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【中文期刊】 刘雅妮 杨静欢 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷5期 1091-1100页 ISTICPKUCA
【摘要】 背景:纤维肌痛综合征作为常见风湿病,其发病与中枢敏化及免疫异常有关,但具体过程尚未阐明,缺乏特异性诊断标志物,不断探索该病的发病机制具有重要的临床意义.目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)等生物信息学方法和机器学习算法筛选纤维肌痛...
【中文期刊】 蔡溦 朱御坤 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷18期 3747-3757页 ISTICPKUCA
【摘要】 背景:低度慢性炎症被认为在骨关节炎的发病机制中起着核心作用,但是具体的分子机制目前仍不清楚.目的:筛选和探讨骨关节炎中的潜在枢纽基因及免疫细胞的浸润情况.方法:将来自GPL570平台的GSE206848数据集与来自GPL96平台的GSE55...
【中文期刊】 白雪 王启彤 等 《医学理论与实践》 2025年38卷1期 1-7,13页
【摘要】 目的:ATP结合盒(ABC)转运蛋白基因家族影响动脉粥样硬化疾病的发展,通过基因表达综合数据库(GEO)数据挖掘,研究ABC转运蛋白基因家族中与动脉粥样硬化(AS)诊断相关的基因,以探索潜在的AS标志物.方法:共纳入4个备选数据集(GSE4...
【中文期刊】 袁超 练庆海 等 《器官移植》 2024年15卷1期 90-101页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 筛选酒精性肝炎(AH)的自噬关键基因,探讨AH潜在的生物标志物和治疗靶点.方法 采用基因表达综合数据库(GEO)中的2个AH基因芯片和从MSigDB、GeneCards数据库中获得的自噬相关数据集,通过加权基因共表达网络分析(WGCN...
【中文期刊】 黄一铭 王爱民 等 《中南大学学报(医学版)》 2024年49卷2期 207-219页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:在帕金森病的发病过程中,免疫系统的异常激活和炎症反应起着重要作用.然而,目前对于免疫相关关键基因在帕金森病发生和发展中的具体作用和作用机制的了解仍然有限.本研究旨在通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expr...
【关键词】 加权基因共表达网络分析; 机器学习; 帕金森病;
【中文期刊】 李文茜 田亮玉 等 《中药新药与临床药理》 2024年35卷9期 1306-1318页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨骨坏死康复丸治疗激素性股骨头坏死(Steroid-induced osteonecrosis of the femoral head,SONFH)的主要药理学基础和作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditi...
【中文期刊】 陈超 陈天翔 等 《中国全科医学》 2024年27卷32期 4050-4059页 ISTICPKUCA
【摘要】 背景 肝细胞癌(HCC)是全球常见的癌症相关死亡的第三大原因,约占所有原发性肝癌病例的90%,其复发率和死亡率较高,目前发生的分子机制仍不清楚.目的 探索HCC潜在的分子机制,发掘新的生物标志物.方法 从TCGA数据库下载RNA-seq表达...
【关键词】 癌,肝细胞; 加权基因共表达网络分析; Hub基因;
【中文期刊】 王玉涛 孙岩 《山东大学学报(医学版)》 2024年62卷11期 40-53页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 利用单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA)数据分析、加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)、机器学习...
【关键词】 腹主动脉瘤; 加权基因共表达网络分析; 机器学习;
【中文期刊】 张桢淳 李永唯 等 《中国动脉硬化杂志》 2024年32卷4期 310-318页 ISTICCA
【摘要】 [目的]从空间与基因共表达网络的角度揭示跨种属的缺血性心力衰竭机制.[方法]从美国国立生物技术信息中心基因表达数据库(NCBI-GEO)中检索获得GSE210374和GSE57338高通量测序数据,利用R语言软件程序包分析筛选在心肌梗死大鼠...
【中文期刊】 张冠 杨登科 《联勤军事医学》 2024年38卷11期 966-970页 ISTIC
【摘要】 目的 研究肾结石的关键差异基因、信号通路及蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,从而寻找潜在的诊疗靶点,为难治性、复发性、遗传高风险性结石提供新的诊疗思路.方法 基于生物信息学方法和R...
【中文期刊】 安沛兴 马晓红 等 《疑难病杂志》 2024年23卷10期 1239-1245页 ISTICCA
【摘要】 目的 通过构建临床预测模型探究在绝经后子宫内膜癌(EC)患者中发挥关键作用的基因并进行验证,评价其在预测EC患者生存预后中的应用价值.方法 选取2022年1月—2023年10月在西北妇女儿童医院妇产科就诊的EC患者45例,通过手术获得EC患...
【中文期刊】 施露 张莲卿 等 《海军医学杂志》 2024年45卷12期 1270-1276页 ISTIC
【摘要】 目的 利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)方法联合网络药理学方法及分子对接技术探讨艾迪注射液治疗肝细胞癌的分子机制.方法 应用癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载肝细胞癌组织样本和正常肝组织样本的蛋白表达数据,将蛋白质组数据整理成表达矩...
【关键词】 艾迪注射液; 加权基因共表达网络分析; 肝癌;
【中文期刊】 修占杰 刘佳玙 等 《天津医科大学学报》 2024年30卷6期 535-542页 ISTIC
【摘要】 目的:基于强直性脊柱炎(AS)基因芯片数据,应用生物信息学分析方法识别免疫细胞亚型相关的关键基因及药物靶点预测.方法:GEO数据库下载AS基因表达数据,筛选差异表达基因(DEGs);运用R软件包进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全...
【关键词】 强直性脊柱炎; 差异表达基因; 加权基因共表达网络分析;
【中文期刊】 王昱琪 王姗姗 等 《现代中西医结合杂志》 2024年33卷10期 1356-1363页 ISTICCA
【摘要】 目的 基于蛋白质组学和复杂网络分析挖掘难治性高血压的潜在生物标志物,探索其关键生物通路.方法 招募2022 年1-12 月于山东中医药大学附属医院、济南市第五人民医院住院治疗的10 例难治性高血压患者作为高血压组,另外招募同时期10 例健康...
【中文期刊】 李威材 秦刚 等 《实用肿瘤杂志》 2024年39卷4期 344-355页 ISTICCA
【摘要】 目的 利用生物信息学方法筛选出与骨肉瘤(osteosarcoma,OS)相关的关键基因,以作为OS的潜在诊断标志物和新治疗靶点.方法 从基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中检索下载 2 个符合本研究...
【中文期刊】 汪茜 龚睿 等 《医学研究杂志》 2024年53卷1期 24-30页 ISTIC
【摘要】 目的 基于生物信息学分析影响脓毒症预后的潜在核心基因.方法 利用基因表达数据库(Gene Expression Om-nibus,GEO)筛选到脓毒症患者的基因表达数据集GSE54514和GSE65682,通过加权基因共表达网络分析(wei...
【中文期刊】 玛伊拜·木沙江 钱勇江 等 《中国动脉硬化杂志》 2024年32卷8期 669-676页 ISTICCA
【摘要】 [目的]基于血液转录组学探讨动脉粥样硬化患者血液转录组中的关键基因.[方法]从GEO数据库中选取三个数据集GSE12288、GSE27034和GSE90074,进行合并和归一化处理,分析动脉粥样硬化患者和对照者外周血样本之间的差异基因,对差...
【中文期刊】 付贺青 刘晶 等 《中西医结合心脑血管病杂志》 2024年22卷23期 4285-4292页 ISTIC
【摘要】 目的:通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)对小鼠心脏转录组测序数据进行分析,筛选与心肌肥厚发生有关的基因和细胞信号通路.方法:通过主动脉弓缩窄法(TAC)构建心肌肥厚小鼠模型,在体外水平、解剖水平和病理水平对模型进行评价.对小鼠心肌组织...
【中文期刊】 赵升 李文川 等 《新医学》 2024年55卷5期 321-327页 ISTICCA
【摘要】 目的 通过生物信息学分析,识别在糖尿病肾病(DN)进展中发挥重要作用的铁死亡相关基因,为DN的治疗提供新见解.方法 对RNA测序数据集GSE142025 进行DN差异表达基因(DEGs)的分析和筛选,并进行了基因本体论(GO)功能注释和基因...
【关键词】 糖尿病肾病; 加权基因共表达网络分析; 铁死亡;