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【中文期刊】 张虎 黄欣 等 《药学研究》 2023年42卷9期 654-660页 ISTICCA
【摘要】 目的 基于生物信息学和关联性图谱(CMap)数据库筛选肺癌相关基因及其潜在的治疗药物,为肺癌的治疗提供新思路.方法 从基因表达数据库(GEO)中选择GSE89039、GSE118370 和GSE136043,采用R软件筛选差异表达基因(DE...
【中文期刊】 张雨阳 赵莉 等 《南方农业学报》 2023年54卷3期 657-668页
【摘要】 [目的]基于转录组测序技术筛选出罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)雌雄样本脑和胸神经组织中的差异表达基因(DEGs),为揭示其生长发育的性别二态性及开展分子辅助育种提供理论依据.[方法]通过TRIzol提取罗氏沼...
【中文期刊】 潘以红 范雪萌 等 《生物学杂志》 2019年36卷2期 22-27,40页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为了识别肺癌发展过程中的关键基因,揭示其发展的潜在机制,得到肺癌的预测模型,从GEO(Gene Ex-pression Omnibus)数据库下载了基因芯片GSE19188和GSE40791进行研究.首先对基因表达数据分析得到805个同趋势...
【关键词】 肺癌； 差异表达基因(DEGs)； 蛋白质交互(PPI)网络；
【中文期刊】 陈菁 郑伟 等 《西北植物学报》 2017年37卷3期 470-477页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 该研究采用Illumina Hi-Seq2500高通量测序技术,对叶背有纤维和无纤维发育的两组钩苞大丁草(Gerbera delavayi Franch.)叶片样品的cDNA进行转录组测序,分析其叶背毡毛纤维发育机理.测序结果得到了108 ...
【中文期刊】 康舒淇 朱田田 等 《中国药学杂志》 2024年59卷12期 1100-1109页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 对当归[Angelica sinensis(Oliv.)Diels]主栽品种"岷归1号"和"岷归2号"进行转录组测序差异比较分析,挖掘当归响应干旱胁迫关键基因.方法 以两品种当归的新鲜叶片和根组织为研究材料构建cDNA文库,利用二代高...
【中文期刊】 廖杨梅 赵国春 等 《生物技术通报》 2024年40卷7期 197-206页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]探究无患子(Sapindus mukorossi Gaertn.)雄性不育品种'琦蕊'雄花不同发育时期的细胞学特征及差异表达基因,为深入解析无患子雄性不育发生的分子机制提供理论依据.[方法]在观察雄花花药不同发育过程的细胞学特点基础...
【中文期刊】 刘亚娟 郑航辉 等 《微生物学报》 2024年64卷9期 3453-3473页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 ThiD在腾冲嗜热厌氧杆菌中由thiD编码,是硫铵素合成途径的关键酶.thiD的结构和功能已在真菌、酵母菌和植物中得到阐明.然而,thiD在嗜热生物中的功能仍不清楚.[目的]探讨腾冲嗜热厌氧杆菌的嗜热机制并揭示thiD在不同温度下的功能及在...
【中文期刊】 林玲 莫国东 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷4期 663-674页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 生长激素(growth hormone,GH)不仅能调节动物的代谢、生长、发育和生殖,也能调节动物的免疫系统.本研究旨在通过转录组测序及生物信息学技术分析GH影响J亚群禽白血病病毒(subgroup J avian leukosis vir...
【关键词】 差异表达基因(DEGs)； 生长激素(GH)； J亚群禽白血病病毒(ALV-J)；
【中文期刊】 蒲帝宏 叶姿妤 等 《生物学杂志》 2024年41卷2期 32-38页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为探究核糖体蛋白RPS6 亚基肽段对S180 肿瘤细胞基因表达的影响及抑制肿瘤细胞的关键分子和信号通路,以S180 荷瘤小鼠为模型,用RPS6 亚基肽段处理S180 荷瘤小鼠,对S180 肿瘤细胞进行Illumina测序获得差异表达的基因,...
【中文期刊】 丁宁 杨青山 等 《中国医学物理学杂志》 2024年41卷4期 512-520页 ISTICCSCD
【摘要】 目的:通过生物信息分析探索骨性关节炎中滑膜组织的基因变化.方法:从GEO数据库中获取GSE55235和GSE12021数据,分析数据得到差异表达基因(DEGs).再对DEGs进行功能富集分析、蛋白互作网路分析、hub基因分析等.最后分析预测...
【中文期刊】 李红 穆姣 等 《临床检验杂志》 2024年42卷6期 461-465页 ISTICCA
【摘要】 目的 应用生物信息学方法筛选系统性红斑狼疮(SLE)妊娠并发先兆子痫(PE)的关键基因,并分析其生物学功能.方法 从高通量基因表达(GEO)数据库下载SLE妊娠并发PE相关数据集GSE108497,利用R软件筛选差异表达基因(DEGs).采...
【中文期刊】 王晶 董辉 等 《生物信息学》 2024年22卷3期 183-191页 ISTIC
【摘要】 采用生物信息学方法,通过公共数据库,分析系统性红斑狼疮(SLE)N6-甲基腺苷(m6A)修饰谱系.基于公共数据建立SLE m6A传修饰表达谱,分析m6A相关的DEGs在SLE中的潜在作用;利用ADEx数据库获取DEGs,利用m6A GEO数...
【中文期刊】 翟立公 李港回 等 《微生物学报》 2023年63卷8期 3219-3234页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]研究高渗胁迫条件下德尔卑沙门氏菌(Salmonella enterica subsp.enterica Derby,S.Derby)的转录组调控机制,分析差异表达基因(differentially expressed genes,D...
【关键词】 高渗胁迫； 德尔卑沙门氏菌； 差异表达基因(DEGs)；
【中文期刊】 李鑫玉 唐秀琴 等 《中国酿造》 2024年43卷4期 123-128页
【摘要】 为探讨cdc50基因对酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)细胞功能的影响,该研究以PYM14质粒为模板,采用醋酸锂转化法对野生型酿酒酵母BY4742进行cdc50基因敲除,测定突变菌株Δcdc50生长情况,分别对野生...
【中文期刊】 何雅慧 陈芝涛 等 《中国医药科学》 2024年14卷9期 26-30页
【摘要】 目的 基于生物信息学分析探索肝细胞癌(HCC)中潜在的核心基因和关键通路,为HCC的诊断和治疗提供新思路.方法 本研究使用基因表达数据库(GEO数据库)下载数据集,通过GEO2R在线工具和韦恩图工具筛选出差异表达基因(DEGs),利用STR...
【中文期刊】 杨旻珉 屠海慧 等 《水生生物学报》 2023年47卷4期 581-593页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为探究罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)急性低温应激响应的基因表达模式,研究以罗氏沼虾成虾为研究对象,分别设置实验组(16℃)和对照组(24℃),实验组从24℃急性降温(2℃/1h)至16℃后的0、1h、3h、6...
【中文期刊】 张娟 高艳 等 《昆虫学报》 2023年66卷7期 896-908页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]本研究旨在筛选西方蜜蜂Apis mellifera采集蜂咽下腺中高表达的基因,为进一步筛选和研究蜜蜂采集行为相关基因提供依据.[方法]基于前期已获得西方蜜蜂3日龄工蜂(3d_W)、10日龄哺育蜂(10 d_N)、10日龄采集蜂(10...
【中文期刊】 永胜 高玉杰 等 《山西医科大学学报》 2023年54卷6期 791-799页 ISTICCA
【摘要】 目的 基于转录组学测序技术研究高原低氧条件下IL-17与Th17细胞信号通路诱导小鼠肾脏组织炎症发生机制.方法 C57BL/6小鼠分别饲养于海拔4 200 m(高原组)和海拔400 m(平原组)的环境下30 d,无菌取小鼠肾脏组织采用转录组...
【中文期刊】 顾凤群 李卫红 等 《西部中医药》 2023年36卷6期 44-50页 ISTIC
【摘要】 目的:探讨子宫内膜异位症发病机制的关键基因及相应的有效中药.方法:从基因芯片数据库(gene expression omnibus,GEO)下载有关子宫内膜异位症表达的GSE25628(数据集),利用在线GE02R筛选具有显著差异的差异表达...
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