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【中文期刊】 刘雅妮 杨静欢  等 《中国组织工程研究》 2025年29卷5期 1091-1100页 ISTICPKUCA

【摘要】 背景:纤维肌痛综合征作为常见风湿病,其发病与中枢敏化及免疫异常有关,但具体过程尚未阐明,缺乏特异性诊断标志物,不断探索该病的发病机制具有重要的临床意义.目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)等生物信息学方法和机器学习算法筛选纤维肌痛...

【关键词】 纤维肌痛综合征； 生物信息学； 机器学习；

【中文期刊】 蔡溦 朱御坤  等 《中国组织工程研究》 2025年29卷18期 3747-3757页 ISTICPKUCA

【摘要】 背景:低度慢性炎症被认为在骨关节炎的发病机制中起着核心作用,但是具体的分子机制目前仍不清楚.目的:筛选和探讨骨关节炎中的潜在枢纽基因及免疫细胞的浸润情况.方法:将来自GPL570平台的GSE206848数据集与来自GPL96平台的GSE55...

【关键词】 骨关节炎； 滑膜组织； 枢纽基因；

【中文期刊】 白雪 王启彤  等 《医学理论与实践》 2025年38卷1期 1-7,13页

【摘要】 目的:ATP结合盒(ABC)转运蛋白基因家族影响动脉粥样硬化疾病的发展,通过基因表达综合数据库(GEO)数据挖掘,研究ABC转运蛋白基因家族中与动脉粥样硬化(AS)诊断相关的基因,以探索潜在的AS标志物.方法:共纳入4个备选数据集(GSE4...

【关键词】 动脉粥样硬化； ABCB1； 基因集富集分析；

【中文期刊】 袁超 练庆海  等 《器官移植》 2024年15卷1期 90-101页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 筛选酒精性肝炎(AH)的自噬关键基因,探讨AH潜在的生物标志物和治疗靶点.方法 采用基因表达综合数据库(GEO)中的2个AH基因芯片和从MSigDB、GeneCards数据库中获得的自噬相关数据集,通过加权基因共表达网络分析(WGCN...

【关键词】 酒精性肝炎； 自噬； 关键基因；

【中文期刊】 黄一铭 王爱民  等 《中南大学学报（医学版）》 2024年49卷2期 207-219页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:在帕金森病的发病过程中,免疫系统的异常激活和炎症反应起着重要作用.然而,目前对于免疫相关关键基因在帕金森病发生和发展中的具体作用和作用机制的了解仍然有限.本研究旨在通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expr...

【关键词】 加权基因共表达网络分析； 机器学习； 帕金森病；

【中文期刊】 李文茜 田亮玉  等 《中药新药与临床药理》 2024年35卷9期 1306-1318页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 探讨骨坏死康复丸治疗激素性股骨头坏死(Steroid-induced osteonecrosis of the femoral head,SONFH)的主要药理学基础和作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditi...

【关键词】 激素性股骨头坏死； 骨坏死康复丸； 网络药理学；

【中文期刊】 陈超 陈天翔  等 《中国全科医学》 2024年27卷32期 4050-4059页 ISTICPKUCA

【摘要】 背景 肝细胞癌(HCC)是全球常见的癌症相关死亡的第三大原因,约占所有原发性肝癌病例的90%,其复发率和死亡率较高,目前发生的分子机制仍不清楚.目的 探索HCC潜在的分子机制,发掘新的生物标志物.方法 从TCGA数据库下载RNA-seq表达...

【关键词】 癌,肝细胞； 加权基因共表达网络分析； Hub基因；

【中文期刊】 庞雪  《安徽医科大学学报》 2024年59卷11期 1958-1966页 ISTICPKUCA

【摘要】 目的 利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)、机器学习算法、免疫浸润分析和动物实验筛选肛瘘(AF)潜在的生物标志物.方法 下载基因表达数据库中包含AF和瘘管旁组织(PF)的转录组数据进行差异分析,对差异表达基因(DEGs)进行基因本体(G...

【关键词】 肛瘘； 加权基因共表达网络分析； 机器学习；

【中文期刊】 张丽娜 姜晓琳  等 《中华中医药学刊》 2024年42卷6期 179-182,后插28-后插31页 ISTICPKUCA

【摘要】 目的 采用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)方法识别肥胖型多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)的关键基因,...

【关键词】 多囊卵巢综合征； 加权基因共表达网络； 差异表达基因；

【中文期刊】 姚瑞倩 喻东  等 《海军军医大学学报》 2024年45卷12期 1529-1539页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 通过生物信息学分析和机器学习模型挖掘公共数据库中的有效信息,识别子痫前期相关的候选基因,以提高子痫前期早期诊断的准确性并为发病机制和诊疗研究提供靶点.方法 从基因表达综合数据库中检索子痫前期患者和正常孕妇胎盘组织样本的RNA-seq数...

【关键词】 子痫前期； 生物标志物； 加权基因共表达网络分析；

【中文期刊】 刘景文 马秋玲  等 《世界中医药》 2024年19卷17期 2562-2571页 ISTICPKUCA

【摘要】 目的:探究中医药治疗急性淋巴细胞白血病(ALL)的作用机制,并用实验验证.方法:收集中医药治疗ALL文献的药物组成;利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、通用蛋白质(UniProt)数据库收集高频中药的成分及靶点,基因表达综合系...

【关键词】 急性淋巴细胞白血病； 中医药； 有效成分；

【中文期刊】 徐学功 刘燕  等 《中药新药与临床药理》 2024年35卷12期 1816-1826页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 基于转录组学与加权基因共表达网络分析(WGCNA)探讨降脂轻身胶囊介导NF-κB/NLRP3/Caspase-1信号轴改善高脂血症的作用机制.方法 将40只C57BL/6小鼠随机分为对照组、模型组、瑞舒伐他汀组(1.3 mg·kg-1...

【关键词】 降脂轻身胶囊； 高脂血症； 转录组学；

【中文期刊】 王玉涛 孙岩  《山东大学学报（医学版）》 2024年62卷11期 40-53页 ISTICPKUCA

【摘要】 目的 利用单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA)数据分析、加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)、机器学习...

【关键词】 腹主动脉瘤； 加权基因共表达网络分析； 机器学习；

【中文期刊】 靳琪鹏 王肖龙  《中成药》 2024年46卷10期 3483-3491页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 探究葛兰心宁胶囊治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病(CAD)可能调控的关键靶点基因.方法 HPLC法对入血成分进行鉴定,同时借助GSE20680数据集,基于P<0.05标准,筛选出15549个差异表达基因.利用加权基因共表达网络分析,鉴定与...

【关键词】 葛兰心宁胶囊； 冠心病； 血清药物化学；

【中文期刊】 柯益忠 石磊  《现代肿瘤医学》 2024年15期 2776-2782页 ISTICCA

【摘要】 目的:基于加权基因共表达网络筛选PD-L1阴性非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者的潜在免疫治疗靶点并筛选相应小分子药物提高免疫应答效率.方法:分别从TGCA数据库筛选出1 037例NSCLC...

【关键词】 非小细胞肺癌； PD-L1； 风险比例回归模型；

【中文期刊】 侯洁欣 戴吉  等 《中国血液流变学杂志》 2024年34卷2期 202-207页 ISTICCA

【摘要】 目的 通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定与病毒性脓毒症儿童患者相关的关键基因.方法 使用GSE119217数据集进行差异表达基因(DEGs)分析,筛选病毒性脓毒症儿童患者相关的DEGs.采用WGCNA筛选与脓毒症临床特征相关性最高...

【关键词】 病毒性脓毒症； 加权基因共表达网络； 差异分析；

【中文期刊】 方柔柔 杨启帆  等 《实用心脑肺血管病杂志》 2024年32卷3期 62-69,76页 ISTIC

【摘要】 目的 基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选动脉粥样硬化(AS)中铁死亡核心基因,并分析其与免疫浸润细胞的关系.方法 从基因表达综合(GEO)数据库下载AS转录组数据集GSE100927[筛选出颈动脉样本41个,包含12个健康对照者的...

【关键词】 动脉粥样硬化； 加权基因共表达网络分析； 铁死亡；

【中文期刊】 张桢淳 李永唯  等 《中国动脉硬化杂志》 2024年32卷4期 310-318页 ISTICCA

【摘要】 [目的]从空间与基因共表达网络的角度揭示跨种属的缺血性心力衰竭机制.[方法]从美国国立生物技术信息中心基因表达数据库(NCBI-GEO)中检索获得GSE210374和GSE57338高通量测序数据,利用R语言软件程序包分析筛选在心肌梗死大鼠...

【关键词】 心肌梗死； 心功能衰竭； 生物信息学；

【中文期刊】 唐昕燃 陈顺德  等 《中医药导报》 2024年30卷6期 133-140,166页 ISTIC

【摘要】 目的:利用机器学习分析铁死亡基因与多囊卵巢综合征(PCOS)的相关性,构建诊断及预后风险模型,探讨PCOS的潜在铁死亡机制,并预测相关中药.方法:多芯片标准化合并GEO数据库的卵巢组织芯片,采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)算法筛选与...

【关键词】 多囊卵巢综合征； 铁死亡； 加权基因共表达网络分析；

【中文期刊】 张冠 杨登科  《联勤军事医学》 2024年38卷11期 966-970页 ISTIC

【摘要】 目的 研究肾结石的关键差异基因、信号通路及蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,从而寻找潜在的诊疗靶点,为难治性、复发性、遗传高风险性结石提供新的诊疗思路.方法 基于生物信息学方法和R...

【关键词】 肾结石； 生物信息学分析； 差异基因；