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【中文期刊】 杨伟玮 汪曣 等 《中国微生态学杂志》 2018年30卷3期 368-372,封3页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)因其具有快速、准确、高通量等特点在食品微生物检测和临床微生物鉴定领域有广泛的应用.对MALDI-TOF MS数据的预处理和分析是微生物鉴定的关键步骤,通过对数据的处理可以从大量的数...
【关键词】 微生物鉴定；MALDI-TOF MS；数据分析方法；
- 概要：
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【中文期刊】 亓合媛 孙清岚 等 《微生物学报》 2017年57卷6期 932-941页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 高通量技术的迅猛发展促使微生物生态学研究获得了重大突破,掀起了元基因组学(Metagenomics)研究的热潮.元基因组学通常被定义为对未培养的环境样本中微生物群体的DNA序列分析.随着微生物组学数据的日益剧增,微生物大数据的高效管理与分析...
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【中文期刊】 徐军 刘翠翠 等 《中国生物工程杂志》 2014年34卷11期 42-46页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 研究产电微生物胞外电子传递过程和机制,发现与产电效率相关的关键基因、通路和代谢物,是微生物燃料电池研究中的关键技术.为了发现在胞外电子传递过程中起到关键作用的基因以及通路,首先利用比较基因组学的方法,以模式微生物大肠杆菌和同属希瓦氏菌的其他...
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【中文期刊】 周秋香 余晓斌 等 《生物技术通报》 2013年1期 49-55页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 代谢组学是系统生物学的重要组成部分,其通过研究生物体代谢物的变化来认识生命体的生理与生化状态,从而找出其中隐藏的规律.对代谢组学的含义,研究任务进行介绍；综述代谢组学的产生和技术平台及其在植物、微生物、疾病诊断及毒物学等领域的应用,并对代谢...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 许优沁 张庆芬 等 《解剖学报》 2017年48卷1期 37-42页ISTICCSCDCABP
【摘要】 目的 从基因水平揭示放射前后人外周血细胞的变化.方法 从基因表达数据库(GEO)中下载两组经放射处理后人外周血基因芯片数据,利用Qlucore Omics Explorer 3.0软件筛选差异表达基因,STRING、DAVID等在线分析工具...
- 概要：
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【会议论文】章小灵 中国菌物学会第六届会员代表大会(2014年学术年会)暨贵州省食用菌产业发展高峰论坛 2014年
【摘要】 真菌室生物信息学平台经过三年建设期,针对真菌和原核生物等微生物高通量测序数据,涵盖了功能基因组、比较基因组、转录组和系统生物学等全方位丰富的专业分析流程,目前已构建成国内先进的微生物数据专业分析平台,并建立对外服务、共享资源的合作模式.硬件...
- 概要：
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【学位论文】 作者：吴佳楠导师：周春光 吉林大学 计算机科学与技术 计算机应用技术（博士） 2013年
【摘要】 本文首先阐述和分析了基因表达数据分析方法的研究现状、研究方法以及所存在的问题,并在此基础上,提出了一套系统的基因表达数据分析工作流程,并结合已有聚类方法实现了一种新的基因表达模拟数据生成算法,重点研究了差异表达基因识别算法及其在蛋白质相互作...
- 概要：
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【中文期刊】 张伟 张纪阳 等 《生物化学与生物物理进展》 2011年38卷6期 506-518页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 作为发现疾病相关生物标志物的重要途径,定量研究已成为蛋白质组学的热点问题.随着实验方法的发展和改进,定量数据处理算法也在不断更新和完善.将现有的无标记定量方法归纳为需要/不需要鉴定结果两类方法,分析比较了两类方法的异同及优缺点,详细讨论了所...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 崔凯 吴伟伟 等 《生物技术通报》 2019年35卷7期 1-9页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 转录组(Transcriptome)是指特定细胞或组织中全部转录产物,包括信使RNA,核糖体RNA、转运RNA以及非编码RNA.高通量测序技术的快速发展,为从整体水平系统地研究转录组学研究提供快捷可靠的平台.综述了当前主流的高通量测序技术及...
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【中文期刊】 许亚昆 马越 等 《生物多样性》 2019年27卷5期 534-542页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 微生物在人类生活中无处不在,过去人们对微生物的认识仅停留在单菌培养和定性研究上,而测序技术的发展极大地促进了微生物组学的研究.越来越多的证据表明:人体共生微生物、特别是肠道微生物与人类健康息息相关.二代测序技术凭借其高通量、高准确率和低成本...
【关键词】 微生物；三代测序；16S/18S rRNA；
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【中文期刊】 沈应博 史晓敏 等 《生物工程学报》 2019年35卷4期 541-557页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 随着耐药细菌的大量出现及广泛传播, 细菌耐药性成为全球备受关注的问题.耐药细菌的特征如耐药基因、毒力因子、质粒分型等以及不同菌株间亲缘关系对于细菌耐药性流行病学及分子生物学的研究有着十分重要的意义.但是传统的技术手段如聚合酶链式反应 (Po...
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【中文期刊】 孟云霞 王小智 等 《中华医院感染学杂志》 2019年29卷16期 2414-2417,2444页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨重症感染患者的感染部位及病原微生物种类与降钙素原(PCT),D-二聚体水平的关系.方法 选择2015年4月-2017年12月海南医学院第二附属医院重症医学科收治的113例重症感染患者的资料进行回顾性分析,查阅所有符合条件患者的病历...
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【中文期刊】 乔红艳 郭邦俊 等 《中华医学杂志》 2019年99卷17期 1353-1357页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 心血管医疗正在转向精准医学的模式.各种影像技术在心血管疾病的诊断、治疗和预后管理中起着至关重要的作用.近些年来,心血管影像技术发展迅速,并产生大量的数据.心血管疾病中大数据分析的指数增长和生物信息学的进步使得心血管医疗发生革命性的变化,因此...
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【中文期刊】 李红新 卢迎瑞 等 《中国食品卫生杂志》 2019年31卷1期 13-16页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 调查北京市顺义区健康人群携带产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens,Cp)的生物特征,研究分离菌株携带产气荚膜梭菌肠毒素(Clostridium perfringens enterotoxin,Cpe)、β2毒力...
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【中文期刊】 李萌 尉婷婷 等 《生物多样性》 2019年27卷5期 480-490页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 环境DNA (eDNA)是指生物有机体在环境中(例如土壤、沉积物或水体)遗留下的DNA片段.eDNA技术是指从环境中提取DNA片段进行测序以及数据分析来反映环境中的物种或群落信息.与传统方法相比,eDNA技术具有高灵敏度、省时省力、无损伤等...
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【中文期刊】 关欣 张春雷 《中华皮肤科杂志》 2019年52卷2期 86-89页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 观察长期使用英夫利西单抗治疗中重度寻常性银屑病的疗效.方法 随访分析2016年3月至2018年5月在北京大学第三医院皮肤科应用英夫利西单抗治疗的中重度寻常性银屑病患者,纳入用药超过54周的患者.用药剂量5 mg/kg,总剂量以100 ...
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【中文期刊】 何大川 龚道明 等 《中华肿瘤防治杂志》 2019年26卷4期 239-244页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 肺癌是全球发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一,人类编码的FAM83A基因在肺癌中高表达.本研究探讨FAM83A基因表达与肺腺癌进展和转移关系,为临床肺腺癌治疗提供潜在靶点.方法 所有用于生物信息分析的数据均来自癌症数据库TCGA,Bio...
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【中文期刊】 朱婕 顾炎 等 《中国肿瘤生物治疗杂志》 2019年26卷5期 524-529页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨上皮细胞转化序列2 (epithelial cell transforming 2,ECT2)基因在人胰腺导管腺癌(pancreatic ductal adenocarcinoma,PDAC)中的表达及其对胰腺癌细胞增殖、凋亡的影...
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【中文期刊】 何政 吴慧 等 《中国普通外科杂志》 2019年28卷1期 58-63页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探究驱动蛋白家族成员15(KIF15)在肝癌中的表达以及与肝癌生物学行为的关系.方法:利用TCGA数据分析不同临床情况肝癌患者KIF15表达及其对肝癌患者生存率的影响.观察肝癌SMMC-7721细胞的KIF15表达下调后,增殖能力、细...
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【中文期刊】 赵桔超 朱彦辉 等 《生态学杂志》 2019年38卷4期 1083-1092页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 西双版纳是中国最大的热带雨林和国际上重要的生物多样性保护地区之一,研究该区域植被时空变化规律及其与气候因子的关系可为生态环境管理提供信息支撑.利用2001-2015年MOD13Q1数据并结合气象资料,采用空间自相关分析、线性回归分析及偏相关...
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