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【中文期刊】 刘钊 刘睿 等 《精准医学杂志》 2025年40卷1期 60-64页
【摘要】 目的 筛选和鉴定胃癌预后相关的关键基因和通路,探讨胃癌发生发展的机制.方法 从基因表达数据库中下载胃癌基因表达谱芯片数据集(GSE2685、GSE29272),通过在线分析工具GEO2R对胃癌组织和正常组织中的差异表达基因(DEGs)进行筛...
- 概要:
- 方法:
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【中文期刊】 郭妮 贾亚春 等 《西安交通大学学报(医学版)》 2024年45卷2期 244-249页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究视神经病变诱导反应蛋白(optineurin,OPTN)基因在多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)中的表达情况,探讨OPTN基因参与MM发生发展的机制和临床价值.方法 利用3个基因表达数据库(gene expre...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 马玉玉 张丽 等 《新疆医科大学学报》 2024年47卷3期 301-307页ISTICCA
【摘要】 目的 通过生物信息学分析鉴定肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)与动脉粥样硬化(Atherosclerosis,AS)的共表达基因.方法 下载基因表达数据库(Gene expression om-nibus,...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 曲艳平 贺文廷 等 《大医生》 2024年9卷5期 41-43页
【摘要】 目的 基于高通量基因表达(GEO)数据库及生物信息学筛选坐骨神经痛相关差异表达基因(DEGs),分析其生物学功能,为临床治疗坐骨神经痛提供参考.方法 通过GEO数据库获取坐骨神经痛基因芯片(GSE124272)数据集,经仙桃学术软件异质性分...
【关键词】 高通量基因表达数据库;生物信息学;坐骨神经痛;
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 陈广芳 文昌晖 《西部中医药》 2023年36卷9期 25-34页ISTIC
【摘要】 目的:通过基因表达数据库(GEO)芯片分析及分子对接方法探讨槲皮素对银屑病外周血中性粒细胞弹性蛋白酶(neutrophil elastase,NE)的分子机制.方法:从公共GEO下载GSE106087芯片数据,筛选差异靶点基因;收集中药系统...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 陈慧 陈光辉 等 《检验医学》 2023年38卷3期 276-281页ISTICCA
【摘要】 目的 应用生物信息学方法筛选妊娠糖尿病(GDM)关键基因,并探讨其诊断价值.方法 从基因表达数据库(GEO)下载与GDM相关的微阵列数据(GSE103552数据集).采用R软件中的"limma"程序包筛选对照组和GDM组差异表达基因,使用R...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 秦浩 方春华 等 《实用肝脏病杂志》 2023年26卷5期 694-697页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨Rho GTP酶激活蛋白18(ARHGAP18)基因在乙型肝炎病毒相关肝细胞癌(HBV-HCC)组织水平变化及其功能.方法 在基因表达数据库(GEO)中下载数据集以评估ARHGAP18 水平.应用UALCAN网站研究不同临床和病理...
【关键词】 肝细胞癌;Rho GTP酶激活蛋白18(ARHGAP18)基因;细胞衰老;
- 概要:
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【中文期刊】 王佳敏 初冬美 等 《中国医科大学学报》 2022年51卷10期 865-869页ISTICPKUCABP
【摘要】 目的 应用基因表达数据库 (GEO) 和癌症基因组图谱 (TCGA) 数据库联合分析硫酸酯酶1 (SULF1) 在胃癌组织中的表达情况及其对胃癌总体生存率 (OS) 的影响,探索SULF1表达与胃癌患者OS的相关性.方法 从GEO数据库选取...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 范吉林 朱婷婷 等 《吉林大学学报(医学版)》 2022年48卷6期 1535-1545页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:采用生物信息学方法挖掘公共数据库,构建房颤(AF)的内源性RNA(ceRNA)免疫调节网络,了解AF的发生发展机制.方法:从基因表达数据库(GEO)中下载AF患者和健康对照者环状RNA(circRNA)(GSE129409)、微小RN...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 赵格 黎昌学 等 《口腔疾病防治》 2022年30卷1期 27-32页ISTIC
【摘要】 目的 探索miR?135b?5p在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)及癌旁组织中的表达及其临床意义,预测miR?135b?5p靶基因并进行相关生物信息学分析.方法 通过肿瘤与癌症基因图谱(t...
【关键词】 口腔鳞状细胞癌;微小RNA;miR-135b-5p;
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 王维 林雷 等 《武警医学院学报》 2011年20卷2期 147-150页ISTICCA
【摘要】 <篇首> 基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)是美国国立生物技术信息中心(NationalCenter for biotechnology information,NCBI)在2000年7月首次公布的基因表达...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 武翠玲 任晨霞 《细胞与分子免疫学杂志》 2023年39卷1期 21-25页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用生物信息学方法分析溃疡性结肠炎(UC)的枢纽基因和关键通路.方法 通过基因表达数据库(GEO)下载UC表达谱芯片GSE134025.利用R语言的Limma包筛选UC组与正常组肠黏膜细胞差异表达基因,对这些基因进行GO和KEGG分析...
- 概要:
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【中文期刊】 裴珍珍 张珊 等 《中国糖尿病杂志》 2025年33卷1期 28-35页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨程序性细胞死亡(PCD)对DKD发生发展的作用机制.方法 检索基因表达综合数据库,获取数据集GSE30529和GSE30122,分析DKD差异表达基因(DEGs).通过基因集富集分析网站、铁死亡数据库、自噬数据库并结合既往相关文献...
- 概要:
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【中文期刊】 刘金瑛 马培 等 《中华中医药学刊》 2025年43卷11期 168-171,后插37-后插39页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过生物信息学方法筛选与帕金森病(Parkinson's disease,PD)相关的关键基因、功能富集及信号通路.方法 从基因表达综合数据库(Gene expression omnibus,GEO)下载帕金森病芯片数据集GSE762...
- 概要:
- 方法:
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【中文期刊】 石长玉 李勇 等 《吉林大学学报(医学版)》 2025年51卷3期 703-715页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:基于生物信息学方法分析补体替代途径对小鼠结直肠癌(CRC)肝转移模型的调控作用,并进行实验验证.方法:以"CRC肝转移"为关键词在基因表达综合(GEO)数据库中进行检索,获取GSE81558 GEO数据集,包括正常结肠组织样本、CRC...
- 概要:
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【中文期刊】 郭奥奥 周贤 等 《世界中医药》 2025年20卷2期 198-210页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:探讨四土汤中的抗炎活性成分及其作用机制.方法:采用超高效液相色谱-串联质谱(UPLC-Q-TOF-MS)技术检测四土汤中的化学成分.利用网络药理学筛选活性成分与核心靶点,预测四土汤抗炎作用机制.运用分子对接技术验证活性成分与核心靶点的...
【关键词】 四土汤;抗炎;超高效液相色谱-串联质谱;
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 郭智 谢意 等 《四川大学学报(医学版)》 2025年56卷1期 41-50页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过高通量基因表达数据库(GEO)和网络药理学方法探讨汉黄芩苷对高血压所致肾损伤的潜在治疗作用、靶点及通路,并通过体内外实验验证汉黄芩苷干预对自发性高血压大鼠(spontaneously hypertensive rats,SHR)肾...
【关键词】 高通量基因表达数据库;网络药理学;汉黄芩苷;
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【中文期刊】 俞松松 尹京兆 等 《天津医药》 2025年53卷2期 124-128页MEDLINEISTICCA
【摘要】 目的 探讨Gli1、Gli2和Gli3基因及蛋白在肝细胞癌(HCC)组织中的表达特征及其与预后的关系.方法利用cBioportal数据库分析315例HCC样本中Gli基因的表达情况,并通过免疫组织化学方法检测40例HCC及其他肝脏组织中Gl...
- 概要:
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【中文期刊】 徐珊珊 严林 等 《癌症进展》 2025年23卷15期 1745-1749页ISTIC
【摘要】 目的 基于生物信息学分析肿瘤相关成纤维细胞(CAF)的关键基因,筛选对CAF有潜在抑制作用的药物,并分析这些药物的毒性及其作用机制.方法 从基因表达综合(GEO)数据库下载CAF和正常成纤维细胞的基因表达数据,通过R软件limma包获得CA...
【关键词】 肿瘤相关成纤维细胞;基因表达综合数据库;BRD-K14340046;
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【中文期刊】 朱宇 蒋宁兰 等 《西部医学》 2025年37卷6期 806-811页ISTIC
【摘要】 目的 基于GEO数据库探讨银屑平丸改善寻常型银屑病(Ps)患者的分子作用机制.方法 将48只小鼠随机分为正常对照组、银屑病样模型对照组、阿维A药物组、银屑平丸高、中、低剂量组,每组8只.正常对照组使用凡士林涂抹小鼠背部暴露皮肤作对照,其余5...
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