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【中文期刊】 于欣萍 王诗尧 等 《中华中医药学刊》 2025年43卷4期 82-89,后插22-后插26页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于生物信息学探究肝癌发生发展的潜在分子机制,筛选并验证鳖甲煎丸对肝癌起调控作用的机制和靶点.方法 下载GEO数据库中的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)单细胞数据,处理后进行通讯分析、富集与代谢分析...
【关键词】 肝癌；鳖甲煎丸；scRNA-seq分析；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 纵浩男 刘文斌 等 《中国药物化学杂志》 2025年35卷4期 257-263页ISTICCA
【摘要】 目的 对铁死亡抑制蛋白1(FSP1)抑制剂FSEN3的合成路线和结合模式进行探索及验证.方法 以4-甲氧基苯甲酰肼为起始原料,经亲核加成、分子内环合、溴环化、消除、Wohl-Ziegler反应以及亲核取代6步反应得到目标化合物FSEN3.采...
【关键词】 FSEN3；铁死亡抑制蛋白1抑制剂；合成路线；
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【中文期刊】 董爽 胡祖成 等 《中南药学》 2025年23卷5期 1190-1197页ISTICCA
【摘要】 目的 采用细胞膜仿生材料磷酸胆碱聚合物Poly(MPC-random-BMA)(PMB)来提高疏水性异黄酮光甘草定(GLD)的水溶性及经皮渗透性.方法 通过摇瓶法测定GLD在不同质量浓度PMB体系中的饱和溶解度,通过粒径测定、分子动力学(M...
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【中文期刊】 张瀛心 班晨宇 等 《中国食品学报》 2025年25卷3期 104-114页
【摘要】 采用分子对接技术结合体外酶活性测定技术,从200个天然活性小分子中筛选出香叶木素(Dio)、漆黄素(Fis)和金雀异黄酮(Gen)3种黄酮类化合物.采用紫外光谱、拉曼光谱和分子动力学等方法分析它们的互作机制.结果表明,Dio、Fis、Gen...
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【中文期刊】 任桂林 柯刚 等 《云南中医中药杂志》 2025年46卷8期 94-98页
【摘要】 目的 研究树枝状多孔二氧化硅颗粒(dendtritic porous silica nanoparticles,DPSN)吸附陈皮精油(VO)的分子动力学过程及吸附结构的表征.方法 采用扫描电镜(SEM)、透射电镜(TEM)、X射线粉末衍射...
【关键词】 树枝状多孔二氧化硅纳米颗粒；陈皮精油；吸附；
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【中文期刊】 武美彤 吴振起 等 《中医临床研究》 2025年17卷16期 1-8页
【摘要】 目的:基于"扶正通络"法探究黄芪、当归、桃仁、地龙四味中药治疗新型冠状病毒感染(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)的有效成分及作用机制.方法:通过生物信息学数据库获取黄芪、当归、桃仁、地龙的有效成分及靶基...
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【中文期刊】 陈星羽 贺巧 等 《湖北科技学院学报（医学版）》 2024年38卷6期 482-487页
【摘要】 目的 通过网络药理学和细胞实验探究附子对阿霉素诱导的心肌损伤的潜在机制.方法 通过TCM-SP、SWISS、Chemal和Super-ped数据库对阿霉素和附子进行活性化合物的鉴定及靶点的预测,通过Genecard数据库对心肌损伤的靶点进行...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 刘巨钊 杨玉萍 等 《生物学杂志》 2022年39卷6期 35-40页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 新冠病毒(SARS-CoV-2)出现越来越多侵染性更强的突变体,比较有代表性的毒株是B.1.351和B.1.617,它们的共同特点是在S蛋白484号位点有氨基酸突变.484号位点是一个与hACE2上的残基K31相互作用的位点.从分子动力学和...
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【中文期刊】 聂文 牛文进 等 《煤炭学报》 2023年48卷3期 1255-1266页
【摘要】 煤尘防治一直是煤矿井下亟需解决的现实难题,以喷雾技术为基础,通过添加抑尘剂实现对煤尘的有效沉降具有较好的应用前景.但制备抑尘剂的过程中,原材料表面活性剂的遴选往往以实验方式进行,存在效率较低、成本较高以及实验条件苛刻等技术难题.随着分子模拟...
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【中文期刊】 石钰 阳梦 等 《煤炭学报》 2023年48卷8期 3116-3127页
【摘要】 基于巨正则系综蒙特卡洛(GCMC)和分子动力学(MD)方法,构建了固(煤)-气(CH4)-液(表面活性剂)三相作用的体系模型,从吸附构型、吸附量、相互作用能、相对浓度分布和扩散系数等方面,探讨了纳米颗粒分别复合阳离子表面活性剂CTAB、阴离...
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【中文期刊】 陈洁 柴宝峰 等 《生物化学与生物物理进展》 2009年36卷7期 817-822页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 蛋白质生物合成过程的终止是由于第一类肽链释放因子识别终止密码子,并导致肽酰-tRNA酯键水解,释放出新合成的多肽链.近期,通过冷冻电镜、结晶学、核磁共振、分子动力学和生物化学等方面的研究,使第一类肽链释放因子的结构与功能逐渐清晰.对近期的研...
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【中文期刊】 冯健男 任蕴芳 等 《生物化学与生物物理进展》 2000年27卷4期 418-422页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 通过Delphi方法分析人白介素6(human interleukin-6,hIL-6)/人白介素6受体α亚基(human interleukin-6 receptor α subunit,hIL-6Rα)复合物、gp130(β subun...
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【中文期刊】 张彦 石秀凡 等 《生物化学与生物物理进展》 2000年27卷4期 382-386页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 利用p53蛋白质核心区晶体结构作分子动力学发现,除了生化方面的稳定性之外,该区还具有分子力学上的高度稳定性.在此基础上作的R249残基替换分子动力学研究显示,p53蛋白质核心区249位点精氨酸被其他残基替换后能引起p53蛋白质核心区L2、L...
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【中文期刊】 徐亦奇 吴彦霖 等 《中国新药杂志》 2018年27卷21期 2564-2571页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:利用分子动力学(molecular dynamic,MD)模拟方法研究三氯叔丁醇对缩宫素在水溶液中分布行为的影响.方法:以Schrsdinger软件构建不同数量缩宫素和三氯叔丁醇与7 500个水分子的5个体系,以AMBERTOOL12...
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【中文期刊】 蔡棣 田浤 等 《中国药科大学学报》 2017年48卷2期 227-232页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 建立含有L-对硝基苯丙氨酸(p-nitro-L-phenylalanine,pNO2Phe)蛋白的分子动力学模拟方法,分析了含有pNO2Phe的蛋白具有免疫原性的构效关系,为其他含有非天然氨基酸蛋白的动力学模拟研究提供参考.使用CGenFF...
【关键词】 纳米分子动力学(NAMD)；可视化分子动力学(VMD)；分子动力学模似；
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【中文期刊】 马小丽 武朝阳 等 《中国临床药理学杂志》 2025年41卷15期 2195-2200页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 采用网络药理学和分子对接的方法探讨八味柴芍合剂治疗胃食管反流病(GERD)的作用机制,为八味柴芍合剂的临床应用提供依据.方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获得八味柴芍合剂的化学成分及其相关作用靶点,通过UniPro...
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【中文期刊】 曹立波 傅啸龙 等 《中国生物医学工程学报》 2015年34卷5期 574-580页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 利用具有高度解剖学细节的GHBMC有限元头部模型,建立符合患者头部在受到创伤后出现脑血肿的占位效应,并提出一种采用气体分子动力学颗粒法模拟颅脑血肿导致颅内压变化的新思路.通过医学图像软件Mimics得到患者头部血肿几何模型与病变位置,调整已...
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【中文期刊】 李佳 郑清川 等 《应用与环境生物学报》 2008年14卷4期 466-468页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 利用同源模建和分子动力学模拟方法搭建了烟草病程相关蛋白PR-1a的三维结构,在此基础上预测出PR.1a具有2个可能的活性位点.进一步分析PR-1家族特异保守序列,结果显示位点1的可能性更大.利用蛋白质内源荧光为探针,对分离的重组表达PR-1...
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【中文期刊】 李德昌 季葆华 等 《医用生物力学》 2007年22卷1期 40-49页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究生物分子链的自组织坍塌过程;探讨分子序列的组分、温度和链的柔性对生物分子自组织过程的影响.方法 基于粗粒化分子动力学模拟方法,研究均匀分子链和非均匀分子链的自组织坍塌过程.结果 发现链的非均匀性会使链的平衡结构产生微观网络结构,而...
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【中文期刊】 刘有平 宋乃宁 等 《中国临床药理学与治疗学》 2004年9卷8期 868-871页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:研究二氢吡啶类钙拮抗剂的化学结构与药物动力学的关系,为新药设计中早期筛选提供理论方法.方法:采用Insight Ⅱ软件的分子力学和分子动力学程序首先将钙拮抗剂的结构式转化为三维结构,并进行能量优化,使得结构趋于合理.HyperChem...
【关键词】 二氢吡啶类化合物；钙拮抗剂；分子力学和分子动力学；
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