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【中文期刊】 张永振 屈勇刚 等 《中国人兽共患病学报》 2006年22卷3期 193-197,201页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的寻找适于汉坦病毒进行系统发生分析的系统发生树构建方法及其基因片段.选用GenBank中部分有代表性的汉坦病毒株,用M、S、M+S全序列,以及G1、G2的2003-2302、2741-2950核苷酸片段分别以邻位相连法(NJ)和最大简约法...
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【中文期刊】 聂滨 欧阳龙 等 《国际检验医学杂志》 2014年35卷4期 463,466页ISTICCA
【摘要】 目的 为进一步确定HIV-1M组基因分型的最佳区域.方法 从Genbank中筛选出对各成熟肽区域有注释来源,来自于不同国家地区的104条HIV-1M组全基因组序列.对序列的结构区域gag区、pol区、enV区及env的亚区域gp41和gp1...
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【中文期刊】 聂滨 唐昌伟 等 《泸州医学院学报》 2011年34卷2期 134-138页
【摘要】 目的:寻找HIV-1M组基因最佳构建进化树的分型方法.方法:从Genbank中筛选出对各成熟肤区域有来自于不同国家地区的104条HIV-1M组全基因组序列.对序列的结构区域ENV区分别建ML、MP、NJ系统进化树.结果:ML、MP、NJ能对...
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【中文期刊】 杨海 雷新耀 等 《职业与健康》 2009年25卷10期 1089-1090页ISTICCA
【摘要】 <篇首> 长期以来,对汉坦病毒(Hantavirus,HV)及宿主动物的研究主要在临床治疗、流行病学监测、血清学分型及宿主动物分类、地理分布及生态习性方面.近年来有关HV基因分型、病毒测序、重建系统发生树的开展日益增多,但关于种间系统演化关系、...
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【中文期刊】 李强 刘芳 等 《环境昆虫学报》 2023年45卷2期 480-485页ISTICPKUCSCD
【摘要】 气味结合蛋白OBPs在蜜蜂识别气味分子和生理反应的过程中起到了十分重要的作用.本研究通过利用生物信息学软件预测分析中华蜜蜂Apis cerana cerana气味结合蛋白基因OBP4(AcerOBP4)编码的蛋白理化特性和结构特征;采用ME...
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【中文期刊】 戴方伟 宋晓明 等 《中国实验动物学报》 2014年3期 44-49页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨PCR-测序法在啮齿类动物汉坦病毒临床检测中的应用价值。方法以Genbank 7种血清亚型24株汉坦病毒代表性毒株为基础,从病毒基因S片段序列设计引物,采用邻位相连法进行系统进化分析,以该方法对浙江省近年从野生啮齿类动物中临床分离...
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【中文期刊】 王曼 张锡林 等 《中国人兽共患病学报》 2013年29卷12期 1191-1195页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 扩增出斯氏并殖吸虫线粒体Cytb(cytochrome B)基因片段并测序,分析该基因对吸虫遗传分类的意义.方法 提取斯氏并殖吸虫成虫基因组DNA,PCR扩增线粒体Cytb基因,克隆质粒并测序.在NCBI的GeneBank中作相似性和...
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【中文期刊】 王作虪 安淑一 等 《中国公共卫生》 2008年24卷3期 341-343页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 分离鉴定2007年辽宁省蚊虫携带流行型乙型脑炎(乙脑)病毒及基因型别.方法 用细胞培养方法分离病毒,对致金黄色地鼠肾细胞系(BHK-21)细胞病变(CPE)的病毒进行逆转录-聚合酶链式扩增(RTPCR)检测;扩增的目标片段进行序列测定...
【关键词】 乙型脑炎病毒;逆转录-聚合酶链式扩增(RT-PCR);进化树分析;
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【中文期刊】 单祥年 施燕峰 等 《动物学杂志》 2004年39卷4期 35-39页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 利用已测定的鹿科麂亚科动物小麂、赤麂、黑麂的线粒体全基因组序列,统计它们各自连接在一起的13个蛋白编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个控制区序列的碱基长度和组成,计算rRNA基因遗传距离,估算分歧时间,比较蛋白编码基因的碱基...
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【中文期刊】 王作虪 韩悦 等 《中国卫生检验杂志》 2008年18卷5期 783-785页ISTIC
【摘要】 目的:了解辽宁省儿童诺如病毒感染情况.方法:用RT-PCR的方法对131份粪便标本进行检测.扩增出的目标片段克隆于T载体上测定序列,用Mega3.1软件、邻位相连法构建进化树.结果:共有22份粪便标本诺如病毒RT-PCR检测阳性.通过核苷酸...
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【中文期刊】 郜银涛 周燕妮 等 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 2016年44卷10期 83-90,99页
【摘要】 [目的]克隆青杆类伸展蛋白(extensin-like proteins,ELPs)基因PwELP1并分析该基因的表达特性,为研究ELP基因家族的功能奠定基础.[方法]以青杆cDNA文库为模板,用RACE-PCR方法克隆青杆类伸展蛋白编码基...
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【中文期刊】 梅雪芳 李树清 等 《中国畜牧兽医》 2015年42卷8期 1943-1949页
【摘要】 本试验将从犬猫肠道中分离的钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫用盐酸卡红染色后观察其形态学特征;PCR扩增其ITS2基因序列并测序,并将测序结果与GenBank同属异形科的多棘单睾吸虫和横川后殖吸虫序列进行比对;应用Mega 6.05软件采用邻位相连...
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【中文期刊】 尹继庭 孙浩 等 《西部林业科学》 2013年42卷4期 52-57页
【摘要】 2012年首次对杜鹃花科越桔属植物樟叶越桔原变种6’-O-咖啡酰熊果苷高产株的内转录间隔区(ITS)序列进行了PCR扩增和序列测定.通过BLAST同源搜索,采用邻位相连法构建了与其亲缘关系接近的越桔属8个种(或变种)的系统发育树,并分析了它...
【关键词】 杜鹃花科;樟叶越桔;6'-O-咖啡酰熊果苷;
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【中文期刊】 陈仕江 鲁增辉 等 《西南农业学报》 2013年26卷5期 1809-1813页
【摘要】 以我国重要的中药资源芫菁科7种斑蝥为研究对象,分析线粒体COI基因序列,探讨COI基因作为DNA条形码在鉴定药用斑蝥基源方面的可行性.采用MEGA 5.0软件分析了不同种之间的碱基组成、遗传距离,利用邻位相连法(NJ)和最大简约法(MP)分...
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【中文期刊】 李睿 沈汪洋 等 《安徽农业科学》 2011年39卷4期 1891-1892,1894页
【摘要】 [目的]指导白酒生产,提高白酒质量.[方法]采用平板分离法从观音土曲中分离到7株乳酸菌(B1~B7),测定其发酵产乳酸的量.选取乳酸产量最高的1株菌B7,提取其DNA并进行16S rDNA的PCR扩增、克隆、测序.从GenBank中选取与B...
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【中文期刊】 毕旺来 戴诗皎 等 《安徽农业科学》 2011年39卷31期 19599-19601,19609页
【摘要】 [目的]对某企业生产的真空包装卤鸭制品进行微生物检测与分析.[方法]按国标方法对抽样产品进行菌落总数测定,运用聚合酶链式反应(PCR)技术扩增分离菌株16S rDNA序列并测序,序列比对后用邻位相连法构建进化树.[结果]产品中污染有耐热的巨...
【关键词】 微生物检测;16S rDNA-PCR;危害分析与关键控制点(HACCP)体系;
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【中文期刊】 李睿 戴诗皎 等 《食品科学》 2010年31卷21期 236-238页
【摘要】 对一株从食品中分离的非O157产志贺毒素1型大肠杆菌(EC6)进行研究.将该菌株所产志贺毒素Stx1用PCR扩增stx1基因全长并克隆测序,其stx1基因与GenBank数据库收录的stx1基因最高同源性为99%,表明EC6发生了一定程度的...
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【中文期刊】 李睿 孙言凤 等 《中国酿造》 2010年9期 65-67页
【摘要】 将一株大肠杆菌O157PCR扩增stx2基因全长并克隆测序.该菌株stx2基因与GenBank数据库收录的stx2基因最高同源性为98%,在3个核苷酸位点存在基因突变.采用邻位相连法构建进化树,序列分析结果表明O157为stx2c因亚型.了...
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【中文期刊】 李睿 张忠美 等 《武汉工业学院学报》 2010年29卷1期 1-3,6页
【摘要】 对现有的NCBI GenBank数据库大肠杆菌志贺毒素基因序列分子进化开展研究.采用邻位相连法构建进化树,并结合大肠杆菌菌株采集年代、采集地点、宿主类型等流行病学信息,分析大肠杆菌致病菌的流行规律,为预防、控制和检测大肠杆菌致病菌提供理论支...
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【中文期刊】 刘媛 王文博 等 《微生物学通报》 2017年44卷11期 2708-2713页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]建立快速获取55型腺病毒的全长基因组序列的方法.[方法]根据55型腺病毒的基因组特点,设计覆盖55型腺病毒基因组序列的12对引物,分别以55型腺病毒DNA为模板,扩增得到12个PCR产物,通过对12个PCR产物测序及序列拼接,获得5...
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