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【中文期刊】 张以星 王争光 等 《基因组学与应用生物学》 2025年44卷1期 1-10页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 随着高通量测序技术的快速发展,越来越多物种的基因组组装、注释,以及比较基因组学研究得到开展.尽管已有各类工具可以分别处理这些步骤,但用户对能够整合这些不同工具的解决方案的需求日益增加.在此,本文介绍了JCVI库,这是一个功能多样的基于Pyt...
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【中文期刊】 马丹 张亚娟 等 《昆明医科大学学报》 2025年46卷2期 141-150页ISTICCA
【摘要】 目的 利用公共数据库中的数据探索衰老与骨质疏松的共同靶基因,筛选有潜在治疗作用的小分子化合物.方法 从公共基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载骨质疏松数据集GSE56814 和GSE56815 并合...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 赵娜 杨晨 等 《贵州医科大学学报》 2025年50卷9期 1285-1290,1311页ISTIC
【摘要】 目的 测定兴义维蚋和五条蚋基因组大小,并估计其杂合度及重复序列.方法 采用流式细胞术测定贵州广布的两种蚋兴义维蚋和五条蚋的基因组大小,并用基因组概貌调查(genome survey)方法估计兴义维蚋基因组的杂合度和重复序列占比.结果 兴义维...
- 概要：
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【中文期刊】 曾云婷 陈海云 等 《安徽医科大学学报》 2024年59卷2期 336-343页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 了解海南省2020-2022年诺如病毒暴疫情分子流行特征及诺如病毒流行株基因组进化情况.方法 收集2020年1月至2022年12月诺如病毒暴发信息及标本,应用实时荧光反转录聚合酶链式反应对样本进行诺如病毒检测,阳性样本通过RT-PCR...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 石潆含 王秀丽 等 《解放军医学院学报》 2024年45卷2期 169-176页ISTICCA
【摘要】 背景 碳青霉烯耐药的高毒力肺炎克雷伯菌感染发生率逐年增加,临床治疗困难,死亡率高.使用具有高裂解能力的噬菌体治疗细菌感染是颇具前景的治疗方法.目的 针对碳青霉烯耐药高毒力肺炎克雷伯菌分离一株新型裂解性T7噬菌体,对该分离株进行生物学特性测定...
【关键词】 碳青霉烯耐药高毒力肺炎克雷伯菌；噬菌体治疗；大蜡螟；
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【中文期刊】 张静雯 田桂铭 等 《中国食品学报》 2024年24卷3期 221-230页
【摘要】 目的:探究副干酪乳酪杆菌PC-01经高密度发酵后,不同表型菌落的基因组差异.方法:采用第2代测序技术,对高密度发酵的10株具有不同表型特征的副干酪乳酪杆菌PC-01分离株进行全基因组测序,通过比较基因组学方法揭示这10株分离株之间的差异.结...
【关键词】 副干酪乳酪杆菌PC-01；菌落；表型；
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【中文期刊】 王慧 明德松 等 《华侨大学学报（自然科学版）》 2024年45卷1期 35-46页
【摘要】 从1名尿路感染患者中分离出了 1株多药耐药的Comamonas kerstersii(C.kerstersii)菌株121606,对其进行了抗微生物药敏试验(AST)和全基因组测序;然后将其与7个具有代表性的Comamonas菌株和Acid...
【关键词】 Comamonas kerstersii；多药耐药性；比较基因组分析；
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【中文期刊】 施晓静 程子丹 等 《广西植物》 2023年43卷10期 1892-1906页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为探究云南伤科用毒性药材黄草乌(Radix Aconitum Vilmoriniani)栽培品质量的影响因素,该研究利用Illumina HiSeq 4000高通量测序平台对来自10个不同栽培基地黄草乌样品的叶绿体基因组展开测序,经过对测序...
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【中文期刊】 李德豪 李宜穗 等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷4期 1632-1640页
【摘要】 泛耐药菌和多重耐药菌的检出率不断上升,噬菌体在防控治疗耐药菌的传播和感染上有良好的应用前景.本研究旨在利用耐药菌株分离出宽裂解谱温和噬菌体,丰富了沙门菌温和噬菌体库.利用丝裂霉素C诱导、分离纯化出1株温和性噬菌体,命名为Salmonella...
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【中文期刊】 岑鑫 阳亭亭 等 《畜牧兽医学报》 2022年53卷8期 2677-2688页
【摘要】 旨在为研制沙门菌特异性抗菌制剂提供试验数据和参考,以禽源沙门菌为宿主菌,从鸡场污水中分离纯化沙门菌噬菌体,并对其生物学特性和基因组学进行研究.结果显示:分离到1株沙门菌烈性噬菌体S5,透射电镜下该噬菌体头部直径约50 nm,尾部长约200 ...
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【中文期刊】 王茜月 管飘萍 等 《江苏农业科学》 2022年50卷12期 42-50页
【摘要】 从池塘中分离、纯化了1株具有极强溶血活性的革兰氏阴性杆菌BB2,在TSA培养基上菌落呈灰色、半透明圆形,经16S rRNA基因序列分析确定为色杆菌属,但无法确定到种;进一步全基因组测序结果表明,该菌株与GenBank中唯一的1株稻根色杆菌基...
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【中文期刊】 刘永鑫 秦媛 等 《遗传》 2019年41卷9期 845-862页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 高通量测序技术的发展衍生出一系列微生物组(microbiome)研究技术,如扩增子、宏基因组、宏转录组等,快速推动了微生物组领域的发展.微生物组数据分析涉及的基础知识、软件和数据库较多,对于同领域研究者开展学习和选择合适的分析方法具有一定困...
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【中文期刊】 梁承志 《遗传》 2019年41卷9期 875-882页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 高通量技术的广泛应用使得各类组学数据的产出速度越来越快,由此产生的海量数据蕴藏着大量的基因组变异和相关功能信息.如何对这些数据进行深度整合和利用将会是一个长期而艰巨的任务,这需要具备高效的数据存储、分析和挖掘的能力.在过去几年中,本课题组通...
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【中文期刊】 宋晟 张海韵 等 《生命科学研究》 2021年25卷3期 268-275页ISTICCA
【摘要】 为研究生鲜鸡肉中沙门氏菌的基因组信息,了解其耐药机制与致病机制,从新鲜鸡肉中分离出一株沙门氏菌FC10727,采用Illumina HiSeq 4000和PacBio对其进行全基因组测序与生物信息学分析.结果表明,FC10727基因组大小为...
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【中文期刊】 刘大钧 《植物学报》 2002年44卷9期 1096-1104页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 系统总结了南京农业大学细胞遗传研究所近20多年来利用基因组分析方法培育从簇毛麦(Haynaldia villosa Sch.)、大赖草(Leymus racemosus Lam.)、鹅观草(Roegneria kamoji C. Koch)...
- 概要：
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【中文期刊】 许磊 陈文 等 《遗传》 2017年39卷8期 737-752页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 谷胱甘肽转移酶(glutathione-S-transferase,GST)是一种普遍存在的具有多功能的超家族蛋白,在植物初次生代谢、逆境胁迫、胞间信号传递等方面具有重要作用;同时,作为配体其在植物激素代谢以及物质转运方面也发挥作用.为了解...
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【中文期刊】 周彦 王超杰 等 《遗传》 2017年39卷8期 753-762页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 从单细胞尺度进行细胞异质性的分析是深度理解细胞群体关系的关键.组织中的单细胞由于细胞类型不同,尺寸往往相差很大,但是目前常用的基于微孔板和Fluidigm公司的微流控的单细胞组学研究方法,需要入口的单细胞大小相近.本研究以胃组织为例,建立了...
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【中文期刊】 罗盛青 管鑫 等 《中国生物工程杂志》 2025年45卷8期 34-44页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)在工业发酵时面临的噬菌体污染是行业难题.以饲料中常用的枯草芽孢杆菌K28为宿主分离得到一株裂解性噬菌体PJNB028,对其进行了生物学特性测定、全基因组注释和系统进化分析和抗性菌筛选.PJN...
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【中文期刊】 常欣欣 李可鑫 等 《中国生物工程杂志》 2025年45卷5期 27-39页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:从饲养牛的粪便中分离鉴定大肠杆菌及相应的噬菌体.方法:利用麦康凯培养基分离大肠杆菌,微量肉汤稀释法分析细菌的耐药性,双层平板法分离鉴定噬菌体,点板(spotting)法分析噬菌体的宿主范围,分析不同环境中噬菌体的稳定性,通过分析基因组...
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【中文期刊】 倪亚娟 周乐 等 《疾病监测》 2025年40卷8期 1049-1056页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 了解2016-2024年江苏省扬州市临床高毒高耐药肺炎克雷伯菌(MDR-hvKP)的耐药、毒力等病原学特征.方法 收集2016-2024年江苏省扬州市6家医院临床分离获得的肺炎克雷伯菌,根据微量肉汤稀释法和全基因组测序结果识别MDR-...
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