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【中文期刊】 陈伟 罗辽复 等 《生物化学与生物物理进展》 2009年36卷8期 1035-1040页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 根据核小体定位序列和缺失序列的碱基分布特征,应用多样性增量二次判别方法(IDQD)构建模犁对这两类序列进行了区分,受试者操作特性曲线下的面积达到了0.958.应用这一模型研究了核小体在人类基因组剪接位点(GT/AG)邻近序列中的分布方式,发...
【关键词】 多样性增量二次判别方法；核小体定位；剪接位点；
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【中文期刊】 张利绒 罗辽复 等 《生物化学与生物物理进展》 2008年35卷10期 1188-1194页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 根据剪接位点的核酸序列保守特征,以及邻近位点的碱基组成和关联特性,结合一对可变剪接位点之问的距离参数和受体端剪接位点前30位碱基的GC和TC含量,利用结合多样性指标的二次判别方法(IDQD),预测了人类基因组中可变和组成性内含子的供体端和受...
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【中文期刊】 张利绒 罗辽复 《生物化学与生物物理进展》 2004年31卷1期 77-82页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 根据基因剪切位点处的碱基保守性特征,和附近位点的碱基组成和关联特征,应用多样性指标和二次判别分析,对几类模式生物的基因结构进行统一的分析和预测,能够较好地识别外显子和内含子及其边界.计算结果表明,对于4类物种,线虫(C.elegans),拟...
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【中文期刊】 刘波 罗辽复 等 《生物信息学》 2008年6卷1期 3-5,11页ISTIC
【摘要】 对Alu剪接位点双碱基的类型、分布进行了分析,发现非标准剪接(不满足GT-AG规则)占很大优势.而且非标准剪接的分布频率会随不同的染色体而变化,在Alu剪接较多的11、12、17号染色体上分布最多.通过对Alu及其剪接位点碱基关联的计算分析...
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【中文期刊】 邢永强 张利绒 等 《生物物理学报》 2008年24卷5期 393-401页MEDLINEISTICCA
【摘要】 信使RNA的可变剪接是真核生物有别于原核生物的基本特征之一,信使RNA前体的可变剪接极大地丰富了高等真核生物蛋白质的多样性,并与生物体的组织特异性密切相关.文章对人类盒式外显子和内舍子保留的一些基本特征进行了统计:根据剪接位点附近的单碱基,...
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【中文期刊】 晋宏营 罗辽复 等 《生物物理学报》 2007年23卷3期 185-191页MEDLINEISTICCA
【摘要】 把最大信息原理应用到核酸序列的保守位点分析中.利用最大信息原理,推导出了核酸和蛋白质特异性结合时的结合能表达式,并且估计了和蛋白质发生相互作用的核酸序列上的位点范围.为了检验此理论是否较为成功地反映了核酸和蛋白质结合时的实际情况,把它应用到...
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【中文期刊】 周勋 张永芬 等 《基因组学与应用生物学》 2019年38卷5期 2004-2010页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 鸟类是四足类动物中最丰富的一类脊椎动物,本研究以12种鸟类的全基因组核苷酸序列数据为研究对象,建立核苷酸频数进化方程,研究了鸟类基因组核苷酸频数的进化机制和规律.通过拟合基因组数据确定了方程中的进化惯性参数、耗散参数和环境参数,估算出进化速...
- 概要：
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【中文期刊】 晋宏营 罗辽复 等 《生物物理学报》 2009年25卷1期 57-64页MEDLINEISTICCA
【摘要】 基因结构预测中的一个重要步骤是精确地识别剪接位点.基于剪接反应的基本物理原则,最大信息原理被应用到剪接反应的理论分析中,进而导出了反应自由能估计表达式.作为一个简化模型,这个表达式能被用来估计一个5'剪接区或者3'剪接区所参与的剪接反应中的...
- 概要：
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【会议论文】张利绒 第十一次中国生物物理学术大会暨第九届全国会员代表大会 2009年
【摘要】 <正>在人类基因组草图完成之后,人类基因组的DNA全序列及注释刷新了关于基因的概念,科学家们认为高等生物拓宽其分子水平差异并不取决基因的数目,而主要依靠对
【关键词】 盒式外显子 ；
- 概要：
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【学位论文】 作者：张利绒导师：罗辽复 内蒙古大学 物理学 理论物理（博士） 2003年
【摘要】 该文主要研究了几类模式生物,包括:大肠杆菌、酵母(Yeast和Pombe)、线虫、拟南芥、果蝇和人类的基因组.目的是寻找一种方法来区分这些模式基因组的编码区和非编码区序列,研究基因的结构以及基因外显子和内含子的识别,简单模式生物中ORF(开...
- 概要：
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【会议论文】张利绒 第九次全国生物物理大会学术会议 2002年
【摘要】 如何从核酸序列中找出编码区?如何区分外显子和内含子?如何发现可能存在的隐蔽的阅读框架?这些问题都和子序列依赖的核苷酸频率和核苷酸关联有关.由偏好模分析法和关联函数谱分析法,都表明外显子中存在三重读码框架,而内含子及其他非编码区中,一般不存在...
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