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【学位论文】 作者：肖镜舒导师：蔡军 中国科学院大学 生物学 生物工程（硕士） 2020年
【摘要】 单细胞转录组测序技术(Single-cell RNA-seq)是一种可以获得单个细胞转录组数据的测序技术，相比传统的转录组测序技术得到多个细胞基因表达值的平均值，单细胞转录组测序技术能得到单个细胞的转录表达数据;细胞所处的空间位置通常与之命...
【关键词】 单细胞转录组测序技术 ； 冰冻切片 ；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 许泽玫红 杨如玉 等 《国际妇产科学杂志》 2024年51卷1期 82-86页ISTICCA
【摘要】 子宫内膜异位症(endometriosis,EMs)是育龄期妇女常见疾病,发病机制尚未明确.该病有着独特的类肿瘤表现,由细胞成分(如巨噬细胞、自然杀伤细胞和T淋巴细胞等)和非细胞成分共同构成的免疫微环境在异位病灶的发生发展中起重要作用.空间...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘腾 李鑫 等 《生物信息学》 2024年22卷4期 270-276页ISTIC
【摘要】 空间转录组测序技术能够在生成基因表达谱的同时,保留细胞在组织内部的位置信息.如何充分利用基因表达谱和空间位置信息来识别空间区域,完成细胞亚群聚类是空间转录组学数据分析的基础和关键.本文提出基于变分自编码器和图神经网络结合的空间转录组细胞亚群...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 汪启凡 苏国庆 等 《中国肿瘤外科杂志》 2024年16卷6期 603-609页ISTICCA
【摘要】 肿瘤微环境(TME)中细胞之间的相互作用是影响肿瘤进展和患者转归的重要因素,而传统的组学手段无法真实反映TME中细胞的位置和通讯信息.空间组学技术的出现为解决上述问题提供了新的机遇.从空间层面解析TME,有助于全面地理解肿瘤的生物学行为和进...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 关双 刘溪 等 《中国现代医生》 2024年62卷2期 108-111页
【摘要】 空间表达变异基因的识别是阐明空间转录组学的基础.空间表达变异基因的分析需应用空间转录组数据相关公共存储库和计算技术.本文综述空间转录组学应用于空间表达变异基因识别的计算方法,阐述空间表达变异基因识别在肿瘤异质性研究中的应用进展,以进一步理解...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 万令飞 潘文婷 等 《生物技术进展》 2024年14卷5期 793-804页
【摘要】 肝纤维化是一种严重威胁人类健康的疾病,单细胞转录组测序技术为揭示其复杂的病理机制提供了全新途径.传统的研究方法在识别肝纤维化中不同细胞亚群及其基因表达变化方面存在局限,难以深入理解疾病机制.概述了单细胞转录组测序技术在肝纤维化过程中对不同细...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 董艳 李军 等 《世界中医药》 2023年18卷14期 2081-2087,2091页ISTICPKUCA
【摘要】 中医药是我国的传统和特色医学,一直以来为人们的健康保驾护航,但随着现代医学的发展,它逐渐面临着如何实现客观化、精确化和靶向化的难题.转录组学是连接基因与表型的桥梁,决定遗传物质表达与否,受外源和内源因素的共同调控,能反映内部基因组与外部物理...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 焦作义 李鉴 《兰州大学学报（医学版）》 2023年49卷8期 1-5页ISTIC
【摘要】 空间多组学技术是一种综合性的研究方法,旨在结合多个分子组学层面与组织的空间信息,以便更全面地理解生物体内分子之间的相互作用和空间分布[1],揭示生物系统的复杂性和多样性[2].肿瘤组织在空间上表现出多种类型和状态的异质性.
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 谢意 郏科人 等 《肿瘤综合治疗电子杂志》 2023年9卷3期 74-81页
【摘要】 空间多组学技术包括空间转录组学、空间蛋白质组学和空间代谢组学等技术.相较于传统测序和单细胞组学,空间多组学保留了重要的分子空间位置,多维度揭示分子间相互作用及功能状态.在肿瘤学领域,空间多组学技术能将肿瘤细胞及其间质二维结构分辨至细胞以及亚...
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