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            【中文期刊】 周馨蓓  张伟  等 《环境与职业医学》 2022年39卷12期 1350-1358页ISTICPKUCSCD

            【摘要】 [背景]单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)和空间转录组测序技术的兴起使得肺部疾病得以深入研究,但这两者在矽肺中的研究甚少.[目的]利用scRNA-seq联合空间转录组测序技术探索矽肺巨噬细胞中差异表达基因(DEGs)和潜在诊断基因....

            【关键词】 矽肺单细胞RNA测序空间转录组测序

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            【中文期刊】 罗斯琦  娄世锋  《世界最新医学信息文摘》 2021年21卷67期 30-40,44页

            【摘要】 目的 通过全反式维甲酸(ATRA)处理后急性早幼粒细白血病(APL)NB4细胞基因表达谱分析寻找差异基因富集的信号途径,探讨全反式维甲酸治疗急性早幼粒细白血病的可能分子作用机制,同时筛选出信号通路中高表达提示预后不良的关键基因,为寻找AP...

            【关键词】 急性早幼粒细胞差异表达基因分析

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            【中文期刊】 陈晓松  刘超杰  等 《生物技术通报》 2024年40卷3期 135-145页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]从蛋白水平阐明水源拉梅尔芽孢杆菌(Rummeliibacillus suwonensis)的生长及己酸代谢机理,为水源拉梅尔芽孢杆菌的基因工程改造提供一定技术基础.[方法]以R.suwonensis 3B-1 为研究对象,应用串联质...

            【关键词】 TMT蛋白质组学Rummeliibacillus suwonensis己酸

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            【中文期刊】 徐宇航  薛栋  等 《中国普外基础与临床杂志》 2024年31卷3期 309-314页ISTICCA

            【摘要】 目的 探索引起十二指肠神经内分泌瘤合并肝脏和淋巴结转移的关键基因及转移的潜在分子机制.方法 对1例罕见的合并肝脏和淋巴结转移的十二指肠神经内分泌瘤患者的癌旁十二指肠上皮组织(简称"正常组织")、原发病灶、肝转移灶和淋巴结转移灶进行测序分析,...

            【关键词】 十二指肠神经内分泌瘤转移RNA测序

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            【中文期刊】 卜文超  陈世新  等 《上海口腔医学》 2024年33卷6期 600-607页MEDLINEISTICCSCDCA

            【摘要】 目的:确定唾液腺腺样囊性癌潜在的生物标志物,以进一步了解腺样囊性癌潜在的发病机制.方法:从NCBI GEO数据库下载2个微阵列数据集(GSE59701、GSE88804),用LIMMA软件包筛选SACC差异表达基因.WGCNA寻找与SACC...

            【关键词】 唾液腺腺样囊性癌机器学习加权分析

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            【中文期刊】 惠琪  高万鹏  等 《中国口腔颌面外科杂志》 2024年22卷3期 209-215页ISTICCA

            【摘要】 目的:探讨唾液腺腺样囊性癌(salivary adenoid cystic carcinoma,SACC)微环境中肿瘤相关巨噬细胞(tumor-associated macrophages,TAMs)外泌体miRNAs表达特征,分析其在SA...

            【关键词】 唾液腺腺样囊性癌肿瘤相关巨噬细胞

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            【中文期刊】 王家悦  陈朝霞  等 《中草药》 2023年54卷24期 8142-8152页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 基于基因调控网络分析银屑病中细胞焦亡相关基因的表达模式,并探讨其在银屑病的发生和发展中的作用,以寻找可能的治疗方案.方法 使用NCBI基因表达Omnibus数据库获取银屑病患者皮损区和非皮损区样本的基因表达数据集.利用limma算法筛...

            【关键词】 细胞焦亡STAT3-CASP4/5通路银屑病

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            【中文期刊】 杨洋  朱金成  等 《生物技术通报》 2023年39卷6期 259-273页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 棉花枯萎病是棉花生产中常见的一种病害,目前在海岛棉中发病严重,直接影响海岛棉产量和品质,对海岛棉产业发展造成巨大威胁.为解析棉花与枯萎病菌尖孢镰刀菌互作的分子机制,以尖孢镰刀菌侵染 48 h的抗感棉花根部组织及致病菌体为材料,利用RNA-s...

            【关键词】 尖孢镰刀菌棉花枯萎病

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            【中文期刊】 孔腾  程灵婧  等 《中华疾病控制杂志》 2023年27卷10期 1193-1203页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 应用生物信息学方法分析确定原发性干燥综合征(primary Sj?gren's syndrome,pSS)患者和健康对照者的特征基因,在转录组学水平上为pSS的发病机制提供思路和理论依据.方法 从基因表达综合(gene express...

            【关键词】 原发性干燥综合征生物信息学分析差异表达基因

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            【中文期刊】 余也可  丁若仪  等 《中国口腔颌面外科杂志》 2023年21卷4期 332-339页ISTICCA

            【摘要】 目的:以单细胞分辨率解析髁突软骨及骨髓的细胞组成与功能,及其在异常咬合应力下导致的颞下颌关节骨关节炎(temporomandibular joint osteoarthritis,TMJOA)中的变化.方法:构建大鼠单侧反(胎)(unila...

            【关键词】 颞下颌关节骨关节炎异常咬合单细胞转录组测序

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            【中文期刊】 凌华云  吴玲玲  等 《中华疾病控制杂志》 2022年26卷6期 715-722页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 初步探究系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)和原发性干燥综合征(primary Sj?gren's syndrome,pSS)的共同基因表达特征和分子机制.方法 利用基因表达综合数据库(G...

            【关键词】 系统性红斑狼疮原发性干燥综合征Ⅰ型干扰素

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            【中文期刊】 徐军  王瑞  等 《生物技术通报》 2019年35卷12期 76-84页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 应用转录组测序技术(RNA-seq)筛选鼠伤寒沙门菌baeSR和acrB相关的靶基因,为鼠伤寒沙门菌耐药机制的深入研究奠定基础.采用RNA-seq技术分析baeSR和acrB基因缺失后表达量变化的相关耐药基因,通过GO富集和KEGG通路探索...

            【关键词】 鼠伤寒沙门菌baeSRacrB

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            【中文期刊】 于海亮  邹文斌  等 《生物技术通报》 2019年35卷11期 64-71页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 为了探究京海黄鸡感染柔嫩艾美尔球虫(E.tenella)后盲肠组织差异表达基因,以及球虫感染分子应答过程和免疫应答机制,试验采用RNA-seq技术对E.tenella感染和非感染组第7天的盲肠组织进行转录组测序,筛选差异表达基因,并进行差异...

            【关键词】 京海黄鸡柔嫩艾美尔球虫盲肠

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            【中文期刊】 唐仕云  杨丽涛  等 《生物技术通报》 2018年34卷12期 116-124页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 对低温胁迫和常温处理的桂糖08-1180和ROC22进行转录组测序,比较不同甘蔗品种抗寒性分子机制的差异.结果表明:测序共产生57.41 G 的clean bases,拼接后获得183 515个unigenes,将获得的基因在NR、NT、S...

            【关键词】 甘蔗低温胁迫转录组

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            【中文期刊】 刘思嘉  田菲  等 《生物技术通报》 2018年34卷11期 168-178页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 检测低温耐受与低温敏感鲤品种低温胁迫下的差异表达基因,探究鲤低温适应的分子应答过程.低温胁迫后对松浦镜鲤及荷包红鲤肝胰腺进行转录组测序,并对表达差异基因进行功能、通路富集分析.通过差异表达分析,共获得10 521个差异表达基因,其中5 24...

            【关键词】 低温耐受肝胰腺

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            【中文期刊】 荣成博  赵爽  等 《生物技术通报》 2018年34卷4期 115-120页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 白灵侧耳色泽洁白,营养丰富,且具有抗肿瘤、增强免疫力等多种功效,是我国具有自主知识产权的珍稀食用菌品种.探索白灵侧耳子实体发育相关基因能够为分子辅助育种提供有效、快速标记.实验前期获得了两株白灵侧耳双核菌株,JZB2106010能够结实形成...

            【关键词】 白灵侧耳子实体发育转录组

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            【中文期刊】 刘文荣  丁若凡  等 《生物技术通报》 2017年33卷7期 210-215页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 旨在探索多肽9R-P201处理肝癌HepG2细胞后基因融合、单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)突变、可变剪接等事件,并分析差异表达基因所参与的生物学进程与信号通路,以期解析多肽9R-P20...

            【关键词】 9R-P201肝细胞癌转录组测序

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            【中文期刊】 曹萌  孙凤梅  等 《环境与职业医学》 2017年34卷7期 577-585页ISTICPKUCSCD

            【摘要】 [目的]应用转录组测序(RNA sequencing,RNA-seq)技术,研究苯对小鼠骨髓细胞转录组表达和信号通路的影响,为苯对小鼠骨髓细胞毒性的可能作用机制提供科学线索.[方法]将C3H/He小鼠随机分为苯暴露组[160mg/(kg·d...

            【关键词】 RNA-seq骨髓细胞

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            【中文期刊】 刘汉勇  马华林  《中国热带医学》 2017年17卷7期 668-674页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 探讨来源于Alport综合症患者尿肾状杆细胞诱导分化的多能诱导干细胞差异性表达转录组基因.方法通过高通量测序平台,寻找来源于Alport综合症患者与正常者有意义差异性表达转录组基因,差异性表达的转录组基因借助功能注释软件对其参与生物过...

            【关键词】 Alport综合症转录组多能诱导干细胞

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            【中文期刊】 杨亚蓝  郭志云  等 《生物技术通报》 2016年32卷6期 244-249页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 旨在研究阿霉素诱导引起的DNA损伤压力下,肝癌细胞HepG2中参与DNA损伤应答的miRNA,并分析这些miRNA靶基因参与肝癌DNA损伤应答相关的生物学进程与通路。通过小RNA测序检测阿霉素处理肝癌细胞HepG2前后miRNA的差异表达情...

            【关键词】 阿霉素肝细胞癌DNA损伤

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