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            21. Logical modelling of in vitro differentiation of human monocytes into dendritic cells unravels novel transcriptional regulatory interactions. oa

            【外文期刊】 Karen J,Nuñez-Reza ; Aurélien,Naldi ; 等 《Interface focus》 2021年11卷4期 20200061页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 dendritic cells; differentiation; logical modelling;

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            22. Transcription factor binding predictions using TRAP for the analysis of ChIP-seq data and regulatory SNPs.

            【外文期刊】 Morgane,Thomas-Chollier ; Andrew,Hufton ; 等 《Nature protocols》 2011年6卷12期 1860-9页 SCIMEDLINECA

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            23. HoxPred: automated classification of Hox proteins using combinations of generalised profiles. oa

            【外文期刊】 Morgane,Thomas-Chollier ; Luc,Leyns ; 等 《BMC bioinformatics》 2007年8卷 247页 SCIMEDLINEBP

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            24. Retrieve-ensembl-seq: user-friendly and large-scale retrieval of single or multi-genome sequences from Ensembl.

            【外文期刊】 Olivier,Sand ; Morgane,Thomas-Chollier ; 等 《Bioinformatics (Oxford, England)》 2009年25卷20期 2739-40页 SCIMEDLINECABP

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            25. RSAT 2015: Regulatory Sequence Analysis Tools. oa

            【外文期刊】 Alejandra,Medina-Rivera ; Matthieu,Defrance ; 等 《Nucleic acids research》 2015年43卷W1期 W50-6页 SCIMEDLINECABP

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            26. Cis-acting variation is common across regulatory layers but is often buffered during embryonic development. oa

            【外文期刊】 Swann,Floc'hlay ; Emily S,Wong ; 等 《Genome research》 2021年31卷2期 211-224页 SCIMEDLINECABP

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            27. Histone Chaperone SSRP1 is Essential for Wnt Signaling Pathway Activity During Osteoblast Differentiation.

            【外文期刊】 Tareq,Hossan ; Sankari,Nagarajan ; 等 《Stem cells (Dayton, Ohio)》 2016年34卷5期 1369-76页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Histone chaperone; Osteoblast differentiation; Structure specific recognition protein;

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            28. Theoretical and empirical quality assessment of transcription factor-binding motifs. oa

            【外文期刊】 Alejandra,Medina-Rivera ; Cei,Abreu-Goodger ; 等 《Nucleic acids research》 2011年39卷3期 808-24页 SCIMEDLINECABP

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            29. Corrigendum: Sequences flanking the core-binding site modulate glucocorticoid receptor structure and activity. oa

            【外文期刊】 Stefanie,Schöne ; Marcel,Jurk ; 等 《Nature communications》 2016年7卷 13784页 SCIMEDLINECA

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            30. RSAT 2011: regulatory sequence analysis tools. oa

            【外文期刊】 Morgane,Thomas-Chollier ; Matthieu,Defrance ; 等 《Nucleic acids research》 2011年39卷Web Server issue期 W86-91页 SCIMEDLINECABP

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            31. RSAT variation-tools: An accessible and flexible framework to predict the impact of regulatory variants on transcription factor binding. oa

            【外文期刊】 Walter,Santana-Garcia ; Maria,Rocha-Acevedo ; 等 《Computational and structural biotechnology journal》 2019年17卷 1415-1428页 SCIMEDLINE

            【关键词】 Binding motifs; CEU, Northern Europeans from Utah; CRM, Cis-Regulatory Module;

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            32. RSAT: regulatory sequence analysis tools. oa

            【外文期刊】 Morgane,Thomas-Chollier ; Olivier,Sand ; 等 《Nucleic acids research》 2008年36卷Web Server issue期 W119-27页 SCIMEDLINECABP

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            33. RSAT peak-motifs: motif analysis in full-size ChIP-seq datasets. oa

            【外文期刊】 Morgane,Thomas-Chollier ; Carl,Herrmann ; 等 《Nucleic acids research》 2012年40卷4期 e31页 SCIMEDLINECABP

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            34. Alternative splicing induced by bacterial pore-forming toxins sharpens CIRBP-mediated cell response to Listeria infection. oa

            【外文期刊】 Morgane,Corre ; Volker,Boehm ; 等 《Nucleic acids research》 2023年51卷22期 12459-12475页 SCIMEDLINECABP

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            35. Logical modeling of lymphoid and myeloid cell specification and transdifferentiation. oa

            【外文期刊】 Samuel,Collombet ; Chris,van Oevelen ; 等 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2017年114卷23期 5792-5799页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 cell fate; cell reprogramming; dynamical modeling;

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            36. Origin and diversification of the basic helix-loop-helix gene family in metazoans: insights from comparative genomics. oa

            【外文期刊】 Elena,Simionato ; Valérie,Ledent ; 等 《BMC evolutionary biology》 2007年7卷 33页 MEDLINE

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            37. Molecular insights into the origin of the Hox-TALE patterning system.

            【外文期刊】 Bruno,Hudry ; Morgane,Thomas-Chollier ; 等 《eLife》 2014年3卷 e01939页

            【关键词】 Hox; Nematostella vectensis; TALE;

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            38. A complete workflow for the analysis of full-size ChIP-seq (and similar) data sets using peak-motifs.

            【外文期刊】 Morgane,Thomas-Chollier ; Elodie,Darbo ; 等 《Nature protocols》 2012年7卷8期 1551-68页 SCIMEDLINECA

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            39. Analyzing multiple data sets by interconnecting RSAT programs via SOAP Web services: an example with ChIP-chip data.

            【外文期刊】 Olivier,Sand ; Morgane,Thomas-Chollier ; 等 《Nature protocols》 2008年3卷10期 1604-15页 SCIMEDLINECA

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            40. Cooperation between T cell receptor and Toll-like receptor 5 signaling for CD4+ T cell activation.

            【外文期刊】 Otoniel,Rodríguez-Jorge ; Linda A,Kempis-Calanis ; 等 《Science signaling》 2019年12卷577期 SCIMEDLINEBP

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