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【学位论文】 作者：刘孝珍 导师：张磊 沈锡辉 西北农林科技大学 生物学 微生物学（博士） 2023年
【摘要】 群体感应（QuorumSensing，QS）是一种普遍存在的细胞间信号传输机制，通过响应环境中的自诱导物（Autoinducers，AIs）的浓度变化调节多基因表达，从而改善微生物群体功能使其适应复杂的环境。自诱导因子-2（Autoindu...
- 概要：
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【学位论文】 作者：钱博文 导师：郭丽 南京邮电大学 生物学 生物信息学（硕士） 2021年
【摘要】 近年来，在基因组非编码区域发现的具有肽编码能力的小开放阅读框（Smallopenreadingframes,sORFs）引起了人们的极大关注。肽编码sORFs序列短（小于100个氨基酸）、表达水平低，过去的研究认为这些短ORFs不可能编码蛋...
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【学位论文】 作者：刘青斌 导师：于家峰 山东师范大学 生物学 微生物学（硕士） 2016年
【摘要】 对原核生物基因组蛋白编码基因的预测工作已经持续了近30年。由于缺少内含子，人们一直以为原核生物基因预测相对简单，然而，越来越多的研究表明不同的基因预测算法得到的基因预测结果差别较大，造成预测结果假阳性和假阴性的不断积累，导致生物信息数据库中...
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【学位论文】 作者：计得伟 导师：张会雄 电子科技大学 生物医学工程 生物医学工程（硕士） 2016年
【摘要】 随着基因测序技术的飞速发展，我们获得的生物全基因组序列的数据是呈现爆发式增长的。对DNA序列进行分析，首先要进行基因识别的工作，传统的实验验证方法由于识别速度缓慢已经不能满足这一需求。因此，一系列相关的基因组预测工具应运而生，Prodiga...
- 概要：
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【学位论文】 作者：陈清利 导师：于家峰 曾强成 山东师范大学 生物学 微生物学（硕士） 2015年
【摘要】 随着高通量测序技术的发展，发现基因组中普遍存在重复基因现象。基因重复在导致基因数量增大的同时，也为基因突变和正向选择提供原材料，进而为生物体进化提供可能。所以，了解重复基因的生物学意义和进化机制显得尤为重要。目前，对真核基因组中的重复基因研...
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【学位论文】 作者：毕胜男 导师：于家峰 曹赞霞 山东师范大学 生物学 微生物学（硕士） 2015年
【摘要】 原核生物是一类由没有真正细胞核的细胞组成的单细胞或多细胞的低等生物，基因组大多较小，一般由一个单一的DN A分子组成，编码区在基因中所占比例很高，因此原核生物蛋白质编码基因成为原核生物基因组相关研究的重要载体。随着测序技术快速发展，基因组数...
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【会议论文】职晓阳 第四届全国微生物资源学术暨国家微生物资源平台运行服务研讨会 2012年
【摘要】 尽管莽草酸通路在生物合成和代谢研究方面一直受到广泛关注,但目前关于该通路的起源和分子进化的研究鲜有报道。为了揭示莽草酸通路相关蛋白的早期进化关系,本研究以隐马尔科夫(Hidden Markov Model)模型为基础结合新的生物信息学方法,...
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【会议论文】职晓阳 纪念中国微生物学会成立六十周年大会暨2012年中国微生物学会学术年会 2012年
【摘要】 为了揭示莽草酸通路相关蛋白的早期进化关系，以隐马尔科夫模型为基础结合新的生物信息学方法，对莽草酸通路在1294个原核生物基因组中的分布和系统发育关系进行了分析，结果发现该通路在原核生物的共同祖先还未产生细菌和古菌的分歧之前已经广泛存在，且起...
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【中文期刊】 李娜 朱力 等 《生物技术通讯》 2009年20卷5期 699-702页ISTICCA
【摘要】 在原核生物基因组中,除了tRNA、rRNA和mRNA这3种我们很熟悉的RNA以外,目前已经知道还含有许多编码非常规调控的RNA.这些RNA的长度为50-400核苷酸,通常由原核生物的基因间区编码,但并不翻译成蛋白质,因此被称为非编码小RNA...
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【中文期刊】 首都医科大学附属北京友谊医院 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 等 《中国人兽共患病学报》 2025年41卷1期 1-7页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 支原体是一类不具有细胞壁的特殊原核微生物,在自然界中广泛分布,除肺炎支原体外,包含多种危害人类健康或对动植物致病的重要病原体.支原体的分类及命名历史非常复杂,一个菌种往往有数个名称,同时因为缺乏统一的中文译名原则,一个名称又有不同的译名,显...
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【学位论文】 作者：张凯月 导师：郭锋彪 电子科技大学 生物学 生物物理学（硕士） 2020年
【摘要】 近年来，必需基因相关研究成果的迅速积累极大地推动了最小基因组的研究进程。必需基因与最小基因组作为合成生物学领域的研究热点之一，也是生物学家认识生命本质，解读遗传密码的必要手段。同时其相关研究成果极大地推动了代谢组学，发育遗传学等相关学科的发...
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【学位论文】 作者：彭也 导师：杜红丽 华南理工大学 生物学 生物化学与分子生物学（硕士） 2019年
【摘要】 在分子生物学中，常用泛基因组来?述在一个进化分支下所有基因的集合。菌种的泛基因组的基因信息通常比单一菌株更为丰富，有助于其遗传多样性的研究。传统泛基因组研究工具主要关注基因含量，忽略了基因在基因组中的上下文信息；另外，现有可视化工具通常以线...
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【中文期刊】 张德福 杨雯静 等 《食品科学》 2025年46卷3期 83-89页
【摘要】 为了研究副溶血性弧菌噬菌体vB_VpP_1裂解酶重组表达后对副溶血性弧菌的体外裂解作用,本实验根据全基因组测序及功能分析结果初步判断噬菌体vB_VpP_1的gp32基因片段为裂解酶基因,使用Expasy等工具分析了gp32的氨基酸序列组成和...
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【学位论文】 作者：张曦 导师：高峰 天津大学 生物学 生物物理（硕士） 2016年
【摘要】 原核生物包括细菌和古菌，涉及健康、医药、环境、能源等诸多领域，与人类生活休戚相关。基因组岛是原核生物中水平转移来的一簇外源基因，经研究发现这些基因与原核生物的致病、耐药、分泌、抗菌和代谢等密切相关。基于基因组岛上出现的某些序列特征或对不同物...
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【学位论文】 作者：陈丽娜 导师：王颖 厦门大学 厦门大学 系统科学 系统工程（硕士） 2015年
【摘要】
生物按照细胞类型分类有真核生物与原核生物，本文主要从真核生物与原核生物两个角度研究生物信息领域的意义所在。
随着高通量测序技术的发展，大量物种被测序并装配获得基因组序列。然而，如何快速准确地注解真核基因组的结构仍然是一个重要问题。...
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【学位论文】 作者：周慧琦 导师：张会雄 电子科技大学 生物医学工程 生物医学工程（硕士） 2014年
【摘要】 随着高通量测序技术的发展,大量的微生物基因组数据被发布在公用数据库中。这使得用比较分析法挖掘序列的规则或新的序列模式更加方便。在这些基因组的研究中,基因组GC含量对核苷酸和氨基酸组成的影响引起了特别的注意。先前的工作已经表明不同物种DN A...
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【学位论文】 作者：陈宗艳 导师：汪铭书 程安春 四川农业大学 兽医学 预防兽医学（博士） 2008年
【摘要】 本研究的创新点 1.从四川麻鸭分离到三株鸭乙型肝炎病毒(DHBV)，全基因组均含3006个核苷酸(GenBank登录号EU429324，EU429325，EU429326)，具有X-like开放阅读框特征。 2.对DHB...
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【学位论文】 作者：姬生跃 导师：曹斌云 杨明明 西北农林科技大学 西北农林科技大学 畜牧学 动物遗传育种与繁殖（硕士） 2007年
【摘要】 本文对地衣芽孢杆菌可高效转录β-半乳糖苷酶基因强启动子的克隆、鉴定进行了研究。主要内容如下： (1)筛选并直接应用了发酵液低温离心后的上清液样品与蛋白上样缓冲液以1：1比例混合的方法，再按照SDS-PAGE聚丙烯凝胶电泳规定的步骤...
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【学位论文】 作者：刘晓磊 导师：王永宏 河北工业大学 生物学 生物物理（硕士） 2007年
【摘要】 随着测序技术的飞速发展和越来越多的全基因组序列被测序完成，如何从海量的数据中提取有用的信息就变得极其重要。复制起始区域的识别是生物信息学关注的热点之一。 本论文基于在细菌复制起始点两侧碱基组分的差异，提出识别复制起始点的双组分的窗...
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