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【中文期刊】 刘艳波 陆远强 《中华危重症医学杂志（电子版）》 2023年16卷1期 20-27页ISTICCA
【摘要】 目的:评价宏基因组二代测序（mNGS）技术在社区获得性肺炎（CAP）病原体检测中的应用价值。方法:回顾性分析2021年2月至8月于浙江大学医学院附属第一医院临床诊断为CAP并行mNGS检测及实验室常规方法检查的345例住院患者的临床资料。记...
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【中文期刊】 刘东来 张春涛 等 《生物工程学报》 2020年36卷12期 2598-2609页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 病原宏基因组高通量测序技术理论上能够检测几乎所有病原体基因组核酸,且适用于几乎所有类型的临床样本,尤其适用于病原不明的疑难感染性疾病的诊断.因此该技术正逐渐成为实验室常规检测方法的重要补充和不可替代的项目.然而,基于该技术的诊断试剂不仅检测...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 徐志伟 魏云林 等 《微生物学通报》 2020年47卷8期 2560-2570页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 病毒宏基因组学是一种新的病毒组学研究手段,随着高通量测序技术的飞速发展,人们能够从环境中快速发现、鉴定病毒基因组的组成并研究其特征.在过去的十年里,研究者们运用病毒宏基因组学发现了许多新型病毒,增强了人们对不同环境中病毒组成、分布和多样性的...
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【中文期刊】 王荧荧 刘洁 《中华临床感染病杂志》 2020年13卷6期 475-480页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 宏基因组二代测序技术(mNGS)是一种无偏好、敏感性高、特异性强的分子生物学检测手段，目前已广泛应用于临床多种感染性疾病的辅助诊断，极大提高了患者的生存率和治愈率。近年来，mNGS临床应用研究的报道越来越多，本文主要就mNGS在呼吸系统感染...
- 概要：
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【中文期刊】 徐放 申阿东 《中华实用儿科临床杂志》 2020年35卷10期 783-786页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 呼吸道感染性疾病严重威胁儿童健康，早期明确病原可为疾病的诊断和治疗奠定基础。宏基因组测序是一种不依赖于培养，直接对临床样品进行测序，并给出全部微生物序列信息的技术。宏基因组测序从病原微生物的检测、微生物组学、微生物与宿主基因相互作用等方面为...
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【中文期刊】 朱其国 袁林 等 《临床儿科杂志》 2020年38卷5期 370-373页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨肺孢子菌肺炎的病因、临床表现、病原学诊断和治疗.方法 回顾分析1例肺孢子菌肺炎患儿的临床资料.结果 患儿,男,2个月20天,临床表现为慢性咳嗽、气促、烦躁、低氧血症;肺部影像呈双肺弥漫性浸润改变;经支气管镜术取肺泡灌洗液进行宏基因...
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【中文期刊】 王宏 李慧莹 等 《国际病毒学杂志》 2020年27卷2期 107-111页ISTICPKU
【摘要】 目的:通过病毒宏基因组学方法分析我国北京市销售的海产品贝类所携带的病毒谱情况。方法:收集北京市销售的330份贝类样本，经过蛋白酶K结合PEG沉淀处理贝类消化腺和肠道后，利用高通量测序和病毒宏基因组进行分析。结果:本研究通过高通量测序后共获得...
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【中文期刊】 汪盼盼 杨野 等 《生物技术通报》 2020年36卷12期 146-154页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 随着测序技术的不断发展,宏基因组学已成为当前研究热点,是研究植物病害的重要手段之一.植物病害影响了植物的正常生长和发育,甚至导致植物死亡.大部分植物病害是由致病微生物或病毒引起.与传统微生物组研究方法相比,宏基因组可通过高通量测序和后续的生...
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【中文期刊】 叶丹丹 樊萌萌 等 《动物学研究》 2012年33卷6期 574-585页SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 由Handelsman et al (1998)提出的宏基因组(metagenome)泛指特定环境样品(例如:人类和动物的肠道、母乳、土壤、湖泊、冰川和海洋等环境)中微生物群落所有物种的基因组.宏基因组技术起源于环境微生物学研究,而新一代高...
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【中文期刊】 毕铭辕 汪春付 等 《中华临床感染病杂志》 2019年12卷5期 379-384页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 几乎所有的病原体均有DNA或RNA基因组,测序技术理论上可有效检测出所有病原体基因组,从而为感染性疾病的病原学诊断提供帮助.下一代测序(Next generation sequencing ,NGS)或高通量测序,自2005年问世以来,随着...
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【中文期刊】 刘山林 《生物多样性》 2019年27卷5期 526-533页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 近年来DNA条形码技术迅速发展,产生的条形码的数量及其应用范围都呈指数性增长,现已广泛用于物种鉴定、食性分析、生物多样性评估等方面.本文重点总结并讨论了构建条形码参考数据库和序列聚类相关的信息分析的技术和方法,包括:基于高通量测序(high...
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【中文期刊】 余泽晖 梁志伟 等 《微生物学通报》 2019年46卷8期 2053-2068页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 污泥厌氧消化是在消化污泥微生物组的协调下将剩余污泥中有机物转化为甲烷的微生物过程.与传统厌氧消化过程不同,污泥厌氧消化系统的进料底物为含有大量微生物细胞及胞外多聚物等复杂大分子有机物的剩余污泥.因此,厌氧消化污泥微生物组的种群组成、功能及种...
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【中文期刊】 李昱辉 高瞻 等 《中国输血杂志》 2021年34卷5期 440-446页ISTICCA
【摘要】 目的 分析中国无偿献血者宏基因组学及微生物组学,评估新发病原体对输血安全的潜在威胁.方法 收集2012～2018年重庆市、广西壮族自治区柳州市、新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市、四川省绵阳市、湖北省武汉市、江苏省南京市、黑龙江省牡丹江市以及云南省...
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【中文期刊】 高婧 朱娅 等 《中国输血杂志》 2021年34卷5期 446-451页ISTICCA
【摘要】 目的 了解凉山州健康无偿献血人群血液微生物组信息,检测血液中可能存在的病原体,并调查其流行情况.方法 随机采集凉山州健康献血人群血液标本1 299(人)份,提取总核酸后进行高通量测序,通过宏基因组学分析,确定微生物组.采用实时荧光定量PCR...
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【中文期刊】 郝林杰 张育民 等 《中华关节外科杂志（电子版）》 2021年15卷2期 185-191页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的:探讨宏基因二代测序技术在关节置换术后假体周围感染病原菌检测中的应用价值。方法:回顾性分析2018年1月至2019年10月西安市红会医院收治的诊断为关节置换术后假体周围感染患者临床资料，排除2周内应用抗生素患者及由于送检标本质量不合格导...
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【中文期刊】 李沛翰 李鹏 等 《生物技术通报》 2018年34卷3期 43-52页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 新发突发传染病暴发给全球公共卫生防控带来严峻挑战.快速识别致病病原体是应对新发突发传染病的首要问题,传统病原检测方法难以应对已知变异较大病原或未知病原,基于高通量测序的宏基因组学研究给病原识别鉴定带来了新的方法和思路.核酸提取、高通量测序和...
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【中文期刊】 刘开辉 张波 等 《微生物学报》 2018年58卷10期 1743-1753页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]揭示陕北花马盐湖沉积物原核微生物群落组成,并分析其潜在的耐盐功能基因.[方法]构建盐湖沉积物宏基因组16S rRNA文库和fosmid文库,利用Illumina HiSeq高通量测序及生物信息技术分析细菌古菌群落组成和耐盐菌株(5-...
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【中文期刊】 王禄禄 王立志 等 《中国微生态学杂志》 2017年29卷2期 223-228页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 微生物在自然界中广泛存在,除土壤和水中的微生物最多外,其次在农业畜牧业中反刍动物的瘤胃微生态系统中的微生物中所占比例最多.反刍动物瘤胃微生物由于种类繁多,数量巨大,微生物区系之间关系非常复杂,它们之间寄生共生,共同影响宿主的生长发育和机体代...
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【中文期刊】 吴楠 杨静慧 等 《微生物学通报》 2016年43卷12期 2720-2729页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 抗生素在医疗和畜禽养殖业的大量使用增加了环境中抗生素抗性微生物(ARB)和抗性基因(ARGs)的丰度与多样性,加速了抗生素耐药性在环境中的传播,给人类公共健康造成潜在威胁.但目前对于环境中耐药性的污染现状缺少足够的信息,相关研究方法亟待优化...
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【中文期刊】 魏子艳 金德才 等 《微生物学通报》 2015年42卷5期 890-901页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 高通量测序技术的发展促进了组学技术在环境微生物研究中的广泛应用,而宏基因组学是目前最为关键和成熟的组学方法.生物信息学在微生物宏基因组学研究中具有至关重要的作用.它贯穿于宏基因组学的数据收集和存储、数据处理和分析等各个阶段,既是宏基因组学推...
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