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【中文期刊】 宋姝熠 蒋开秀 等 《生物技术通报》 2025年41卷3期 190-201页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]基于全基因组鉴定'红阳'猕猴桃TCP基因(AcTCPs)家族成员,分析各成员的分类进化关系,研究其组织、果实发育过程和激素处理的表达特性,为深入揭示猕猴桃果实中TCP基因的功能奠定基础.[方法]利用生物信息学方法分析'红阳'猕猴桃T...
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【中文期刊】 姜丽欣 郭相南 等 《医药前沿》 2025年15卷28期 19-25页
【摘要】 目的 分析结肠癌发生发展的关键基因及潜在预后标志物.方法 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取471例结肠癌组织及41例癌旁正常组织的基因表达谱数据,通过生物信息学方法筛选差异表达基因(DEGs),采用加权基因共表达网络分析(WGCNA...
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【中文期刊】 王梓霞 黄羽欣 等 《中草药》 2024年55卷2期 551-562页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过生物信息学技术分析皮肤黑色素瘤患者皮肤组织与非癌皮肤组织的基因表达微阵列数据,筛选出皮肤黑色素瘤的差异表达基因,预测可用于诊断和治疗皮肤黑色素瘤的生物标志物及潜在中药.方法 从基因表达数据库(Gene Expression Omn...
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【中文期刊】 杨杉杉 张为 等 《上海口腔医学》 2024年33卷6期 561-571页MEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 目的:通过生物信息学方法探讨绝经后骨质疏松(postmenopausal osteoporosis,POP)小鼠模型颌骨骨髓间充质干细胞(mandibular bone marrow mesenchymstem cells,MBMSCs)的...
【关键词】 绝经后骨质疏松症；颌骨骨髓间充质干细胞；差异miRNA表达谱；
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【中文期刊】 蒋丽 何静 等 《医药前沿》 2024年14卷32期 1-7页
【摘要】 目的:明确慢性髓系白血病干细胞(CML-LSC)中关键基因模块和信号通路.方法:筛选基因表达综合数据库(GEO)中包含CML-LSC和正常造血干细胞(HSC)对照组的数据集,获得GSE5550、GSE43754、GSE479273个基因芯片...
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【中文期刊】 张路阳 韩文龙 等 《生物技术通报》 2023年39卷6期 248-258页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 TCP基因是植物特有的转录因子,对植物的生长发育起到重要的作用.鉴定烟草TCP基因家族,为烟草TCP基因功能研究及遗传改良提供理论依据.基于烟草全基因组数据,通过BLAST对烟草TCP基因家族进行鉴定,利用生物信息学的方法分析了该家族成员的...
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【中文期刊】 蔡伟 肖敬忠 等 《中草药》 2023年54卷13期 4295-4305页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 筛选使鱼腥草Houttuynia cordata具有不同环境适应性的候选Bzip基因,为后续繁育出具有更强环境适应性的鱼腥草品种奠定基础.方法 以鱼腥草转录组数据为基础,鉴定了HcbZIP基因家族成员,并对其理化性质、系统进化树、mo...
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【中文期刊】 汪向海 朱玉 《中华疾病控制杂志》 2023年27卷3期 281-287,344页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过对女性非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)相关基因的生物信息学分析和功能预测,探讨女性NSCLC的发病机制和预后生物标志物.方法 从基因表达综合数据库(Gene Expression O...
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【中文期刊】 孔腾 程灵婧 等 《中华疾病控制杂志》 2023年27卷10期 1193-1203页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 应用生物信息学方法分析确定原发性干燥综合征(primary Sj?gren's syndrome,pSS)患者和健康对照者的特征基因,在转录组学水平上为pSS的发病机制提供思路和理论依据.方法 从基因表达综合(gene express...
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【中文期刊】 张道平 刘起立 等 《中草药》 2022年53卷3期 788-798页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探究肝癌患者的差异基因表达量与预后的相关性,以及差异基因在多种癌症的调控作用,并寻找潜在的治疗靶点以及对应中药,为临床中药的使用、中医药组方及加减用药提供依据.方法 从TCGA数据库下载肿瘤患者的转录组数据以及相应临床数据,使用R语言...
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【中文期刊】 孙启芳 谭美玲 等 《中华养生保健》 2023年41卷19期 69-76页
【摘要】 目的 检索慢性萎缩性胃炎与胃癌的差异表达基因,探究胃癌转变的分子机制,发掘具有潜在治疗作用的中药及中药活性成分.方法 在GEO 数据库下载GSE116312 基因芯片数据集,得到差异表达基因,通过Metascape 数据库进行GO 和KEG...
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【中文期刊】 吴洁 马虹 《中国社区医师》 2023年39卷23期 59-61页
【摘要】 目的:采用生物信息学策略筛选肺动脉高压(PAH)的差异基因,为其治疗提供新靶点.方法:在基因表达综合数据库(GEO)中下载芯片数据集GSE113439,样本总数26例,正常组11例,PAH组15例.利用GEO2R进行数据分析,以|logFC...
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【中文期刊】 韩康 甘富元 等 《每周文摘·养老周刊》 2023年18期 16-18页
【摘要】 目的:旨在基于生物信息学分析肝癌Hub基因与差异基因的筛选与鉴定,并进行相关基因的突变序列分析.方法:我们首先获取了与肝癌相关的基因表达数据和临床数据,并对其进行了质控和预处理.接着,利用网络分析方法构建肝癌基因网络,并识别了网络中的Hub...
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【中文期刊】 郭维 陈敏 《医药前沿》 2023年13卷1期 6-8页
【摘要】 目的:采用生物信息学方法分析乳腺癌差异表达基因和相关信号通路,为乳腺癌治疗提供可能的靶点.方法:从公共基因芯片数据库GEO(gene expression omnibus)中下载GSE 162228基因芯片,R软件limma软件包筛选出差异...
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