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【中文期刊】 付聪 薛向磊 等 《浙江医学》 2023年45卷6期 599-602,封3页ISTICCA
【摘要】 目的 基于生物信息学挖掘结肠癌预后相关生物标志物.方法 利用基因表达汇编数据库下载结肠癌芯片数据集GSE25070和GSE115313,获取结肠癌组织样本43例、正常结肠组织样本44例,筛选出两个芯片数据集的共同差异基因.构建共同差异基因的...
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【中文期刊】 刘斌 郑鹏远 等 《中国癌症杂志》 2021年31卷4期 285-293页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 背景 与目的:低密度脂蛋白受体相关蛋白8(low-density lipoprotein receptor-related protein 8,LRP8)在肝癌、肺癌、乳腺癌、结直肠癌等多种肿瘤发生中起重要作用,分析LRP8在胃癌中的表达及...
【关键词】 胃癌；低密度脂蛋白受体相关蛋白8；人类癌症基因组图谱；
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【中文期刊】 李果 陈倩 等 《中山大学学报（医学科学版）》 2020年41卷3期 424-435页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]为了研究合并心力衰竭的扩张型心肌病发生发展相关的差异基因与调控信号通路,利用生物信息学方法探讨了基因表达汇编(GEO)中的基因芯片和人类基因和遗传疾病的在线目录(OMIM)中扩张型心肌病相关基因.[方法]本研究选择了由德国波鸿大学H...
- 概要：
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【中文期刊】 王治 洪莉 等 《吉林大学学报（医学版）》 2020年46卷4期 804-809页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:通过生物信息学方法分析与子宫内膜癌(EC)发生发展相关的关键基因和候选通路,探讨EC的发病机制和治疗靶点.方法:自公共基因芯片数据库(GEO)下载EC芯片数据集GSE17025和GSE63678,使用GE02R在线分析工具和R软件筛选...
- 概要：
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【中文期刊】 鞠铭伊 毕佳 等 《郑州大学学报（医学版）》 2020年55卷6期 779-785页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:筛选与免疫相关的、稳定的肝癌预后标志物.方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载肝癌患者的相关数据,筛选出差异表达的肝癌免疫相关基因.通过对这些基因进行单因素、多因素分析,筛选肝癌预后标志物.用DAVID在线工具进行GO和KEG...
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【中文期刊】 孙阳 赵春临 《医学研究生学报》 2019年32卷6期 629-633页ISTICPKU
【摘要】 目的 纤维连接蛋白1(FN1)参与癌症发生发展的机制尚不清楚.文章旨在研究FN1在胃癌组织中的表达和临床病理意义,并探讨FN1作用机制. 方法 采用人类肿瘤相关基因表达汇编(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库,下载GSE541...
【关键词】 胃癌；人类肿瘤相关基因表达汇编数据库；癌症基因组图谱数据库；
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【中文期刊】 何天基 陈翔 等 《癌症进展》 2021年19卷11期 1109-1114页ISTIC
【摘要】 目的 采用生物信息学方法鉴定与肾透明细胞癌(KIRC)预后相关的关键基因,并进一步分析其临床意义.方法 通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)获取肿瘤基因组图谱(TCGA)和基因表达汇编(GEO)中KIRC的基因表达谱数据,提取与正常肾组...
- 概要：
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【中文期刊】 张少校 吴瑛 《中国医科大学学报》 2017年46卷11期 976-979页ISTICPKUCABP
【摘要】 目的 分析人多形性胶质母细胞瘤(GBM)中骨形成蛋白2(BMP2)表达的预后意义和可能的相关信号机制.方法 利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取GBM标本的RNASeqV2数据,从人类肿瘤相关基因表达汇编(GEO)数据库下载GBM样本数...
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【中文期刊】 侯科佐 郑雪莹 等 《现代肿瘤医学》 2020年28卷15期 2639-2644页ISTICCA
【摘要】 目的:探讨NFASC在胃癌中的预后意义及相关机制.方法:从人类肿瘤相关基因表达汇编(GeneExpression Omibus,GEO)数据库中下载GSE62254胃癌数据集,分析NFASC表达与胃癌临床病理学参数的相关性及对预后的影响;利...
【关键词】 胃癌；基因表达汇编(GEO)；NFASC；
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【中文期刊】 周树伟 苏蓓蓓 等 《现代肿瘤医学》 2020年28卷17期 2989-2995页ISTICCA
【摘要】 目的:通过对癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)、人类蛋白组图谱(The Human Pro-tein Atlas,THPA)和人类肿瘤相关的基因表达汇编(Gene Expression Omnibus...
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【中文期刊】 郑雪莹 包博文 等 《山东医药》 2020年60卷29期 14-18页ISTICCA
【摘要】 目的 分析碘甲状腺素脱碘酶(DIO)家族在胃癌患者预后中的作用,并建立预后评估模型.方法 利用人类肿瘤相关基因表达汇编(GEO)数据库中的GSE62254胃癌数据集,分析并筛选DIO家族中胃癌的独立预后因素,计算基于DIO家族的风险评分RS...
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【中文期刊】 周西汉 徐嘉利 《临床肿瘤学杂志》 2019年24卷7期 599-604页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨胃癌组织中支架蛋白A激酶锚蛋白12( AKAP12)的表达及临床意义.方法 收集2013年1月至2016年12月88例胃癌组织和79例癌旁组织,采用实时定量PCR(QPCR)检测以上组织中AKAP12的表达水平,同时下载NCBI胃...
【关键词】 胃癌；A激酶锚蛋白12(AKAP12)；基因表达汇编(GEO)；
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【中文期刊】 郭梓鑫 晏鑫 等 《临床肿瘤学杂志》 2018年23卷8期 711-715页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨基因表达汇编(GEO)数据库中膀胱癌组织的极光激酶B(AURKB)基因的表达情况及其与膀胱癌临床病理特征和预后的关系.方法 收集NCBI的GEO数据库的膀胱肿瘤公共数据集,下载膀胱癌组织AURKB表达数据和临床病理参数.分析AUR...
【关键词】 膀胱癌；极光激酶B；基因表达汇编(GEO)；
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【中文期刊】 郭金锋 王硕 等 《临床肿瘤学杂志》 2018年23卷6期 528-532页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨基因表达汇编(GEO)及癌症和肿瘤基因表达图谱(TCGA)数据集中胃癌组织的SMARCA1表达情况及其与胃癌临床病理特征和预后的关系.方法 利用GEO和TCGA数据集汇总胃癌相关数据,下载胃癌组织SMARCA1表达数据及临床病理参...
【关键词】 胃癌；基因表达汇编(GEO)；癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)；
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【中文期刊】 臧丹 曲秀娟 等 《现代肿瘤医学》 2018年26卷20期 3252-3256页ISTICCA
【摘要】 目的:研究USP51在胃癌中的表达情况,探讨USP51表达与胃癌临床病理参数的相关性并预测USP51表达对胃癌预后评估的临床价值.方法:从人类肿瘤相关基因表达汇编(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库下载胃癌样本数...
【关键词】 胃癌；人类肿瘤相关基因表达汇编；USP51；
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【中文期刊】 张少校 吴瑛 《临床军医杂志》 2017年45卷10期 1018-1021页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨DNA损伤诱导转录样蛋白4(DDIT4L)在人脑多形性胶质母细胞瘤(GBM)中的表达与患者预后的关系及相关机制.方法 分别从癌症基因组图谱(TCGA)和人类肿瘤相关基因表达汇编(GEO)数据库下载GBM的RNASeqV2数据,以及...
【关键词】 人类肿瘤相关基因表达汇编；多形性胶质母细胞瘤；DNA损伤诱导转录样蛋白4；
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【中文期刊】 王硕 李智 等 《武警后勤学院学报（医学版）》 2016年25卷6期 424-427,封3页ISTICCA
【摘要】 [目的]研究claudin11在胃癌中的表达及临床价值,预测claudin11参与肿瘤发生发展的机制.[方法]从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)和人类肿瘤相关的基因表达汇编(gene express...
【关键词】 胃癌；癌症基因组图谱；人类肿瘤相关的基因表达汇编；
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【中文期刊】 李智 王硕 等 《山东医药》 2016年56卷24期 5-8页ISTICCA
【摘要】 目的：观察胃癌组织ATP酶α2亚基（ ATP1A2）表达情况，探讨其与黏着斑通路、细胞黏附分子、钙离子通路、细胞外基质相关信号通路的关系。方法从癌症基因组图谱（ TCGA）数据库下载并预处理胃癌RNASeqV2数据、从人类肿瘤相关基因表达汇...
【关键词】 胃癌；癌症基因组图谱；人类肿瘤相关基因表达汇编；
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【中文期刊】 李伟 郭梓鑫 等 《肿瘤代谢与营养电子杂志》 2019年6卷2期 242-245页
【摘要】 目的 探究UBE2T基因在肺癌中的表达情况及其与肺癌的临床病理特征和预后的关系.方法 搜索NCBI的GEO数据库中的肺癌公共数据集,下载肺癌组织中的UBE2T表达数据和临床病理信息.分析UBE2T的表达与肺癌临床病理特征(年龄、T分期、N分...
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【中文期刊】 葛继芸 姚晨 等 《海军军医大学学报》 2022年43卷7期 744-751页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用生物信息学技术筛选与肝癌复发相关的核心基因及信号通路,为探索肝癌复发的分子机制提供理论依据.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达汇编(GEO)数据库下载肝癌相关数据集,利用edgeR算法筛选差异表达基因.对差异表达基因进行...
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