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【中文期刊】 关庆洲 赵鹏 等 《时珍国医国药》 2024年35卷7期 1633-1635页PKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用脂多糖(LPS)诱导的巨噬细胞炎症反应模型和基因集富集分析(GSEA)方法,从通路水平探析补肺方及其配伍干预慢性阻塞性肺疾病的作用机制.方法 通过LPS诱导巨噬细胞建立炎症反应模型,给予补肺方所含中药分别处理,并进行高通量测序得到...
- 概要：
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【中文期刊】 冯豆 张洪 等 《生物医学工程与临床》 2023年27卷1期 97-104页ISTICCA
【摘要】 目的 TMEM164是TMEM家族的一员,实验基于肿瘤基因组图谱(TCGA)和Oncomine数据库评估了 TMEM164在肝细胞癌中表达及临床意义.方法 从GDC Data Portal网站(https://portal.gdc.canc...
【关键词】 TMEM164；肝细胞癌；肿瘤基因组图谱(TCGA)；
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【中文期刊】 宋雷 郭忠 等 《基因组学与应用生物学》 2021年40卷9期 3261-3276页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为探索胃癌中BICC1基因表达水平的临床预后意义及其在胃癌进展中的功能,通过分析肿瘤基因组图谱计划(the cancer genome atlas program,TCGA)中BICC1在胃癌及癌旁组织中转录水平表达的差异,回顾性研究了 B...
- 概要：
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【中文期刊】 李亚军 何金曼 等 《生物技术》 2025年35卷1期 25-29,94页ISTICCA
【摘要】 [目的]分析硅缺乏对小新月菱形藻基因在转录水平上的调控.[方法]收集缺硅24 h和正常培养条件下的藻细胞,利用illumina NovaSeq 6000平台对其RNA进行测序.以正常培养藻细胞为对照,鉴定硅缺乏条件下差异表达基因,并对其进行...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 雷诗卉 李薇 等 《中国实验方剂学杂志》 2024年30卷18期 98-106页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:结合基因集富集分析(GSEA)和趋势分析(STEM)方法研究左归降糖解郁方治疗糖尿病并发抑郁症的关键途径并进行验证.方法:将SD大鼠随机分为正常组、模型组、左归降糖解郁方高、中、低剂量组、西药组.采用高脂饲养、链脲佐菌素(STZ)注射...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 吴承益 宋莉 等 《中国分子心脏病学杂志》 2024年24卷2期 6020-6026页ISTICCA
【摘要】 目的 筛选出高血压脑出血(hypertensive intracerebral hemorrhage,HICH)血管病变的关键基因,为干预HICH提供新的候选靶点.方法 从小鼠基因组信息数据库(Mouse Genome Informatic...
- 概要：
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【中文期刊】 曾榆凯 王光辉 等 《武汉大学学报（医学版）》 2024年45卷8期 933-938,957页ISTICCABP
【摘要】 目的:旨在基于生物信息数据库进行数据挖掘以探索泛素样含PHD和环指域1(UHRF1)在肺腺癌中的表达情况并分析其对肺腺癌患者的预后影响.方法:使用GEPIA数据库探索UHRF1在泛癌中的表达情况.应用UALCAN数据库和Kaplan-Mei...
【关键词】 UHRF1；肺腺癌；Kaplan-Meier分析；
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【中文期刊】 曹丽 吴菲 等 《中国细胞生物学学报》 2023年45卷1期 44-55页MEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 组织金属蛋白酶抑制因子3(TIMP3)在肝癌中的具体作用机制尚不明确.该文探讨了TIMP3在肝癌细胞中的表达及其对细胞增殖、细胞凋亡、细胞周期的影响.通过qRT-PCR和West-ern blot检测肝癌 细胞株(97H、97L和HUH7)...
- 概要：
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【中文期刊】 全静雯 朱丹萍 等 《联勤军事医学》 2023年37卷4期 307-313页ISTIC
【摘要】 目的 运用生物信息学方法研究锌指蛋白 7(zinc finger protein 7,ZNF7)基因及其共表达基因在乳腺癌发生发展过程中的作用.方法 通过GeneCards及PubMeb数据库分析ZNF7基因的已知功能;通过UALCAN网站...
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【中文期刊】 汤柳 宋伟 等 《中国皮肤性病学杂志》 2022年36卷10期 1118-1125页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 运用生物信息学方法筛选特应性皮炎(atopic dermatitis)的差异表达基因(DEGs),明确其功能并探讨AD的发病机制.方法 从GEO数据库中获取GSE120721、GSE16161、GSE6012 与 GSE329244 ...
- 概要：
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【中文期刊】 徐文秀 蒋梦萍 等 《南京医科大学学报（自然科学版）》 2021年41卷12期 1747-1752,1773页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:应用生物信息学技术筛选高乳腺密度和低乳腺密度的正常女性的差异基因并分析其富集通路,为致密型乳腺女性乳腺癌早期诊断、靶向治疗和预后评估提供理论依据.方法:从GEO数据库获取GSE38506数据集,使用GEO2R筛选差异表达基因.使用DA...
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【中文期刊】 吕洁 齐新伟 等 《中国病原生物学杂志》 2021年16卷1期 38-43页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 病毒感染时对IFITM3、 TRIM22和FOXP3及基因进行富集分析. 方法 利用STRING作出IF-ITM3、TRIM22和FOXP3及其关联的50个基因互作网络图;利用DAVID数据库和KOBAS数据库对其进行GO分析和KEG...
【关键词】 三结构域蛋白22；干扰素诱导的跨膜蛋白3；基因富集分析；
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【中文期刊】 从美丽 古丽拉莱·多力坤 等 《医学动物防制》 2022年38卷4期 374-378页ISTIC
【摘要】 目的 运用基因芯片技术检测甘草酸对大鼠酒精性肝损伤保护作用的分子机制.方法 45只大鼠随机分为3组:模型组、甘草酸组、正常对照组,连续灌服56度白酒8周,处理动物,测定血清谷丙转氨酶(ALT)和谷草转氨酶(AST)水平;抽提肝脏RNA,全基...
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【中文期刊】 郑宝庆 颜韵灵 等 《中国皮肤性病学杂志》 2020年34卷8期 867-871页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过检测斑块型银屑病患者外周血中SLC35E2B的表达情况,并利用数据库分析基因富集的功能和参与的通路,探讨SLC35E2B在银屑病发病机制中的作用.方法 收集斑块型银屑病47例、正常对照14例的外周静脉血,提取样本基因组DNA,用外...
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【中文期刊】 古龙 周牮 等 《中国实验方剂学杂志》 2020年26卷7期 178-185页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:基于基因芯片技术,对颅内动脉瘤(IA) mRNA表达谱芯片数据进行基因集富集分析(GSEA)和免疫浸润分析,为深入了解IA的形成机制提供理论依据.方法:从基因表达数据库(GEO)中获取GSE75436芯片数据,利用R软件对基因表达谱进...
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【中文期刊】 谢甲钰 王丹凤 等 《基因组学与应用生物学》 2020年39卷11期 5278-5285页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 DJ-1又称为PARK7,其突变与癌症或常染色体隐性遗传早发性帕金森病(PD)有关.DJ-1是一种非典型的类过氧化物酶,可作为氧化还原依赖的伴侣蛋白和转录调节因子.本研究通过GEO数据库获取GSE17204数据集的表达矩阵,该数据集通过对人...
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【中文期刊】 刘萌 段琪琪 等 《中国皮肤性病学杂志》 2019年33卷11期 1232-1238页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过生物信息学方法,寻找在银屑病中差异表达的基因,明确其功能,探讨银屑病的发病机制.方法 从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中下载GSE6710数据集,以P＜0.05及表达变化大于1.5倍筛选差异基因.结...
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【中文期刊】 高皓 贾党生 等 《中国实验方剂学杂志》 2019年25卷10期 180-187页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:采用网络毒理学的方法,通过建立化合物、蛋白、基因和毒物反应的网络关系,分析细辛中有毒物质的毒理作用机制,预测未知毒性.方法:通过在中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)数据库查询到的细辛候选化合物,以及在比较毒物基因组学数据库(C...
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【中文期刊】 李艳珍 许皓杰 等 《中华高血压杂志》 2019年27卷12期 1150-1156页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 应用生物信息学方法分析原发性高血压(EH)患者与正常血压成人差异表达的长链非编码RNA(lncRNA)和信使RNA(mRNA),从分子水平探讨EH的发病机制,为研究EH提供新思路.方法 从美国国立生物技术信息中心公共数据平台下载包含5...
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【中文期刊】 崔亚登 张锐 等 《基因组学与应用生物学》 2019年38卷12期 5744-5753页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为了研究THY1 (THYmocyte differentiation antigen 1)在胃癌中的表达情况,预测并探讨THY1参与肿瘤发生发展的可能机制及临床价值.本研究从GEO (Gene expression omnibus)数据库...
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