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【中文期刊】 赵沙 颜子娟 等 《生物化学与生物物理进展》 2022年49卷7期 1179-1191页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 几丁质是仅次于纤维素的第二大天然多糖,由N-乙酰-D-氨基葡萄糖聚合而成,具有重要的应用价值.自然界中几丁质可被细菌高效降解.细菌可分泌多种几丁质降解酶类,主要分布在GH18家族和GH19家族中.细菌中几丁质降解酶基因存在明显的基因扩增及多...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 龚海燕 张司臣 等 《生物医学工程学杂志》 2024年41卷3期 552-559页MEDLINEISTICPKUCA
【摘要】 高通量染色质构象捕获(Hi-C)技术的快速发展为染色质结构分析提供了丰富的基因组位点间交互作用数据,但目前基于Hi-C数据的已有拓扑相关结构域(TAD)识别方法存在准确率低、参数敏感等问题.在此背景下,本文设计并实现了一种基于空间密度聚类的...
【关键词】 高通量染色质构象捕获；拓扑相关结构域；染色质结构；
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【中文期刊】 李桂玲 张东军 等 《寄生虫病与感染性疾病》 2024年22卷2期 86-93页CA
【摘要】 目的 了解幽门螺杆菌空泡细胞毒素A(VacA)的结构和功能,并对其抗原表位进行分析.方法 采用生物信息学软件 ORF Finder、Protpapram、ProtScale、Cell-PLoc 2.0、SignalP-6.0、TMHMM-2...
- 概要：
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【中文期刊】 王珊珊 高琪 等 《基因组学与应用生物学》 2022年41卷2期 407-414页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 人Ⅱ型肝脏表达抗菌肽(LEAP?2)作为新型活性多肽,具有抑菌活性和调节体重的功能.为了深入认识人LEAP?2的基本信息,本研究利用在线生物软件和工具进行了全面系统的生物信息学分析.一级结构分析结果表明,人LEAP?2含有77个氨基酸残基,...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李丽竹 周必英 《中国血吸虫病防治杂志》 2022年34卷3期 286-291页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 对猪囊尾蚴排泄分泌抗原中差异表达蛋白富含亮氨酸重复序列结构域15(leucine-rich repeat containing 15,LRRC15)进行真核表达,并预测其抗原表位.方法 通过在线软件ExPASy-PortParam和P...
【关键词】 猪囊尾蚴；排泄分泌抗原；富含亮氨酸重复序列结构域15；
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- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张祥林 方欢 等 《生物化学与生物物理进展》 2018年45卷11期 1093-1105页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 对染色质三维结构的探究逐渐成为了解基因组功能与基因调控关系的必要手段.近年来,随着高通量染色体构象捕获(Hi-C)等技术的发展和高通量测序成本的降低,全基因组交互作用的数据量快速增长,交互作用图谱分辨率不断提高.这给三维基因组学发展带来机遇...
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【中文期刊】 杜倩倩 张智慧 等 《病毒学报》 2021年37卷1期 43-51页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 2019年12月,由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)在中国武汉暴发.SARS-CoV-2的基因组编码2种病毒蛋白酶,即木瓜样蛋白酶(Papain-like protease,PLpro)和3C样...
【关键词】 新型冠状病毒(SARS-CoV-2)；木瓜样蛋白酶(PLpro蛋白酶)；结构；
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- 结论：
【中文期刊】 黄晓慧 王炜莹 等 《中国病原生物学杂志》 2021年16卷6期 639-643,650页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 运用生物信息学软件预测生殖支原体P110蛋白的结构和功能.方法 从NCBI数据库中下载P110的氨基酸序列,通过ProtParam和ProtScale在线工具对蛋白的理化性质、亲疏水性质进行分析;利用SignalP-5.0和TMpre...
- 概要：
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【中文期刊】 陈利 李美娟 等 《基因组学与应用生物学》 2021年40卷5期 1976-1982页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为初步了解鹦鹉热衣原体(Chlamydia psittaci,Cps)巨噬细胞感染增强蛋白(macrophage infection po-tentiator,MIP)的生物学特征.本研究从美国国家生物技术信息中心(national cen...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 王寻 冯资权 等 《植物生理学报》 2021年57卷1期 69-84页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 NF-YA是植物中一类保守的转录因子,广泛参与调控植物生长发育与响应胁迫.苹果(Malus pumila)GDDH13高质量参考基因组的释放,为本文NF-YA的全基因组分析提供了基础.基于蛋白同源比对与结构域模型扫描2种生物信息学方法,共筛...
- 概要：
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【中文期刊】 吴倩 张昭寰 等 《基因组学与应用生物学》 2021年40卷9期 3115-3123页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)、荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)及恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)是重要的致病菌与腐败菌,极易形成生物被膜,对人类健康和食品质量...
【关键词】 假单胞菌；Pel胞外多糖转运系统；生物信息学分析；
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【中文期刊】 高婧华 陈晓文 等 《中国病原生物学杂志》 2021年16卷2期 150-154页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 应用生物信息学分析软件预测鸟分枝杆菌MAV-2052蛋白的结构和功能. 方法 利用在线uniprot蛋白数据库、ProtParam蛋白分析网站、在线Protcale、TMHMM(TMHMM Server V 2.0)和SignalP ...
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【中文期刊】 刘静 吴芳 等 《中国病原生物学杂志》 2021年16卷3期 274-281页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 应用生物信息学软件预测分析结核分枝杆菌潜伏感染相关蛋白Rv1733c的结构和功能.方法 采用生物信息学软件ORF Finder、Interproscan、SOSUI、Protpapram、ProtScale、Signal IP、Tmp...
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【中文期刊】 牛秋丽 邢绣荣 《华南国防医学杂志》 2022年36卷8期 615-620页ISTIC
【摘要】 目的 研究人血管紧张素转换酶2(angiotensin converting enzyme 2,ACE2)基因编码的蛋白分子结构,从生物信息学角度分析其与心肌损伤的联系.方法 利用生物信息学手段,对人ACE2蛋白的理化性质、信号肽、跨膜区、...
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【中文期刊】 文令军 王冰琦 等 《实用预防医学》 2022年29卷8期 934-938页ISTICCA
【摘要】 目的 采用多种生物预测软件分析人前列腺相关基因4(prostate-associated gene 4,PAGE4)的结构、功能.方法 用 ProtParam 在线工具分析 PAGE4 的理化性质,利用 NetPhos 3.1 Server...
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【中文期刊】 郑洋 王佳慧 等 《中华中医药学刊》 2020年38卷1期 157-160,后插20-后插21页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 运用生物信息学的各种方法,对TLR4基因的结构和功能进行深入分析.方法 依托生物信息学的各种软件,对TLR4基因启动子及其所编码的氨基酸理化性质、信号肽、跨膜结构、蛋白质的二级结构、蛋白质三级结构、蛋白质翻译后修饰、蛋白质相互作用进行...
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【中文期刊】 韩玲 王小芳 等 《中国病原生物学杂志》 2020年15卷10期 1171-1176页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 应用生物信息学软件预测结核分枝杆菌MprA(Rv0981)基因编码蛋白的结构和功能. 方法 从NCBI数据库中获得MprA的基因信息及其编码的氨基酸序列,通过Expasy提供的在线工具ProtParam和Protscale对蛋白的理化...
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【中文期刊】 李凯迪 程龙 等 《中国病原生物学杂志》 2020年15卷10期 1157-1164页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 预测微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum)假定棒状体蛋白1(putative rhoptry protein-1,CpPRP1)中Sushi结构域(CpSushi)蛋白片段的结构、理化性质、翻译后修饰位点及抗原表...
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【中文期刊】 朱凌倩 胡小康 等 《中国血吸虫病防治杂志》 2020年32卷6期 584-590页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 鉴定大劣按蚊Torso-like(tsl)基因及表达特征,为深入研究tsl基因功能提供理论基础.方法 根据黑腹果蝇和冈比亚按蚊tsl基因,检索大劣按蚊全基因组并鉴别大劣按蚊tsl基因,设计特异性引物,并采用PCR和逆转录PCR技术扩增...
【关键词】 大劣按蚊；Torso-like基因；鉴定；
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【中文期刊】 张娟 母童 等 《基因组学与应用生物学》 2020年39卷12期 5432-5441页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 极长链脂肪酸延伸酶蛋白家族(elongation of very-long-chain fatty acids,ELOVLs)是合成脂肪酸过程中的重要限速酶,主要调控血糖、血脂及一些代谢疾病的发生.为探究宁夏地方品种静原鸡ELOVL5基因编...
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