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【中文期刊】 刘雅妮 杨静欢 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷5期 1091-1100页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:纤维肌痛综合征作为常见风湿病,其发病与中枢敏化及免疫异常有关,但具体过程尚未阐明,缺乏特异性诊断标志物,不断探索该病的发病机制具有重要的临床意义.目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)等生物信息学方法和机器学习算法筛选纤维肌痛...
- 概要：
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【中文期刊】 余帅江 沈鹏 等 《颈腰痛杂志》 2025年46卷1期 126-131页ISTIC
【摘要】 目的 分析坐骨神经痛患者的基因表达特征,探讨其发病机制中的潜在关键基因,为临床治疗提供新方向.方法 利用GEO数据库收集坐骨神经痛相关的基因表达数据,采用limma包进行差异表达基因分析,并通过基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百...
- 概要：
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【中文期刊】 韩露 周扬 等 《中国免疫学杂志》 2024年40卷7期 1405-1410,中插1页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:基于基因表达数据库(GEO)对慢性自发性荨麻疹(CSU)表达谱芯片数据筛选差异表达基因并进行基因集富集分析(GSEA)和免疫细胞浸润分析,深入了解CSU的发病机制.方法:从GEO数据库中获取GSE72541芯片数据,利用R软件获取差异...
- 概要：
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【中文期刊】 高娅娅 李妙雨 等 《海南医学院学报》 2024年30卷7期 515-525页ISTICPKU
【摘要】 目的:探讨同种异体移植炎症因子-1(allograft inflammatory factor 1,AIF1)在急性髓系白血病(AML)免疫和预后中的价值.方法:利用生物信息学方法分析AIF1在AML中的表达及其与AML患者生存预后的关系....
【关键词】 AIF1；急性髓系白血病；京都基因与基因组数据库富集分析；
- 概要：
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【中文期刊】 张瑶 付贺青 等 《中国药业》 2024年33卷9期 68-74页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨蒙药经典方剂肉豆蔻-5对心肌梗死(MI)模型大鼠的保护作用及机制.方法 将 50只大鼠分为空白对照组(A组),模型对照组(B组),肉豆蒄-5 高、中、低剂量干预组(C1 组、C2 组、C3 组),各 10 只.除A组外,B组、C1...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 李彦 王进朝 等 《临床检验杂志》 2024年42卷7期 492-496页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨分拣蛋白1(sortilin 1,SORT1)基因作为小儿脓毒血症新的诊断生物学标志物的临床应用价值.方法 从GEO数据库中获取了 3个小儿脓毒血症相关的微阵列数据集(GSE13904、GSE26378和GSE26440),分析S...
- 概要：
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【中文期刊】 陈文佳 巩勋 等 《北京中医药大学学报》 2023年46卷5期 599-606页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 应用基因集富集分析(GSEA)和加权基因共表达网络分析(WGCNA)发现类风湿关节炎(RA)肝肾亏虚证的候选生物标志物,并进行临床验证,探讨RA肝肾亏虚证的生物学基础.方法 临床收集RA肝肾亏虚证(3例)、7个非肝肾亏虚证(各3例)及...
- 概要：
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【中文期刊】 刘格良 陈熙勐 等 《中国实验血液学杂志》 2023年31卷1期 162-169页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:筛选多发性骨髓瘤(MM)患者代谢相关基因预后生物标志物,构建MM患者代谢基因生存预后模型.方法:检索MM患者相关的组学数据库.选择具有完整临床信息的病例和健康对照组数据进行分析.从HPA与MMRF数据库收集整理MM患者与健康对照骨髓组...
- 概要：
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【中文期刊】 陈文杰 肖钧 等 《生命科学研究》 2023年27卷5期 435-446页ISTICCA
【摘要】 为筛选骨关节炎(osteoarthritis,OA)免疫浸润相关基因,从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中获取多个芯片数据,分为训练集以及验证集,筛选出差异表达基因(differentially ex...
【关键词】 生物信息学；骨关节炎(OA)；基因集富集分析(GSEA)；
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【中文期刊】 杨瑾 李圃 《临床与病理杂志》 2023年43卷6期 1104-1118页ISTICCA
【摘要】 目的:子宫内膜异位症是一种发病率较高、诊断困难且目前病理机制不清的妇科疾病.通过基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)和基因集变异分析(gene set variation analysis,G...
- 概要：
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【中文期刊】 李梁珊 赵虎 等 《检验医学》 2023年38卷9期 825-832页ISTICCA
【摘要】 目的 采用生物信息学分析方法挖掘结直肠癌(CRC)关键基因,作为潜在的预后生物标志物.方法 从基因表达综合(GEO)数据库获取与CRC相关的GSE33113数据集.采用R软件中的limma程序包获取CRC组织与癌旁组织的差异表达基因,采用D...
【关键词】 差异表达基因；加权基因共表达网络分析；EXO1；
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【中文期刊】 王艳秋 周倩 等 《现代消化及介入诊疗》 2023年28卷1期 50-56页ISTIC
【摘要】 目的 探究铜死亡相关基因在慢加急性肝衰竭(Acute-on-chronic liver failure,ACLF)发生发展中的作用,从而进一步研究ACLF与铜死亡相关的发病机制.方法 从GEO(Gene Expression Omnibus...
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【中文期刊】 张海溢 王宸怡 等 《当代医药论丛》 2023年21卷8期 108-112页
【摘要】 目的:探讨肝细胞癌组织中白细胞介素4诱导蛋白1(IL4I1)的表达及其临床价值.方法:从TCGA公共数据库中下载肝细胞癌的相关样本资料,使用R软件和Perl软件进行数据分析整理,采用Wilcoxon秩和检验分析基因IL4I1在正常组织和肝细...
【关键词】 白细胞介素4诱导蛋白1；肝细胞癌；基因集富集分析；
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【中文期刊】 张志勇 唐爱华 等 《广西医学》 2022年44卷10期 1131-1135页ISTICCA
【摘要】 目的 基于生物信息学预测甲状腺癌预后相关的高风险糖酵解基因,并分析其与患者预后的关系.方法 (1)从TCGA数据库中下载甲状腺癌相关的转录组数据及临床数据,包括癌旁样本和肿瘤样本.从基因集富集分析(GSEA)数据库中搜索所有与糖酵解相关的基...
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【中文期刊】 徐淑坦 冷银辉 等 《中国医学物理学杂志》 2022年39卷9期 1173-1181页ISTICCSCD
【摘要】 提出一种综合考虑通路局部和全局信息的基因通路富集分析(GIGSEA)方法.首先利用基因相互作用数据,通过基因在通路的局部重要性和在通路数据库的全局特异性计算基因的影响力;然后将基因影响力和表型相关性值融合在一起,计算通路的富集分数;最后通过...
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【中文期刊】 吕朝旭 史恺 《攀枝花学院学报》 2022年39卷5期 109-118页
【摘要】 整合素α2(integrinα2,ITGA2)的异常表达与多种不同类型的肿瘤有关,包括乳腺癌、肠道肿瘤、结直肠癌、胃癌、肝细胞癌、前列腺癌等,但其作用在不同类型的肿瘤发生发展中存在争议.此外,ITGA2在胰腺癌中的潜在作用仍不清楚.在本研究...
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【中文期刊】 刘博 孙超 等 《吉林大学学报（医学版）》 2025年51卷2期 437-446页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:采用生物信息学方法筛选多原发肺癌(MPLCs)的差异表达基因(DEGs),分析其生物学功能以及对肺腺癌预后的影响.方法:在高通量基因表达综合数据库(GEO)下载GSE200972单细胞转录组测序数据.采用R软件进行数据初步处理后,采用...
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【中文期刊】 谢铱子 林雪莹 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷31期 6708-6716页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:线粒体自噬与特发性肺纤维化的发生发展关系密切,但其作用机制尚不清楚.目的:探讨线粒体自噬在特发性肺纤维化中的生物学机制,为临床特发性肺纤维化风险预测及亚型区分提供思路.方法:通过GEO和Reactome Pathway数据库等获取特发...
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【中文期刊】 易嘉欣 廖建春 等 《国际口腔医学杂志》 2025年52卷2期 210-216页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探究金担子素A(AbA)对白色念珠菌的抑菌活性及潜在作用机制,评估其未来作为新型抗真菌药物的应用潜力.方法 首先测定了AbA的最低抑菌浓度(MIC),并探究其对菌丝形成及细胞壁完整性的影响.随后,利用转录组测序探讨了白色念珠菌在AbA...
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【中文期刊】 巩月红 王梦君 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷35期 7679-7689页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:肺纤维化的早期诊断是及时开展抗纤维化药物治疗的基础,因此,探索并发现能够有效应用于肺纤维化早期诊断的理想生物标志物对疾病治疗至关重要.目的:通过生物信息学和机器学习技术对肺纤维化过程中涉及的与自噬相关关键基因进行深入分析,探究与自噬相...
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