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【中文期刊】 章子怡 王棨临 等 《遗传》 2024年46卷10期 820-832页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 乳腺癌的高度异质性导致其治疗及预后评估较为复杂.治疗方案的选择受到肿瘤亚型、病变分级、基因型等多种因素的影响,因此需要制定个体化治疗策略.患者的预后效果因病情不同而产生显著差异.作为人工智能的一个重要分支,机器学习能高效处理海量数据,并实现...
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【中文期刊】 朱岩 张志丹 等 《生物工程学报》 2025年41卷3期 1152-1178页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 生物制造是新质生产力的重要代表,是通过工程细胞或无细胞体系实现物质高效转化的创新生产方式.其生产过程具有时空异质性、复杂性及动态性,给过程系统认知、优化调控带来了显著挑战.本文总结了生物过程多组学数据获取及分析的关键技术,归纳了基于多组学数...
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【中文期刊】 刘伟 张阳 等 《国际检验医学杂志》 2018年39卷9期 1025-1028页ISTICCA
【摘要】 随着多组学时代的到来,检验组学这一综合性科学应运而生.检验组学是综合基因组学、蛋白组学、代谢组学、免疫组学及药物基因组学等多组学的检验数据结果,并利用大数据的计算方法对各个组学的数据指标进行分析、筛选、分类、整合的多领域交叉学科.通过大数据...
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【中文期刊】 黄涛 李立明 《中华流行病学杂志》 2018年39卷5期 694-699页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 医学大数据、转化医学、精准医学时代为慢性复杂疾病及其病因的研究带来新的契机.如何实现循证医学、科学转化、合理精准是我们目前面临的任务和挑战.系统流行病学是一种进行疾病危险因素风险识别的流行病学方法,是流行病学的新领域,其利用系统生物学、流行...
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【中文期刊】 沈思鹏 张汝阳 等 《中华疾病控制杂志》 2018年22卷8期 763-765,771页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 复杂疾病往往是由环境因素、遗传因素(多个组学层面)共同作用所致.全面分析不同分子水平的信息对认识疾病的发生发展至关重要.多组学数据整合分析能够提高特征筛选检验效能、改善疾病预测精度.本文从统计学角度出发,对多组学数据整合分析的统计理论方法研...
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【学位论文】 作者：王海宁导师：周兵 张晓荣 中国科学院大学 基础医学 基因组学（硕士） 2022年
【摘要】 AGO2蛋白作为一种具有调控作用的RNA结合蛋白(RNA-bindingProtein，RBP)，可以与micr0RNA(miI州A)结合形成RNA诱导沉默复合物(RNA-InducedSilencingComplex,RISC)，在转录后...
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【学位论文】 作者：童丹阳导师：李劲松 浙江大学 生物医学工程 生物医学工程（博士） 2021年
【摘要】 结肠癌是世界范围内肿瘤相关死亡的主要原因之一，已经对人们的健康和生活质量造成了严重的负担。预后分析研究可以发现新的疾病风险因子，支持临床医生更好地进行患者疾病严重程度的评估。因此，帮助临床医生更好地进行结肠癌的预后分析有着重要的意义。现有临...
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【学位论文】 作者：李昭延导师：吴梦云 上海财经大学 其他 应用统计硕士（硕士） 2021年
【摘要】 癌症一直是生命科学研究的重大难题之一，随着生命科学的发展研究越发深入，揭开癌症的成因，为患者提供针对性的治疗方案成为了研究的热门课题。癌症的成因非常复杂，但从本质上看癌症的产生是基因导致的，体内的原癌基因、抑癌基因发生突变会影响下游的RNA...
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【学位论文】 作者：段宏伟导师：许立达 李福胜 北京化工大学 生物学 生物工程（硕士） 2021年
【摘要】 卵巢癌在女性恶性肿瘤中致死率最高，治疗后易复发且多呈现耐药性，急需针对卵巢癌特定分子靶标的靶向治疗手段。具有同源重组缺陷(Homologous Recombination Deficiency，HRD)的上皮性卵巢癌患者对聚ADP核糖聚合酶...
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【学位论文】 作者：刘琳导师：章张 中国科学院大学 生物学 生物信息学（博士） 2020年
【摘要】 胶质瘤是最严重的脑瘤之一，具有复发率高、治愈率低、死亡率高等特点。近年来，高通量测序技术的飞速发展推动胶质瘤多组学数据的海量激增，极大地促进了胶质瘤在分子水平上的研究。然而，缺乏基于大规模胶质瘤多组学数据整合的生物标记物挖掘分析、关键基因识...
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【学位论文】 作者：高洋导师：Andrew E.Teschendorff 中国科学院大学 生物学 计算生物学（博士） 2018年
【摘要】 纵观整个生命过程，正常细胞会在基因组和表观基因组中逐渐获得遗传变异和表观遗传变异，从而导致癌症的发生，这些分子改变在癌症的发展和临床演变中继续发挥重要作用。本论文为阐明遗传变异和表观遗传变异，特别是DNA甲基化改变，在癌症（特别是乳腺癌）发...
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【学位论文】 作者：李庆辉导师：沈百荣 苏州大学 生物学 系统生物学（硕士） 2013年
【摘要】 芯片及测序技术的发展大大促进了癌症在分子层次上的研究。多组学及技术平台的联合应用提供了更多的限制条件，减少了假阳性。本文整合了包括来自测序及芯片平台的2组表观遗传学数据，3组DNA与蛋白质相互作用数据（ChIP-Seq），10组基因表达数据...
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【中文期刊】 师国京 李灵梅 等 《中国卫生统计》 2024年41卷3期 376-381页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 针对网络增强的相似网络融合(network enhancement fusion,ne-SNF)方法先融合不同组学网络,再对融合后的网络降噪,忽略了不同组学相似网络噪声对融合网络影响的问题,本文提出了改进的网络增强融合(im-prov...
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【中文期刊】 李灵梅 魏亿芳 等 《中国卫生统计》 2022年39卷4期 522-528页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 探讨局部保留投影的正则化多核学习(regularized multiple kernel learning with locality preserving projections,rMKL-LPP)在乳头状肾细胞癌(papillar...
【关键词】 局部保留投影的正则化多核学习；多组学数据整合；分子亚型；
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【中文期刊】 邱丹丹 《肾脏病与透析肾移植杂志》 2022年31卷3期 256-260页ISTICCSCDCA
【摘要】 近10年来,通过单细胞RNA测序获取单个细胞基因表达谱、鉴定细胞类型和功能已取得重大进展.然而细胞在不同组织内的空间位置信息对于进一步鉴定细胞类型,明确细胞功能变化和细胞间相互作用,探索组织内环境改变及其同疾病发生发展的关系至关重要.空间转...
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【中文期刊】 滕小娟 林静霞 等 《皮肤性病诊疗学杂志》 2022年29卷3期 197-205页
【摘要】 目的 研究皮肤自然衰老过程中基因表达和免疫微环境的动态变化.方法 收集GTE x项目中699个皮肤组织转录组测序数据(RNA-seq),依据年龄段分为年轻组(20～39岁)和衰老组(60～79岁),进行差异基因表达分析.用CIBERSORT...
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【中文期刊】 徐欢 宋微 等 《中国卫生统计》 2019年36卷5期 774-776页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 引入JIVE方法对多组学数据进行整合分析,并应用于肿瘤分子分型研究.方法 使用TCGA数据库中卵巢癌mRNA和miRNA的组学数据,应用JIVE方法整合分析两个组学数据,提取两不同组学数据的共同特征,然后通过对其具有共同结构的数据做主...
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【中文期刊】 林丽娟 董学思 等 《中国卫生统计》 2017年34卷3期 523-525,527页ISTICPKUCSCD
【摘要】 跨平台组学数据(cross-platform-omics data)研究中,一组样本往往只在某些平台(例如蛋白组学、代谢组学等)上进行了测序分析,而另外一些样本在其他平台(例如,基因组学、蛋白组学等)上进行了测序,欲将不同平台的数据进行整合...
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【中文期刊】 张林 张云 等 《中国全科医学》 2014年21期 2472-2477页ISTICPKUCA
【摘要】 目的：探讨整合素和金属蛋白酶域33（ADAM33）基因V4（rs2787094G＞C）多态性与支气管哮喘易患性的关系。方法检索中国生物医学文献数据库（ CBM ）、维普网、万方数据知识服务平台、中国知网（ CNKI ）、PubMed、 EM...
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【中文期刊】 张建中 《临床与实验病理学杂志》 2004年20卷1期 19-22页ISTICPKUCA
【摘要】 <篇首> 在过去的几年里,我们见证了病理学发展的一个崭新变革,即由传统的以形态学为主的"旧生物学",向着功能基因组学和蛋白组学为技术平台的"新生物学"过渡.这种新生物学是利用基因多态性检测、基因表达谱分析和蛋白表达谱分析等技术,通过生物芯片和生...
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