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【中文期刊】 李小妹 黄士蒙 等 《药物生物技术》 2024年31卷1期 20-28页ISTICCA
【摘要】 研究旨在探寻糖尿病和心力衰竭之间可能存在的关联,并评估纤维化相关基因在其中发挥的作用.从GEO数据库中下载心力衰竭的单细胞测序和转录组测序数据;从CTD数据库中下载与糖尿病相关的基因;通过GO和KEGG通路富集分析寻找与糖尿病相关心力衰竭密...
- 概要：
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【中文期刊】 王海军 陈秋月 等 《中国生物化学与分子生物学报》 2019年35卷10期 1051-1057页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 Oncomine是目前世界上最大的癌基因芯片数据库和综合数据挖掘平台之一,该数据库整合了GEO、TCGA和已发表文献来源的RNA和DNA-seq数据.数据库目前含有715个基因表达数据集(datasheet)、86 733个人体肿瘤组织和正...
【关键词】 Oncomine数据库；癌基因；基因表达与分析；
- 概要：
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【中文期刊】 尤红俊 赵倩倩 等 《中国分子心脏病学杂志》 2021年21卷6期 4326-4334页ISTICCA
【摘要】 目的 对动脉粥样硬化(AS)基因芯片数据进行生物信息学分析,寻找疾病相关核心(Hub)基因,并探讨其在AS发生发展中的作用.方法 利用R语言包对基因表达综合数据库(GEO)中筛选出的AS芯片进行基因差异表达分析,String数据库进行蛋白相...
- 概要：
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【中文期刊】 何阳 杨宏昊 等 《华西医学》 2021年36卷9期 1232-1238页ISTICCA
【摘要】 目的 利用生物信息学分析方法筛选与玫瑰痤疮发生、发展有关的关键基因和信号转导通路.方法 截至2021年7月12日,从基因表达综合数据库中按照关键词"rosacea"进行检索,最终获得GSE65914基因芯片集.利用GEO2R平台对该数据集进...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 刘曦 刘卓琦 等 《中国生物化学与分子生物学报》 2016年32卷3期 260-266页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 基因表达谱微阵列数据库是一类可提供存储、查询、下载分析的在线网络数据库,在肿瘤相关领域的研究中提供了大量的数据来源.由于微阵列分析对于无生物/医学信息学专业背景的研究人员仍然有较多困难,致使该数据库的使用尚未普及.本文从数据查询、下载分析和...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 张厦栋 辛晓红 等 《中国分子心脏病学杂志》 2020年20卷1期 3255-3263页ISTICCA
【摘要】 目的 通过GEO数据库转录组和miRNA基因芯片数据筛选和分析动脉性肺动脉高压相关基因.方法 通过GEO数据库收集转录组数据集(GSE113439、GSE53408)和miRNA数据集(GSE21284、GSE55427).使用R3.5.2...
- 概要：
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【中文期刊】 吴茜 宋兴勃 等 《华西医学》 2019年34卷9期 1033-1041页ISTICCA
【摘要】 目的 探索结核病的发病机制,为结核病的早期诊断和治疗评估提供新思路.方法 从基因表达数据库中获取GSE54992基因表达谱,使用美国国立生物技术信息中心在线实验室筛选差异表达基因(differentially expressed gene,...
- 概要：
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【中文期刊】 袁一顺 刘中勇 等 《中国老年学杂志》 2025年45卷11期 2561-2569页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 通过生物信息学,从铁死亡角度探讨动脉粥样硬化发病机制及相关中药筛选.方法 分别通过高通量基因表达数据库(GEO)、铁死亡数据库(FerrDb)获取动脉粥样硬化、铁死亡相关作用基因.利用"limmar"包筛选出动脉粥样硬化中与铁死亡发生...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李建雨 石欢 等 《中国老年学杂志》 2025年45卷7期 1583-1588页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 通过生物信息学和实验验证宫颈癌(CC)发生发展的核心基因,探索潜在的分子标志物.方法 从基因表达数据库(GEO)下载基因芯片数据集[基因集富集(GSE)9750、GSE127265和GSE173097],经过筛选后得到差异表达基因(D...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈瑜 邱志维 等 《中国临床药理学杂志》 2025年41卷8期 1175-1179页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 借助生物信息学技术研究细胞衰老在高血压肾病中可能发生的机制及相关信号通路.方法 查找基因表达数据库下载微阵列数据GSE37455,用R软件合并数据并去除批次效应,获取差异表达基因.从细胞衰老基因CellAge数据库获取细胞衰老基因,通...
- 概要：
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