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【中文期刊】 彭乔木 范诗秋 等 《吉首大学学报(自然科学版)》 2024年45卷5期 52-60页
【摘要】 为了阐明前列腺增生患者术前和术后尿液菌群特征,探究差异微生物类群发挥作用的机理,采用宏基因组鸟枪法对健康人群(对照)、前列腺增生患者术前和术后尿液样品进行测序,并利用相关软件进行生物信息学分析.结果表明:尿液微生物多样性呈现出术前组明显低于...
【中文期刊】 刘芳 舒志强 等 《食品科学》 2024年45卷22期 73-84页
【摘要】 为了详细解析从仿刺参肠道中分离出1 株具有较高酶活力高产褐藻胶裂解酶菌株S10的基因组序列信息,进而深入挖掘与褐藻胶裂解酶相关的基因资源,本研究通过形态学观察和16S rRNA序列分析对菌株S10进行菌种鉴定,然后利用Illumina二代测...
【中文期刊】 马浩天 李杨 等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷12期 5117-5127页
【摘要】 [目的]贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)CM7-4是从海水中分离的具有良好抗菌活性的芽孢杆菌.本试验旨在探究贝莱斯芽孢杆菌CM7-4的抗菌机理,并对其全基因组序列进行分析,以期挖掘其抗菌等功能特性基因.[方法]通过酸...
【中文期刊】 罗婷 韩著 等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷5期 2154-2167页
【摘要】 旨在进一步完善牛支原体全基因组数据库,阐明其生物学功能和遗传进化关系,对西藏牦牛源牛支原体T10株进行了全基因组测序及其序列分析.使用Nanopore和Illumina PE150测序平台对T10株进行全基因组序列测定,利用生物信息学对其进...
【中文期刊】 郑雪 梁琪 等 《食品科学》 2023年44卷20期 119-126页
【摘要】 融合魏斯氏菌(Weissella confusa)ZW2 1是1 株具有良好抗菌活性的牦牛乳源乳酸菌,为探索其抗菌机理,分析其全基因组序列并挖掘该菌株的抗菌等功能特性基因.本研究基于Illumina NovaSeq PE150平台对W.co...
【中文期刊】 蒲思成 郑惠滨 等 《中国畜牧兽医》 2023年50卷11期 4545-4556页
【摘要】 [目的]本研究旨在通过研究1株牦牛源产细菌素屎肠球菌SWUN5732的基因组序列,发掘该菌种的关键功能性特征基因.[方法]通过Illumina PE150测序系统,对屎肠球菌SWUN5732进行基因组测序,并在GO、KEGG、COG和NR数...
【中文期刊】 薛倩 邢伟杰 等 《中国畜牧兽医》 2023年50卷10期 3869-3881页
【摘要】 [目的]汶上芦花鸡为中国唯一的芦花羽地方鸡品种资源,芦花基因可伴性遗传,芦花羽性状可用于雏鸡的自别雌雄.试验旨在丰富家鸡基因组信息,获取汶上芦花鸡全基因组序列,为鸡伴性芦花羽分子机制研究提供材料.[方法]以汶上芦花鸡为试验动物,基于BGI ...
【关键词】 汶上芦花鸡; 基因组组装; PacBio三代测序技术;
【中文期刊】 王舸楠 李佳谦 等 《食品科学》 2023年44卷16期 213-219页
【摘要】 通过PacBio Sequel II及Illumina NovaSeq 6000测序平台对高产聚苹果酸(polymalic acid,PMLA)产黑色素短梗霉(Aureobasidium melanogenum)基因组进行测序,对测序得到的...
【中文期刊】 晋家正 李午佼 等 《四川动物》 2018年37卷2期 121-126页 ISTICPKU
【摘要】 以美洲大蠊Periplaneta americana为原料生产的康复新液等药品临床疗效显著,得到了广泛应用.本文以四川好医生攀西药业有限责任公司饲养的药用美洲大蠊为材料,首次采用Illumina HiSeq 2000和PacBio SMRT...
【中文期刊】 王琦 陈秀玲 等 《微生物学通报》 2024年51卷8期 2986-3003页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [背景]根际土壤中分布着丰富的微生物类群,其中不少微生物具有拮抗病原菌的能力,以此保护植株免受病害侵袭.[目的]分离并鉴定出一株具有促生作用的生防细菌,从基因组学与生物信息学角度探究生防菌的抑菌机制.[方法]采用平板稀释涂布法筛选出具有拮抗...