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【中文期刊】 吕俊增 曹舒淇 等 《生物信息学》 2025年23卷2期 88-95页ISTIC
【摘要】 基因组变异作为生物遗传多样性产生的核心,对解析生命演化、揭示物种内个体差异、探究疾病机制等方面有重要影响,而参考基因组作为遗传研究中的参考框架,其序列表征能力会直接影响遗传变异的准确识别.当前广泛应用的人类参考基因组主要由西方人群样本组成,...
- 概要：
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【中文期刊】 彭珊 王超 等 《广东畜牧兽医科技》 2025年50卷4期 94-104页
【摘要】 小鹅瘟是由鹅细小病毒(Goose parvovirus,GPV)引发的传染病,20日龄内雏鹅具有高致死性,而青年鹅常表现为隐性感染,易被忽视.2024年11月,广东揭阳某地养鹅场青年鹅群(56日龄)急性发病,为明确病因,针对送检的病死鹅进行...
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【中文期刊】 杨振华 《河北北方学院学报（自然科学版）》 2025年41卷1期 30-36页
【摘要】 随着高通量测序技术的发展,产生了大量全基因组序列数据.为提升非比对算法在构建全基因组序列进化关系方面的灵敏度和准确性,选择合适的k-mer模体数目十分重要.综述了 4类基于k-mer特征集的非比对计算方法:k-mer频率、k-mer间隔分布...
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【中文期刊】 齐齐 蔡青山 等 《中国防痨杂志》 2024年46卷z1期 4-8页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨宏基因二代测序技术(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)在胸内淋巴结结核中的诊断价值.方法:采用回顾性研究方法,搜集2020年12月至2023年9月浙江省中西医结合医院结核病诊疗...
- 概要：
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【中文期刊】 徐子健 江祉依 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷6期 986-996页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 DNA甲基化作为一种表观遗传修饰,在植物的生长、发育和逆境反应中发挥着至关重要的作用.全基因组重亚硫酸盐测序(whole genome bisulfite sequencing,WGBS)被认为是DNA甲基化研究的"金标准",并且广泛应用于...
- 概要：
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【中文期刊】 姚晓伟 刘树仁 等 《结核与肺部疾病杂志》 2024年5卷1期 37-43页
【摘要】 目的:评估二代测序技术(next generation sequencing,NGS)在骨关节结核诊断中的应用价值.方法:采用回顾性研究方法,参照入组标准收集2019年12月至2022年12月河北省胸科医院骨科收治的185例疑似骨关节结核患...
- 概要：
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【中文期刊】 张锦程 白和平 等 《中国兽医杂志》 2024年60卷6期 64-69页
【摘要】 为了确定肉牛场犊牛患呼吸道疾病死亡的致病原,本试验采集河北省秦皇岛地区5个肉牛养殖场病牛的肺脏组织进行病原的分离培养,采用染色镜检、培养特性观察、支原体特异性oppD/F基因鉴定、16S rRNA序列比对和同源性分析鉴定分离菌株,并通过药敏...
【关键词】 牛支原体；瑞氏染色；16S rRNA序列比对；
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【中文期刊】 黄琼林 谭靖怡 等 《福建农林大学学报（自然科学版）》 2024年53卷3期 323-331页
【摘要】 [目的]阐明药食两用植物五指毛桃的叶绿体基因组结构及其系统进化关系,为其资源利用和产品开发等研究提供基因组信息.[方法]采用高通量测序技术对五指毛桃叶绿体基因组测序,并借助生物信息工具和软件进行序列拼接、注释、比对和系统进化分析.[结果]五...
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【中文期刊】 张胜亮 《医学理论与实践》 2024年37卷13期 2280-2282页
【摘要】 目的:对比分析突变扩增阻滞系统法(ARMS)及Sanger测序法对结肠癌患者KRAS基因突变的检测效果.方法:收集2019 年3 月—2023 年4 月医院收诊的98 例结肠癌手术患者,并对其手术切除病理标本中KRAS基因突变情况进行探究,...
【关键词】 ARMS法检测；Sanger测序法检测；结肠癌；
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【中文期刊】 吴民华 陈依虹 等 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 2024年50卷2期 42-49页
【摘要】 为了探明岭南地区特色中药三桠苦的叶绿体基因组结构和序列特征,以三桠苦叶片为材料,采用试剂盒法提取DNA和构建测序文库,利用Novaseq平台进行高通量测序,再结合生物信息学手段进行序列拼接、注释和特征分析.结果显示:三桠苦叶绿体基因组为 1...
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【中文期刊】 姚黎明 姚晓伟 等 《中国防痨杂志》 2023年45卷3期 292-296页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:评价宏基因组二代测序(metagenomic next generation sequencing,mNGS)技术对髋/膝关节结核的诊断价值.方法:采用回顾性研究方法,收集2019年6月至2021年6月河北省胸科医院收治的34例髋/膝...
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【中文期刊】 王雅娟 曹新益 等 《中国防痨杂志》 2022年44卷12期 1327-1337页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:通过Meta分析比较宏基因组二代测序技术(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)和GeneXpert MTB/RIF(简称"Xpert")对结核病的诊断效能.方法:系统检索PubMed...
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【中文期刊】 李娜 陈淑莲 等 《福建农林大学学报（自然科学版）》 2023年52卷2期 222-231页
【摘要】 近日,在福建省南平市某鸡场发现一株新的鸡传染性法氏囊病毒(IBDV)流行株,并将其命名为IBDV-FJ02.为了明晰IBDV-FJ02 株遗传变异情况和临床致病特征,进行了A节段基因组序列和特征性氨基酸位点的分析、基于A节段和B节段的新型基...
【关键词】 鸡传染性法氏囊病病毒；序列比对；新型基因型分类；
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【中文期刊】 崔佳 温炟 等 《长治医学院学报》 2022年36卷3期 161-165,171页
【摘要】 目的:克隆斑马鱼多配体聚糖(SDC)4基因并分析其遗传进化关系,为探究斑马鱼SDC4基因的功能奠定分子生物学基础.方法:将分子克隆得到的斑马鱼SDC4基因全长cDNA利用Gibson组装方法构建至pCS2+载体并对其进行序列分析;利用qRT...
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【中文期刊】 晁哲 邢漫萍 等 《养猪》 2022年3期 61-63页
【摘要】 为了研究五指山猪VRTN基因,获得基因序列并分析基因结构和相关遗传变异.试验利用PCR扩增猪VRTN基因序列,通过DNA测序寻找该基因中的碱基突变位点.结果显示,在五指山猪VRTN基因第2外显子中共发现10处碱基突变,其中3个错义突变、6个...
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【中文期刊】 王桂梅 王世伟 等 《中国药房》 2018年29卷1期 77-80页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:考察利用细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ (COⅠ)基因对羚羊角及其混伪品进行分子鉴定的可行性.方法:收集4个地区的羊角类整角、不完整角样品,共7个.比较样品骨塞部位和角质层部位DNA的提取效果,采用聚合酶链式反应(PCR)技术,以通用引物LC...
【关键词】 细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因；羚羊角；混伪品；
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【中文期刊】 王雅慧 王永鑫 等 《西北植物学报》 2017年37卷12期 2363-2369页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 GRNINTERACTING FACTOR (GIF)基因是植物叶发育相关的一类重要调控因子,调节植物叶器官的发育.该研究采用RT-PCR方法从茶树‘龙井43’的叶片cDNA中克隆得到CsGIF1基因,并利用荧光定量PCR分析了高温(38℃...
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【中文期刊】 杨阳 刘媛媛 《河南农业科学》 2021年50卷7期 125-135页
【摘要】 为了解苹果漆酶(MdLAC)基因家族的功能和系统进化关系,利用生物信息学方法对苹果MdLAC基因家族成员进行鉴定,同时分析其家族成员的理化性质、系统进化关系、基因结构、保守结构、氨基酸序列和染色体定位.结果 显示,在苹果中共鉴定到77个Md...
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【中文期刊】 李佳珣 张秋香 等 《现代食品科技》 2021年37卷11期 43-49,33页
【摘要】 为评估乳杆菌表层蛋白对菌株特性的影响,该研究通过序列比对筛选出含slp基因的乳杆菌,之后用十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)对其中部分菌的slp基因表达情况进行鉴定,并测定了表层蛋白去除前后菌体生长的吸光度值、自聚集率、...
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