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【中文期刊】 王旭东 吴亮 等 《传染病信息》 2023年36卷3期 199-207页ISTIC
【摘要】 目的 基于癌症基因组图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)、高通量基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)及人类蛋白质图谱数据库(Human Protein Atls,HPA)...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 方琼 钱卫斌 等 《亚太传统医药》 2022年18卷7期 147-154页
【摘要】 目的:利用特定生物医学数据库,挖掘甲状腺结节、乳腺结节、子宫肌瘤3种疾病间的分子关联网络.结合网络药理学方法,构建"疾病-共有靶点-中医症状-成分-中药"网络,阐释中医"异病同治"的理论物质基础.方法:通过DisGeNET、Gencards...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 叶星 刘仁仪 《中国组织工程研究》 2025年29卷24期 5237-5244页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:海马体对认知功能至关重要,运动有望提升认知并缓解认知衰退,然而其分子机制尚不明了.生物信息学通过分析运动对海马体分子表达的影响,从而揭示关键机制,为理解运动如何促进认知及制定干预策略提供新的视角.目的:采用生物信息学方法深入分析自主运...
- 概要：
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【中文期刊】 裴珍珍 张珊 等 《中国糖尿病杂志》 2025年33卷1期 28-35页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨程序性细胞死亡(PCD)对DKD发生发展的作用机制.方法 检索基因表达综合数据库,获取数据集GSE30529和GSE30122,分析DKD差异表达基因(DEGs).通过基因集富集分析网站、铁死亡数据库、自噬数据库并结合既往相关文献...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 石长玉 李勇 等 《吉林大学学报（医学版）》 2025年51卷3期 703-715页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:基于生物信息学方法分析补体替代途径对小鼠结直肠癌(CRC)肝转移模型的调控作用,并进行实验验证.方法:以"CRC肝转移"为关键词在基因表达综合(GEO)数据库中进行检索,获取GSE81558 GEO数据集,包括正常结肠组织样本、CRC...
- 概要：
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【中文期刊】 高丽娜 张炎 等 《胃肠病学和肝病学杂志》 2025年34卷7期 954-962页ISTICCA
【摘要】 目的 基于TCGA数据库探讨坏死性凋亡相关基因(necroptosis-related genes,NRGs)对结肠癌预后的预测价值.方法 从TCGA数据库获取358例患者的RNA高通量测序(RNA-sequencing,RNA-seq)数...
【关键词】 癌症基因组图谱数据库；坏死性凋亡；结肠癌；
- 概要：
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【中文期刊】 叶泽麒 袁崧展 等 《环球中医药》 2025年18卷4期 736-750页ISTICCA
【摘要】 目的 基于生物信息学及网络药理学分析肉苁蓉防治慢性心力衰竭(chronic heart failure,CHF)的分子作用机制.方法 采用 TCMSP、Swiss Target Prediction、ETCM、PharmMapper 及检索...
- 概要：
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【中文期刊】 王旭栋 李泽森 等 《山西医科大学学报》 2025年56卷8期 911-921页ISTICCA
【摘要】 目的 采用生物信息学联合蛋白质组学探究IgA肾病(IgAN)相关差异基因的表达,并筛选相关的靶向中药.方法 选取基因表达综合数据库(GEO)的GSE93798和GSE37460数据集,通过R语言筛选IgAN差异表达基因(DEGs),并采用火...
- 概要：
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【中文期刊】 吴波 王玥坤 等 《解放军药学学报》 2025年38卷4期 374-379页ISTICCA
【摘要】 目的 整合Toll样受体4(TLR4)在乳腺癌中基因和蛋白表达,分析其与免疫浸润之间的相关性,为今后乳腺癌治疗提供理论支持.方法 从TCGA数据库获取乳腺浸润性癌(BRCA)数据表达谱和临床信息,借助UALCAN数据库和R软件分析BRCA中...
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【中文期刊】 夏辰亮 张泽成 等 《合成生物学》 2025年6卷3期 547-565页
【摘要】 结构生物信息学聚焦于生物分子的三维结构及其功能,蛋白质的结构是其核心研究对象.深度学习引发的蛋白质结构预测革命,特别是AlphaFold2的突破,实现了仅凭氨基酸序列即可达到原子精度的蛋白质结构预测,从根本上重构了该领域的数据生态.统计物理...
- 概要：
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【中文期刊】 吴琼 丁寿鹏 等 《医学信息》 2025年38卷7期 10-17页
【摘要】 目的 探索GAS2L3 在肝癌中的表达,探讨其潜在的机制.方法 通过qRT-PCR技术检测GAS2L3 在肝正常组织和肝癌组织中的表达差异,用癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因表达综合数据库(GEO)进行验证,利用ROC曲线评价GAS2...
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【中文期刊】 尚多 武旭 等 《内蒙古师范大学学报（自然科学版）》 2025年54卷2期 111-119页
【摘要】 采用生物信息学方法探索与头颈鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)组织中铁死亡相关的基因,并探讨其与免疫细胞浸润及患者预后的相关性,为 HNSCC 患者提供新的分子靶点.通过 G...
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【中文期刊】 杨斯絮 于焱 等 《中国医药科学》 2025年15卷6期 4-7页
【摘要】 目的 探讨Polo样激酶1(PLK1)基因在肺腺癌(LUAD)中的表达、临床价值及与LUAD发生、发展的关系.方法 GEO数据库中筛选LUAD的差异表达基因并根据相关性强度确定核心基因.利用Oncomine数据库分析核心基因在LUAD中的表...
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【中文期刊】 戴恩龙 戴泓厚 等 《首都食品与医药》 2025年32卷14期 66-71页
【摘要】 目的 应用生物信息学方法筛选与骨髓增生异常综合征(MDS)预后相关的铁死亡基因(FBGs),建立预后评估模型并验证.方法 从癌症基因组图谱数据库(TCGA)和基因表达数据库(GEO)中获取MDS相关基因和临床资料.通过单因素Cox分析筛选预...
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【中文期刊】 韩维娜 徐晓庆 等 《中国组织工程研究》 2024年28卷16期 2568-2573页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:阿尔茨海默病的机制探究过程中揭示了生物信息学对共同靶点筛选的重要作用,能够利用其筛选结果为基础,探究药物对该疾病的治疗效果.目的:采用生物信息学与分子生物学等方法预测胰高血糖素样肽1受体激动剂利拉鲁肽治疗阿尔茨海默病的作用靶点.方法:...
【关键词】 阿尔茨海默病；利拉鲁肽；胰高血糖素样肽1受体；
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【中文期刊】 柴世凡 李欣儒 等 《中国组织工程研究》 2024年28卷20期 3235-3239页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:研究发现胰高血糖素样肽1及其类似物具有显著的神经保护作用,并且已有部分药物应用到阿尔茨海默病临床三期研究阶段,然而其发挥神经保护作用的具体机制尚不明确,有待进一步探讨阐明.目的:拟通过生物信息学和网络药理学分析方法筛选出阿尔茨海默病发...
【关键词】 DisGeNet数据库；阿尔茨海默病；索马鲁肽；
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【中文期刊】 靳帅 余一凡 等 《海南医学院学报》 2024年30卷2期 120-128页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:通过利用生物信息学技术分析肾移植后慢性排斥反应的差异表达基因,可以筛选出与该疾病发展相关的潜在致病靶点,为寻找新的治疗靶点提供了理论依据.方法:从基因表达谱综合数据库下载基因微阵列数据,并进行交叉计算以确定差异表达基因(DEGs).将...
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【中文期刊】 梁国新 郭畅 等 《西安交通大学学报（医学版）》 2024年45卷4期 567-574页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 评估miR-30a-5p作为急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)新诊断指标的潜力和潜在的分子机制.方法 下载GEO数据库中AMI相关microRNAs(miRNAs)和mRNA芯片数据集.qR...
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【中文期刊】 张弛可 王飞清 等 《中国组织工程研究》 2024年28卷31期 4995-5002页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:目前,关于急性髓系白血病骨髓微环境中的骨髓间充质干细胞生物学功能及分子改变尚不完全清楚.目的:综合生物信息学和细胞实验探究急性髓系白血病患者来源骨髓间充质干细胞的生物学功能改变,并探讨急性髓系白血病细胞条件培养液在其中的作用.方法:从...
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【中文期刊】 陈冠廷 张琳琪 等 《中国组织工程研究》 2024年28卷32期 5122-5129页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:自噬及铁死亡在慢性肾病的病程发展过程中发挥着重要作用,但目前对于慢性肾病肾组织自噬及铁死亡相关分子机制及基因靶点尚不清楚.目的:基于生物信息学筛选慢性肾病相关数据集中差异表达基因,并探讨其中适合作为筛查慢性肾病患者肾功能进展的潜在关键...
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