miRNA-30成员的表达模式均为高表达.结论:SOX4基因及其蛋白产物的生物信息学分析为相关研究提供了重要信息基础,但尚须相关实验验证,以确定相关性.

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作者 李明阳 [1] 马春霞 [1] 吴翰欣 [2] 吴小海 [1] 俞建昆 [1] 学术成果认领
作者单位 中国医学科学院北京协和医学院 医学生物学研究所中心实验室,云南昆明,650118 [1] 昆明医学大学 附属第二医院,云南昆明,650118 [2]
栏目名称
DOI 10.3969/j.issn.1009-0002.2018.04.005
发布时间 2018-10-30(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
协同创新项目(2016-12M-001)
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