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【中文期刊】 白晋伟 沈百荣 《医学信息学杂志》 2018年39卷1期 8-11,32页 ISTICCA
【摘要】 介绍深度测序技术对生物医学研究和社会的影响,讨论深度测序数据解析及其在健康管理应用中所面临的挑战和机遇,包括数据存取、计算技术、数据应用、人才缺失与跨学科人才教育等方面.
【中文期刊】 刘凤姣 杨海红 等 《生物技术通讯》 2017年28卷6期 715-724页 ISTICCA
【摘要】 目的:运动神经源性聚集蛋白诱导骨骼肌表面乙酰胆碱受体(AChR)聚集簇的形成是神经肌肉接头(NMJ)的关键步骤.本研究旨在利用高通量深度测序技术,筛选调控成肌分化和AChR聚集簇形成相关的关键信号通路和潜在的重要靶基因.方法:建立小鼠成肌细...
【中文期刊】 李武县 陈红 等 《广东医学》 2017年38卷19期 2950-2957页 ISTICCA
【摘要】 目的 检测唐氏综合征(DS)患儿与健康儿童外周血单个核细胞miRNA表达的差异,探索DS患儿21号3染色体扰乱2倍体基因表达和免疫缺陷的形成机制.方法 收集6例标准核型DS患儿(DS组)和6例健康儿童(non-DS组)外周血标本,分别提取各...
【中文期刊】 闫琳琳 张恒辉 等 《中华实验和临床感染病杂志(电子版)》 2016年10卷2期 151-156页 ISTICCA
【摘要】 目的:利用Ion Torrent PGM深度测序技术,探讨乙型肝炎病毒e抗原(HBeAg)阳性慢性乙型肝炎(CHB)患者乙型肝炎病毒(HBV)基本核心启动子和前C区突变特征。方法收集HBeAg阳性CHB患者血清样本25例,提取HBV DNA...
【中文期刊】 宋鑫 张艳宇 等 《军事医学》 2016年40卷4期 311-315页 ISTICCSCDCA
【摘要】 目的:探索潜伏感染状态下人巨细胞病毒(HCMV)所编码微小RNA(microRNA,miRNA),为研究其在HCMV病毒学和潜伏感染机制奠定基础。方法通过HCMV感染THP-1细胞构建HCMV潜伏感染细胞模型,采用高通量Solexa测序平台...
【中文期刊】 张樱 陈昊 等 《解放军医学院学报》 2013年6期 647-649页 ISTICCA
【摘要】 目的探讨定向转录组测序技术在铜绿假单胞菌的应用,为研究基因组的注释和表达调控提供重要手段。方法抽提菌体RNA并去除rRNA,连接接头后用特异性引物反转录成cDNA,PCR扩增后测序;所得数据采用Bowtie和rSeq软件分析。结果在所有26...
【中文期刊】 《定量生物学(英文版)》 2018年6卷4期 359-368页
【摘要】 Background:The Oxford MinION nanopore sequencer is the recently appealing third-generation genome sequencing device that...
【关键词】 nanopore sequencing; bi-directional WaveNets; base-calling;
【中文期刊】 郭清艳 钮冰 等 《食品安全质量检测学报》 2017年8卷4期 1332-1338页
【摘要】 下一代测序技术是DNA测序的一项革命性创新技术,其特点是方便快速、高效准确、信息容量大,可实现物种基因组或转录组的深入研究.现阶段,食源性致病微生物导致的全球食品安全问题不断发生,下一代测序技术可在信息缺乏或多种微生物存在的情况下对食源性致...
【中文期刊】 吴望军 陈杰 等 《畜牧兽医学报》 2013年44卷12期 1857-1866页
【摘要】 microRNA(miRNA)是一类功能强大的小RNA分子,大量的研究表明miRNA在生物的各种生命活动中发挥着重要的作用.本文首先对miRNA的发现、生成与作用机制进行了简单的阐述,并对测序技术的发展历史与新一代测序技术的出现进行了回顾;...
【中文期刊】 苏秀秀 龙法宁 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷2期 241-249页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 深度模型在单细胞转录组测序(single-cell transcriptome sequencing,scRNA-seq)中以单细胞分辨率提取基因的特征表达,但是scRNA-seq采集过程中存在"dropout"(数据缺失)问题,造成基因表...
【中文期刊】 李怡凡 王怡 等 《生物工程学报》 2023年39卷9期 3710-3723页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 作为细胞结构与功能的中心参与者,蛋白质一直是生命科学研究的中心主题.分析蛋白质序列变异对其结构、功能的影响,是研究蛋白的重要手段之一.近年一种称为深度突变扫描(deep mutational scanning,DMS)的技术被广泛应用于蛋白...
【中文期刊】 秦碧萱 张妍春 等 《中华眼底病杂志》 2023年39卷1期 68-73页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 眼内淋巴瘤(IOL)是一种罕见的淋巴细胞恶性肿瘤,组织细胞学病理检查是诊断IOL的金标准。但由于常用的玻璃体样本中淋巴瘤细胞较少且易变性,对标本的处理及病理学专家要求较高,容易出现假阴性的结果,延误疾病的及时诊断及治疗。因此,许多辅助诊断I...
【中文期刊】 李妍妍 贾小涵 等 《中华地方病学杂志》 2023年42卷11期 868-875页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的:探究过量氟暴露对小鼠睾丸微小RNA(microRNA,miRNA)表达谱的影响,并探讨氟的生殖毒性机制。方法:24只8周龄C57BL/6J雄性小鼠,体重为(23 ± 1)g,按体重采用随机数字表法分为对照组[0 mg/L氟化钠(NaF...
【中文期刊】 《医学前沿》 2022年16卷2期 240-250页 SCIMEDLINEISTICCSCD
【摘要】 The continuing discoveries of novel classes of RNA modifications in various organisms have raised the need for improving...
【关键词】 small RNAs; 2'-O-methylation; sequencing;
【中文期刊】 王丽敏 顾燕妮 等 《中华实用儿科临床杂志》 2021年36卷21期 1636-1641页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:评估缺氧缺血(HI)自我复苏的新生SD大鼠模型外周血微小RNA(miRNA)指标。方法:3只孕鼠所产幼鼠按窝别分为3组,A组为空白对照组,B组为HI组,C组备用。采用高通量深度测序方法比较对照组和HI组新生4日龄SD大鼠外周血中miR...
【中文期刊】 高涛 刘蕾 等 《中国药学(英文版)》 2022年31卷1期 31-46页 ISTICCSCDCA
【摘要】 王氏保赤丸是一个具有180多年应用历史的中药复方.本研究利用大鼠给药模型,对王氏保赤丸的临床前安全性进行了研究.在28天的给药实验期间,对SD大鼠进行每日1次的灌胃给药,对高、中、低剂量组而言,给药剂量分别为60 mg/kg/day、600...
【中文期刊】 《遗传学报》 2012年39卷7期 351-360页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 The plant genome possesses a large number of microRNAs (miRNAs) mainly 21-24 nucleotides in length.They play a vital rol...
【中文期刊】 刘鹏鹭 苏品璨 等 《中国病原生物学杂志》 2018年13卷1期 93-95页 ISTICPKUCSCD
【摘要】 疟原虫是单细胞原生动物,目前诊断方法以显微镜检查和快速诊断实验为主,但随着分子生物学技术的不断发展,逐步建立了核酸探针技术、PCR及其衍生技术、环介导等温扩增等分子生物学技术,使疟疾诊断工作方法日益完善.通过应用分子生物学的方法,对虫种的基...
【中文期刊】 王博 田园园 等 《基因组学与应用生物学》 2017年36卷2期 603-613页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 MicroRNAs (miRNAs)是一类内源性、长度约22 nt的非编码小RNA,通过转录后调控基因的表达水平、参与生物体的生长与发育等多种生理过程.翘嘴鳜是我国淡水经济鱼类,由于长期人工繁殖忽视亲本选育,导致鳜种质退化,出现生长速度及抗...
【关键词】 翘嘴鳜; 生长; 差异microRNA;