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【中文期刊】 刘阳 王小磊 等 《军事医学》 2013年37卷10期 774-779页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 利用图形处理器(graphic processing unit,GPU)计算技术对广泛使用的生物信息学序列比对工具BLASTN加速,服务于新一代测序技术条件下海量生物序列数据分析任务.方法 采用计算统一设备架构(compute uni...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李娟 汤德佑 等 《计算机工程与科学》 2017年39卷9期 1610-1616页
【摘要】 生物序列比对是生物信息领域的重要课题,比对结果的合理性和正确性关系到基于比对结果研究的正确性.在保证正确性的前提下利用并行计算充分挖掘计算潜力对提高比对效率有重要意义.针对双序列的全局比对问题,提出了基于蚁群算法的双序列比对并行化方案.对耗...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Li, J. ; Hu, J. ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2014年11卷5期 973-978页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Katoh, Kazutaka ; Toh, Hiroyuki . ; 《Bioinformatics》 2010年26卷15期 1899-1900页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 parallel processing;progressive alignment;parallelization strategy;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Katoh, Kazutaka ; Standley, Daron M. ; 《Molecular biology and evolution》 2013年30卷4期 772-780页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 multiple sequence alignment;metagemone;protein structure;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Kimura, K. ; Koike, A. ; 等 《Journal of Bioinformatics and Computational Biology》 2012年10卷4期 1250002-1-1250002-15页MEDLINE
【关键词】 approximate string matching;Bit-parallel computations;broadword computations;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Truong, C. ; Divakar, P.K. ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2013年68卷2期 357-372页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Cryptic species;Lichen-forming fungi;Parallel evolution;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Jia Yu ; Jochen Blom ; 等 《Journal of Biotechnology》 2017年257卷 58-60页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Sequence alignment;Parallel computing;Cloud computing;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Khadidja Belattar ; El-Amine Zemali ; 等 《International journal of bioinformatics research and applications》 2022年18卷5期 460-478页
【关键词】 parallel sequence alignment;multiple sequence alignment;bioinformatics;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 《Journal of Biotechnology》 2017年257卷 58-60页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Sequence alignment;Parallel computing;Cloud computing;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
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