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【中文期刊】 杨纪青 袁磊 等 《基因组学与应用生物学》 2010年29卷6期 1064-1071页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 本文利用自编计算机程序提取并展示马铃薯X病毒完整基因组(NC_011620.1)上微卫星分布特性.借助MATLAB软件和借用最优完全子图算法,分析NCBI数据库中该基因组(NC_011620.1)微卫星分布特性.结果表明,计算出所有各种N-...
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- 方法：
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【中文期刊】 王欣 马莹 等 《中国水稻科学》 2019年33卷4期 331-337页
【摘要】 [目的]在亲本一般配合力的基础上优选特殊配合力高的杂交种,是水稻杂种育种的关键.基因组选择基于覆盖全基因组的分子标记和样本的表型数据建立预测模型,实现对品种更加可靠的选择.[方法]本研究利用一组基于不完全双列杂交(NCII设计)的水稻数据集...
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- 结论：
【学位论文】 作者：陈小苏 导师：喻祖国 湘潭大学 数学 应用数学（硕士） 2011年
【摘要】 本文首先介绍无序列比对亲缘分析方法中常用的距离和非相似度,并讨论了它们是否是严格数学意义下的距离。本文发现有很多虽然被称之为距离,但是实际上并不是数学意义下的距离。接着对随机背景下的无序列比对亲缘分析方法中提出使用三种新的非相似度。在动力学...
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【学位论文】 作者：战晓文 导师：喻祖国 湘潭大学 数学 应用数学（硕士） 2010年
【摘要】
大多数基于完全基因组且无序列比对的用于亲缘分析的距离方法中存在一个不足之处,就是这些距离在数学意义下并不是严格的距离。
本文首先介绍基于完全基因组的四种建树的字符串距离方法,这些距离基于原始的基因组序列得到的字,并不需要进行序列比...
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- 方法：
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【学位论文】 作者：毛志 导师：喻祖国 湘潭大学 数学 应用数学（硕士） 2007年
【摘要】 本文系统地提出了一种用于完全基因组上基于序列互信息的距离在构建脊椎动物进化史中的应用。传统的序列距离要求进行序列比对，而在整个基因进化史中，诸如重排列的事件破坏了全长比对。并且，目前还没有用于完全基因组进化研究的统计模型。因此，现有的工具和...
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【学位论文】 作者：李小春 导师：喻祖国 湘潭大学 数学 应用数学（硕士） 2007年
【摘要】
对生物信息学家和计算生物学家来说，精确的预测基因组中的基因一直是项很有挑战性的任务。因此，发现编码序列和非编码序列中有明显的尺度联系的存在性会给弄清DNA序列带来新的前景，这就促使我们去寻找新的方法来描叙和区分编码和非编码序列。
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- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 黄丽红 荀鹏程 等 《中国卫生统计》 2006年23卷4期 315-318页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 探讨系统发育在SARS病毒分类中的应用.方法 系统发育分析是通过构建系统树来评价物种或分子之间进化关系的一种方法 .本文采用目前比较成熟、应用较为广泛的系统发育分析软件PHYLIP,根据GenBank中14个冠状病毒、17个SARS病...
- 概要：
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【中文期刊】 葛长勇 孙茂盛 《中国生物制品学杂志》 2007年20卷6期 409-412页ISTICCSCDCABP
【摘要】 目的 从引物设计的合理性、扩增片段的保守性、检出目的 片段的敏感性等方面比较4对猴空泡病毒40(SV40)核酸检测引物之间的差异,为寻找保守性好、稳定高效的SV40核酸序列检测法提供理论基础.方法 以目前已知的23个不同SV40毒株完全基因...
- 概要：
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【中文期刊】 王晓庆 龙杰 等 《临床肝胆病杂志》 2024年40卷6期 1183-1190页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 探讨结直肠癌(CRC)中肿瘤相关成纤维细胞(CAF)对免疫治疗和肝转移的影响.方法 从基因表达数据库(GEO)中下载错配修复缺陷(MMRd)的CRC患者相关的单细胞测序数据(GSE205506),利用R软件对原始测序数据进行预处理,建...
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