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【中文期刊】 刘雅妮 杨静欢 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷5期 1091-1100页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:纤维肌痛综合征作为常见风湿病,其发病与中枢敏化及免疫异常有关,但具体过程尚未阐明,缺乏特异性诊断标志物,不断探索该病的发病机制具有重要的临床意义.目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)等生物信息学方法和机器学习算法筛选纤维肌痛...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 韩杰 潘成镇 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷35期 7690-7700页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:激素性股骨头坏死的发病机制尚未完全明确,深入了解激素性股骨头坏死的病理及分子机制,寻找高特异性和高灵敏性诊断标志物对于防治激素性股骨头坏死至关重要.目的:筛选激素性股骨头坏死的免疫诊断标志物,并通过药物富集分析和分子对接技术预测潜在药...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 蔡溦 朱御坤 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷18期 3747-3757页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:低度慢性炎症被认为在骨关节炎的发病机制中起着核心作用,但是具体的分子机制目前仍不清楚.目的:筛选和探讨骨关节炎中的潜在枢纽基因及免疫细胞的浸润情况.方法:将来自GPL570平台的GSE206848数据集与来自GPL96平台的GSE55...
- 概要：
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【中文期刊】 周未来 李俊 等 《中国免疫学杂志》 2025年41卷2期 287-294页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:利用生物信息学方法寻找与哮喘发病相关的关键基因并讨论其分子机制.方法:对GSE143303芯片数据进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),筛选出与哮喘发病显著相关的模块,并对模块基因进行蛋白质相互作用(PPI)网络分析、功能及通路富...
【关键词】 支气管哮喘；支气管镜管腔内活检；加权基因共表达网络分析；
- 概要：
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【中文期刊】 杜亚楠 王艺璇 等 《现代肿瘤医学》 2025年33卷4期 557-566页ISTICCA
【摘要】 目的:为肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者开发一种新的免疫原性细胞死亡相关特征(immunogenic cell death related signatures,ICDRS)预后模型.方法:分别从 T...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 桑珍珍 冯顺易 等 《安徽医药》 2025年29卷5期 940-944,后插2-后插4页ISTICCA
【摘要】 目的 旨在识别急性胰腺炎相关脓毒症的关键基因.方法 2023年3―9月从GEO数据库下载基因数据集.采用WGCNA确定急性胰腺炎和脓毒症的枢纽模块,并将两个模块交叉以确定与急性胰腺炎相关脓毒症有关的共同基因.采用R软件筛选出急性胰腺炎和脓毒...
- 概要：
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【中文期刊】 张伟国 陆秀宏 等 《中国医学物理学杂志》 2025年42卷1期 112-121页ISTICCSCD
【摘要】 目的:通过整合DNA甲基组数据和转录组数据构建基于增强子的非小细胞肺癌预后风险模型.方法:使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)从甲基化差异位点的增强子中识别非小细胞肺癌相关基因.并基于转录组数据通过LASSO-Cox回归算法构建并验证预...
- 概要：
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【中文期刊】 杨锦明 李玉生 等 《天津中医药大学学报》 2025年44卷3期 208-215页ISTICCA
【摘要】 [目的]研究旨在鉴定骨关节炎(OA)中的自噬相关基因,并筛选其靶向中药成分.[方法]从基因表达综合数据库下载微阵列数据集GSE55235和GSE55457进行分析.分别筛选OA样本和健康对照样本之间的差异表达基因.然后分别对GSE55235...
【关键词】 骨关节炎；自噬相关基因；加权基因共表达网络分析；
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- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 郭峰 王晨宇 等 《现代泌尿外科杂志》 2025年30卷3期 215-222页ISTICCA
【摘要】 目的 采用生物信息学分析筛选与肾透明细胞癌(KIRC)发生密切相关的分子生物标志物,并验证其在临床样本中的表达水平.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取KIRCⅠ期 mRNA测序数据,用主成分分析(PCA)降维处理,筛选差异表达基因...
- 概要：
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【中文期刊】 王书恒 刘薇薇 等 《医学研究杂志》 2025年54卷3期 54-61,89页ISTIC
【摘要】 目的 膀胱癌(bladder cancer,BLCA)是常见的疾病,其发病机制不清楚,本研究旨在发现膀胱癌的关键基因,为今后的预防和治疗提供依据.方法 从美国生物技术信息中心NCBI的GEO(Gene Expression Omnibus)...
【关键词】 膀胱癌；生物信息学；加权基因共表达网络分析；
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【中文期刊】 白雪 王启彤 等 《医学理论与实践》 2025年38卷1期 1-7,13页
【摘要】 目的:ATP结合盒(ABC)转运蛋白基因家族影响动脉粥样硬化疾病的发展,通过基因表达综合数据库(GEO)数据挖掘,研究ABC转运蛋白基因家族中与动脉粥样硬化(AS)诊断相关的基因,以探索潜在的AS标志物.方法:共纳入4个备选数据集(GSE4...
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【中文期刊】 张舟 黄碧 等 《岭南现代临床外科》 2025年25卷1期 12-18页
【摘要】 目的 本研究旨在通过比较不完全射频消融(IRFA)处理肝细胞癌(HCC)患者与HCC的基因表达谱,识别与IRFA处理HCC相关的差异表达基因,并提供潜在治疗靶点.方法 从GEO数据库中下载GSE212604数据集,根据是否接受IRFA治疗分...
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【中文期刊】 袁超 练庆海 等 《器官移植》 2024年15卷1期 90-101页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 筛选酒精性肝炎(AH)的自噬关键基因,探讨AH潜在的生物标志物和治疗靶点.方法 采用基因表达综合数据库(GEO)中的2个AH基因芯片和从MSigDB、GeneCards数据库中获得的自噬相关数据集,通过加权基因共表达网络分析(WGCN...
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【中文期刊】 李文茜 田亮玉 等 《中药新药与临床药理》 2024年35卷9期 1306-1318页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨骨坏死康复丸治疗激素性股骨头坏死(Steroid-induced osteonecrosis of the femoral head,SONFH)的主要药理学基础和作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditi...
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【中文期刊】 陈超 陈天翔 等 《中国全科医学》 2024年27卷32期 4050-4059页ISTICPKUCA
【摘要】 背景 肝细胞癌(HCC)是全球常见的癌症相关死亡的第三大原因,约占所有原发性肝癌病例的90%,其复发率和死亡率较高,目前发生的分子机制仍不清楚.目的 探索HCC潜在的分子机制,发掘新的生物标志物.方法 从TCGA数据库下载RNA-seq表达...
【关键词】 癌,肝细胞；加权基因共表达网络分析；Hub基因；
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【中文期刊】 黄一铭 王爱民 等 《中南大学学报（医学版）》 2024年49卷2期 207-219页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:在帕金森病的发病过程中,免疫系统的异常激活和炎症反应起着重要作用.然而,目前对于免疫相关关键基因在帕金森病发生和发展中的具体作用和作用机制的了解仍然有限.本研究旨在通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expr...
【关键词】 加权基因共表达网络分析；机器学习；帕金森病；
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【中文期刊】 王玉涛 孙岩 《山东大学学报（医学版）》 2024年62卷11期 40-53页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 利用单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA)数据分析、加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)、机器学习...
【关键词】 腹主动脉瘤；加权基因共表达网络分析；机器学习；
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【中文期刊】 柯益忠 石磊 《现代肿瘤医学》 2024年15期 2776-2782页ISTICCA
【摘要】 目的:基于加权基因共表达网络筛选PD-L1阴性非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者的潜在免疫治疗靶点并筛选相应小分子药物提高免疫应答效率.方法:分别从TGCA数据库筛选出1 037例NSCLC...
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【中文期刊】 张冠 杨登科 《联勤军事医学》 2024年38卷11期 966-970页ISTIC
【摘要】 目的 研究肾结石的关键差异基因、信号通路及蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,从而寻找潜在的诊疗靶点,为难治性、复发性、遗传高风险性结石提供新的诊疗思路.方法 基于生物信息学方法和R...
- 概要：
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【中文期刊】 张桢淳 李永唯 等 《中国动脉硬化杂志》 2024年32卷4期 310-318页ISTICCA
【摘要】 [目的]从空间与基因共表达网络的角度揭示跨种属的缺血性心力衰竭机制.[方法]从美国国立生物技术信息中心基因表达数据库(NCBI-GEO)中检索获得GSE210374和GSE57338高通量测序数据,利用R语言软件程序包分析筛选在心肌梗死大鼠...
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