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【中文期刊】 李春华 马晓慧 等 《生物化学与生物物理进展》 2006年33卷7期 616-621页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 蛋白质分子间相互作用与识别是21世纪生命科学研究的前沿和热点.分子对接方法是研究这一课题有效的计算机模拟手段.通常,蛋白质-蛋白质分子对接包括四个阶段:搜索受体与配体分子间的结合模式,过滤对接结构以排除不合理的结合模式,优化结构,用精细的打...
【关键词】 蛋白质-蛋白质分子对接；过滤；打分函数；
- 概要：
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【中文期刊】 陆旭峰 陆振宇 等 《数据采集与处理》 2018年33卷4期 603-610页
【摘要】 分子对接是预测蛋白质复合物的有效手段.对于分子对接算法的优化旨在加速分子对接效率,降低计算成本,以及充分发挥计算资源的利用率.本文主要采用3个方案对半柔性对接算法进行优化:(1)方案一在CPU端进行优化;(2)方案二在方案一的基础上,利用C...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 江连洲 《中国食品学报》 2015年15卷8期 1-9页
【摘要】 对现有食用蛋白质加工技术进行总结,首次提出蛋白质柔性化加工技术概念,即通过物理、化学及生物加工方式改变蛋白质天然的刚性结构,使其柔性化,从而极大地提高蛋白质的工程特性、营养特性和生物功能等综合应用价值.
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【中文期刊】 康玲 李洪林 等 《应用基础与工程科学学报》 2008年16卷6期 802-810页
【摘要】 首先阐述了分子对接设计的基本原理,然后在蛋白质受体中引入关键残基的概念,建立了一个新的柔性分子对接模型.以配体的中心坐标以及它和受体关键残基的旋转键角为设计变量,以设计变量的尺寸为约束,通过最小化分子间相互作用能得到分子的最优取向和构象.一...
- 概要：
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【中文期刊】 康玲 李洪林 等 《大连理工大学学报》 2008年48卷2期 282-286页
【摘要】 分子对接是计算机辅助药物分子优化设计中的一种重要方法,为此建立了基于诱导契合的分子对接优化模型.模型中引入残基基团的概念,将蛋白质划分成若干个残基基团,通过这些残基基团的运动近似表征整个蛋白质的运动情况,并将配体小分子的运动处理为平移、转动...
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【学位论文】 作者：高闯导师：赵亮 广西大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术（硕士） 2021年
【摘要】 表位是抗原上特定的且空间相邻的氨基酸残基序列，它能够被抗体识别并激活免疫反应。识别抗原表位对现代疫苗设计、试剂制备和药物开发等方面都具有重要的现实意义。实验方法虽然能够准确鉴别抗原表位，但是这种方法需要消耗大量的时间和资源。因此，需要开发成...
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【学位论文】 作者：丁成涛导师：张志勇 中国科学技术大学 生物学 计算生物学（博士） 2021年
【摘要】 生物大分子(蛋白质、核酸等)通常会参与很多生命活动，这些大分子的三维结构与功能息息相关。结构生物学家通过不断开发出新的技术方法去解析生物大分子的三维结构，试图通过对三维结构的解析来更好的阐述生物大分子在生命活动中的作用机制。这些解析大分子结...
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【学位论文】 作者：张晓慧导师：王知人 燕山大学 数学 计算数学（硕士） 2021年
【摘要】 蛋白质是生命体活动的载体。蛋白质分子的柔性运动对生物体各类反应都有着非常重要的意义，基于蛋白质的空间构象预测其柔性运动有利于更好的理解蛋白质的功能，是蛋白质结构-功能关系探究方面的重要课题。RNA分子的柔性预测研究起步较晚，其结构分析起来也...
- 概要：
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【学位论文】 作者：杨泓莹导师：杨应斌 西南大学 基础医学 遗传学（硕士） 2020年
【摘要】 蛋白质的热稳定性不仅与氢键、二硫键、离子键、疏水作用等分子间的相互作用和其周围环境有关，还涉及到蛋白质的折叠与解折叠过程，而影响蛋白质折叠与解折叠过程的重要因素之一是蛋白质的刚性与柔性区域的结构，因此增强蛋白质柔性区域的刚性有可能阻碍升温过...
- 概要：
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【学位论文】 作者：谷昊晟导师：王知人 燕山大学 数学 运筹学与控制论（硕士） 2020年
【摘要】 蛋白质是生物体的重要组成部分，蛋白质的生物学功能在很大程度上取决于其三级结构的动力学性质，从蛋白质的三维结构预测蛋白质不同残基的柔性运动是理解蛋白质功能的分子机制的基础。近年来，卷积神经网络(convolutional neural net...
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