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【中文期刊】 么欣彤 孙善月 等 《复旦学报(医学版)》 2022年49卷3期 425-434页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 目的 建立一种适用于低起始量血浆样本的高通量(96样本/批次)、自动化miRNA文库构建方法,并系统评估该方法的可靠性与跨批次一致性.方法 基于PerkinElmer公司的NEXTFLEX?small RNA-seq试剂盒和Sciclone...
【关键词】 二代测序;miRNA测序技术(miRNA-seq);文库构建;
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【中文期刊】 张刚 刘丹丹 等 《山东医药》 2021年61卷33期 15-19页ISTICCA
【摘要】 目的 筛选先天性肺气道畸形(CPAM)患儿病变组织中的差异表达基因,并分析其生物学功能.方法 CPAM患儿5例,接受胸腔镜微创手术治疗时留取CPAM病变组织、CPAM病变旁组织,使用Total RNA-seq(H/M/R)Library P...
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【中文期刊】 阚东扬 《福建质量管理》 2020年12期 277-278页
【摘要】 RNA-seq是基于新一代测序技术,即深度测序技术发展而来的一种大规模,高效的测序技术,也被称为转录组测序技术.由于它所具有的高通量,高灵敏度以及测序成本低廉,RNA-seq已被广泛应用于各种基因组,转录组研究中.
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【中文期刊】 许昊 刘小亮 等 《第三军医大学学报》 2019年41卷9期 866-870页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 优化Tn5转座酶纯化和组装过程,建立少量细胞高质量转录组深度测序文库(RNA-Seq)的构建策略.方法 构建Tn5转座酶表达载体pSUMO-Tn5,优化Tn5转座酶表达、亲和纯化和组装过程,比较不同组装方式的Tn5转座酶构建少量RAW...
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【学位论文】 作者:许昊 导师:万瑛 陆军军医大学 基础医学 免疫学(硕士) 2019年
【摘要】 二代测序技术作为测序技术发展史上的一个里程碑,该技术可实现对百万级的DNA分子完成高效深度测序,为基因表达调控和功能研究带来了革命性改变。而RNA-seq作为转录组研究的重要方法,加深了我们对细胞亚群和基因功能的认识,推动细胞中差异性表达基...
- 概要:
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【中文期刊】 邹宏 夏应菊 等 《中国兽药杂志》 2022年56卷9期 71-78页
【摘要】 利用转录组测序技术(RNA-sequencing,RNA-seq)进行转录组分析是了解病原体入侵宿主分子变化的重要工具,在同时分析病原体与宿主转录组时,RNA-seq技术需要分别构建病原体及宿主的cDNA文库,再将其各自映射到病原体及宿主参...
【关键词】 Dual RNA-seq;转录组;相互作用;
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【中文期刊】 干意 封叶 等 《解放军医学杂志》 2018年43卷11期 924-932页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用RNA-Seq检测正常小鼠与心肌肌钙蛋白I(cTnI)R193H突变所致限制性心肌病(RCM)小鼠中差异表达的基因,探索RCM的发病机制.方法 取3月龄C57小鼠和cTnI 193H突变小鼠的心脏,提取心肌组织全mRNA,并反转录...
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【中文期刊】 陈柳 华清泉 《中国医药导报》 2016年13卷6期 58-61页ISTICCA
【摘要】 转录组(RNA-Seq)是新一代测序技术,利用高通量测序技术对组织或细胞中所有RNA反转录而成的cDNA文库进行测序,从整体水平研究基因的功能及其结构,揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机制,而癌症疗效评估的关键在于肿瘤的复发率和对...
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【中文期刊】 高原 王翌霞 等 《云南农业大学学报(自然科学)》 2014年29卷5期 642-647页
【摘要】 基于第二代测序技术的转录组测序(RNA-seq)是目前基因表达分析的重要手段,其测序深度与检出的表达基因数量及基因表达量准确程度直接相关.为探索转录组测序深度对基因表达分析的影响,进而为不同实验需求选择合适的测序深度提供参考,本研究采用Hi...
- 概要:
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【中文期刊】 何雨琦 李桂梅 等 《基因组学与应用生物学》 2017年36卷11期 4607-4615页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 RNA-seq是利用深度测序进行转录组分析的技术,并且在新一代测序的主流平台Illumina上运用广泛.针对Illumina平台的RNA-Seq建库,目前有多个不同类型的建库方法支持该技术,但是在操作步骤和成本上有很大差距.本研究分别试验了...
【关键词】 新一代测序;Illumina测序平台;RNA-seq建库;
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