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【中文期刊】 林艺灵 徐小萍 等 《应用与环境生物学报》 2021年27卷5期 1364-1371页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为了解龙眼RNA依赖的RNA聚合酶基因(RDRP)家族的生物学功能,采用生物信息学分析方法对龙眼RDRP家族基因成员进行鉴定,并且对其染色体定位、分子进化树、启动子顺式作用元件、蛋白质结构域、蛋白质二级和三级结构、蛋白质互作、可变剪接类型以...
【关键词】 龙眼;RNA依赖的RNA聚合酶基因(RDRP);基因家族;
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【学位论文】 作者:向宇嘉导师:赵莉蔺 中国科学院大学 生物学 生物工程(硕士) 2021年
【摘要】 蛋白质翻译后修饰(posttranslationalmodification,PTM)是重要的生物调控机制,在病毒-宿主互作过程中的病原识别,免疫逃避等方面起着关键作用。随着蛋白质修饰组学技术的迅速发展,目前已积累大量病毒蛋白翻译后修饰位点...
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【学位论文】 作者:朱合欢导师:谭建明 厦门大学 临床医学 外科学(硕士) 2019年
【摘要】 PBLD(Phenazine Biosynthesis Like Protein Domain Containing,吩嗪生物合成类蛋白质结构域)是在2001年由Iriyama等利用酵母双杂交技术,以STRAP(丝氨酸/苏氨酸受体激酶相关蛋...
【关键词】 肾透明细胞癌 ; 吩嗪生物合成类蛋白质结构域 ;
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【学位论文】 作者:余致君导师:刘劲松 中国科学院大学 生物学 生物化学与分子生物学(硕士) 2018年
【摘要】 Sorting Nexin(SNX)蛋白家族是由一类具有吞噬细胞氧化酶同源性结构域(Phox-homology domain,PX domain)的蛋白质组成的。PX结构域能够与磷脂酰肌醇相互作用,并且在细胞内物质运输、信号转导、膜重建等过...
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【学位论文】 作者:马冲导师:钟儒刚 贺福初 杨冬 北京工业大学 生物医学工程 生物医学工程(硕士) 2016年
【摘要】 蛋白质结构域是蛋白结构、功能和进化的基本单位。有趣的是,尽管大多数结构域是结构化的,但研究者也发现部分结构域是无序的。所以,基于生物信息学方法,对基因组中编码的所有蛋白质(本论文中称为“全蛋白质组”)中存在的无序结构域进行统计,分析它们的功...
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【学位论文】 作者:邓立宗导师:蒋太交 中国科学院大学 生物学 生物信息学(博士) 2014年
【摘要】 蛋白质的结构域是蛋白质结构、功能和进化的基本单元,因此,深刻的理解蛋白质结构域是如何组织的,对于我们认识蛋白质非常关键。之前已经一系列的工作尝试着去寻找在蛋白质结构域中起到关键作用的残基。但我们知道,蛋白质架构的一个重要特征就是二级结构元件...
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【学位论文】 作者:李春艳导师:郝沛 中国科学院大学 生物学 生物工程(硕士) 2014年
【摘要】 世界范围内,病毒感染每年导致数以百万计的人口死亡。病毒-宿主互作组学的研究可以揭示病毒感染的机制和策略。在研究中,我们首先基于蛋白质结构域相互作用描绘了一幅病毒-宿主互作组学的网络图景。与蛋白质水平的分析相比,结构域互作可以提供更为精简的功...
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【学位论文】 作者:冯晶导师:田大成 南京大学 生物学 植物学(硕士) 2010年
【摘要】 基因编码区(CDS)非同义核苷酸(nsSNP)的突变可以导致该区域编码氨基酸的改变,其在蛋白质的进化过程中起着非常重要的作用。尽管如此,对于CDS不同区域的突变与进化模式的相关报道还比较少。因此,本研究以完全测序的哺乳动物和果蝇为研究对象,...
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【学位论文】 作者:朱蕾导师:林魁 北京师范大学 生态学 生态学(博士) 2008年
【摘要】 蛋白质的相似性比对方法通常被用于蛋白质的比较和分类,以此注释和理解功能未知的蛋白质。然而自然界中大量的多结构域蛋白质往往降低了这些传统比较方法的有效性,因为由于某些广泛存在的结构域,在比对过程中经常将许多非同源关系的蛋白质连接起来或者产生信...
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【学位论文】 作者:马照云导师:冯圣中 张法 中国科学院计算技术研究所 计算机科学与技术 计算机系统结构(硕士) 2008年
【摘要】
蛋白质结构决定蛋白质功能。随着各种基因组计划的完成,产生了海量的蛋白质序列数据,通过传统试验的方法已经无法对这些数据进行及时地处理。因此,利用计算方法进行蛋白质三维结构预测已成为当前生物信息学的研究热点之一。
在蛋白质结构预测...
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