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【中文期刊】 柳可心 马超 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷20期 4181-4189页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:葡萄糖代谢过程在维持机体正常生理功能中扮演着至关重要的角色,当葡萄糖代谢出现紊乱时,可能会导致一系列的健康问题.目前,骨关节炎中葡萄糖代谢相关分子机制和潜在基因靶点有待进一步研究.目的:通过生物信息学方法分析骨关节炎中葡萄糖代谢相关基...
- 概要:
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【中文期刊】 余帅江 沈鹏 等 《颈腰痛杂志》 2025年46卷1期 126-131页ISTIC
【摘要】 目的 分析坐骨神经痛患者的基因表达特征,探讨其发病机制中的潜在关键基因,为临床治疗提供新方向.方法 利用GEO数据库收集坐骨神经痛相关的基因表达数据,采用limma包进行差异表达基因分析,并通过基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百...
- 概要:
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【中文期刊】 李晨曦 石婕 等 《生物信息学》 2025年23卷1期 71-80页ISTIC
【摘要】 色素沉着绒毛结节性滑膜炎(Pigmented villonodular synovitis,PVNS)是一种可累及关节的腱鞘巨细胞瘤,类风湿性关节炎(Rheumatoid arthritis,RA)作为一种慢性自身免疫性疾病,二者都极少发生...
【关键词】 颞下颌关节;色素沉着绒毛结节性滑膜炎;类风湿性关节炎;
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【中文期刊】 马尧丹 俞晖 等 《中国兽医杂志》 2025年61卷5期 22-32页
【摘要】 为探究猪瘟病毒(CSFV)感染对猪睾丸支持细胞(ST)mRNA表达谱的影响,本试验以感染CSFV 24和48 h的ST细胞和未感染ST细胞为模型,通过蛋白免疫印迹试验(WB)和间接免疫荧光(IIF)染色检测CSFV E2蛋白的表达;构建4个...
【关键词】 猪瘟病毒(CSFV);猪睾丸支持细胞;mRNA差异表达;
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【中文期刊】 李亚晶 邓洪儒 等 《血管与腔内血管外科杂志》 2025年11卷2期 191-196页
【摘要】 目的 通过采用集成的生物信息学工具探索新的静脉血栓栓塞症(VTE)生物标志物和潜在的治疗靶点.方法 利用基因表达综合数据库(GEO)获取VTE患者和非VTE患者的基因数据.应用R4.2.0软件中的limma程序包筛选差异表达基因(DEG),...
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- 结论:
【中文期刊】 孙俊丽 王昭君 等 《中国医科大学学报》 2024年53卷9期 769-776页ISTICPKUCABP
【摘要】 目的 基于生物信息学方法筛选急性缺血性脑卒中(IS)后心功能不全的关键基因及信号通路.方法 从基因表达综合(GEO)数据库下载GSE102558数据集,以P<0.05且|log2FC|>0.6筛选差异表达基因(DEG).Cytoscape软...
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【中文期刊】 刘国红 任雨轩 等 《山东医药》 2024年64卷12期 37-41页ISTICCA
【摘要】 目的 筛选铁蓄积大鼠食管黏膜组织差异表达基因,并分析差异表达基因的生物学功能.方法 12只6周龄雄性SD大鼠随机分为铁蓄积组和对照组,每组6只,铁蓄积组隔天腹腔注射蔗糖铁溶液制备铁蓄积模型,对照组注射等量生理盐水,14周后取血和食管、肝等组...
- 概要:
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【中文期刊】 徐聪聪 叶燕平 等 《南昌大学学报(医学版)》 2024年64卷6期 42-49,79页ISTIC
【摘要】 目的 探索心肌缺血-再灌注(I/R)损伤中铁死亡相关基因的表达及功能,通过构建分子网络及其验证分析,为心肌I/R损伤的治疗提供新的分子靶点.方法 对GSE108940数据库中的基因表达数据进行标准化处理,利用火山图和热图筛选差异表达基因(D...
【关键词】 心肌缺血-再灌注损伤;铁死亡;差异表达基因;
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【中文期刊】 沈蓓蕾 李娜 等 《中国实验诊断学》 2024年28卷4期 455-462页ISTIC
【摘要】 目的 采用生物信息学方法从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中分析发掘有关多囊卵巢综合征(polycystic ovarian syndrome,PCOS)的重要基因并对其进行富集分析,为研究PCOS的...
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【中文期刊】 布娅·米然别克 贺欢 等 《临床消化病杂志》 2024年36卷4期 239-244页ISTICCA
【摘要】 [目的]通过生物信息学方法挖掘溃疡性结肠炎(ulcerative colititis,UC)致病关键基因.[方法]从公共基因芯片数据平台下载GSE53306和GSE38713基因芯片数据集,对UC活动期患者、UC静止期患者和健康志愿者进行分...
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【中文期刊】 崔永康 苟小军 等 《医学研究杂志》 2024年53卷12期 78-87页ISTIC
【摘要】 目的 探讨非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)的关键基因,构建NAFLD疾病进程的风险预测模型并进行验证.方法 基于GEO数据库中已有的NAFLD表达谱芯片数据集,采用差异表达基...
【关键词】 非酒精性脂肪性肝病;差异表达基因分析;KEGG通路富集分析;
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【中文期刊】 申杨 段子博 等 《天津医科大学学报》 2024年30卷5期 391-398页ISTIC
【摘要】 目的:利用生物信息学方法筛选外阴鳞状细胞癌(VSCC)的关键基因及分析免疫浸润特征.方法:从GEO数据库中下载VSCC相关基因表达数据,应用差异表达基因(DEGs)分析和加权基因共表达网络分析筛选出共同的DEGs,对DEGs进行富集分析.采...
【关键词】 外阴鳞状细胞癌;加权基因共表达网络分析;差异表达基因;
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【中文期刊】 田祚宁 邢凯 等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷5期 1947-1957页
【摘要】 [目的]整合中国地方猪和瘦肉型猪的转录组测序数据,鉴定中国地方猪和瘦肉型猪背最长肌组织中的差异表达基因(DEGs),找出导致二者肉质性状差异的潜在候选基因,以期为猪肉品质研究提供参考.[方法]整合自测数据以及NCBI-SRA数据库下载的中国...
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【中文期刊】 何茜 刘阳 等 《食品研究与开发》 2024年45卷5期 53-59页
【摘要】 以新资源食品蛹虫草作为富集载体,在培养基中添加不同浓度的铬元素,探究蛹虫草的耐铬能力和富铬作用,研究铬元素对蛹虫草产量和品质的影响,并基于转录组学分析蛹虫草富铬的作用机制.结果表明,当铬元素添加浓度为 400 μg/mL时,蛹虫草菌丝生物量...
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【中文期刊】 王俊丽 郭纪敏 等 《中国卫生标准管理》 2024年15卷15期 144-148页
【摘要】 目的 研究毗邻锌指结构域的溴结构域蛋白 2A(bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2,BAZ2A)促进子宫颈癌和肝癌发展的共同机制.方法 通过转录组测序获得子宫颈癌组和肝癌组...
【关键词】 毗邻锌指结构域的溴结构域蛋白2A;差异表达基因;GO富集分析;
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【中文期刊】 刘晓雅 常孟孟 等 《中国现代医生》 2024年62卷14期 6-10,18页
【摘要】 目的 利用基因共表达权重网络(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)探索与尿道下裂发病相关的潜在基因.方法 利用WGCNA算法将数据集GSE35034 处理并构建基因共表达权重...
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【中文期刊】 陈菊萍 王雨璇 等 《皮肤病与性病》 2024年46卷5期 319-323页
【摘要】 目的 利用生物信息学方法筛选出雄激素性脱发(AGA)的差异基因(DEGs)和可能与雄激素性脱发发病相关的通路,为AGA的发病机制和治疗方案提供新思路.方法 从GEO数据库下载雄激素性脱发相关基因芯片表达谱;筛选出DEGs并进行富集分析;基于...
- 概要:
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【中文期刊】 孙语新 龚晓娟 等 《法医学杂志》 2023年39卷5期 433-440页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 应用生物信息学方法筛选出经尸体检验确诊的婴儿猝死综合征(sudden infant death syn-drome,SIDS)和婴儿感染性猝死(infectious sudden death in infancy,ISDI)死者脑、心...
- 概要:
- 方法:
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【中文期刊】 袁悦 王雪妍 等 《微生物学杂志》 2023年43卷1期 20-31页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为挖掘微杆菌(Microbacterium sp.)XT11在黄原胶降解过程中起关键作用的功能基因,预测黄原胶降解通路,利用转录组测序技术对该菌株在不同碳源培养条件下的转录本进行测序,对差异基因进行功能富集分析.结果表明,菌株XT11以葡萄...
【关键词】 Microbacterium sp.XT11;黄原胶降解;转录组;
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【中文期刊】 高雅宁 李健 等 《中华临床免疫和变态反应杂志》 2023年17卷1期 27-33页ISTICCA
【摘要】 目的 通过生物信息学技术分析重症哮喘患者支气管内膜差异表达基因(DEGs)及其在重症哮喘发病中的可能作用.方法 从基因芯片公共数据库(GEO)下载重症哮喘患者支气管内膜研究芯片和测序数据,应用R和Rstudio软件中的limma包获得差异表...
- 概要:
- 方法:
- 结论: