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【中文期刊】 Qiang He Dan Ma  等 《植物学报（英文版）》 2023年65卷6期 1423-1441页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Common buckwheat(Fagopyrum esculentum)and Tartary buckwheat(Fagopyrum tataricum),the two most widely cultivated buckwhea...

【关键词】 buckwheat； comparative genomics； flavonoid bio-synthesis；

【中文期刊】 Qiang He Yuqing Miao  等 《植物分类学报》 2024年62卷6期 1085-1102页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

【摘要】 Reynoutria multiflora is a widely used medicinal plant in China.Its medicinal compounds are mainly stilbenes and anthraq...

【关键词】 comparative genomics； genome assembly； Reynoutria multiflora；

【中文期刊】 Le Zhao Jiaqing Yuan  等 《动物学研究》 2024年45卷5期 1147-1160页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

【摘要】 Horseshoe bats(genus Rhinolophus,family Rhinolophidae)represent an important group within chiropteran phylogeny due to t...

【关键词】 Reference-quality genome； Comparative genomics； Population genomics；

【中文期刊】 苏相年 杨选文  等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷8期 1340-1352页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 油棕(Elaeis guineensis)是棕榈科(Arecaceae)油棕属(Elaeis)重要的产油物种,具有较高的经济价值,在全球热带和亚热带地区被广泛栽培利用.为探究油棕线粒体基因组特征及线粒体基因组系统发育关系,本研究利用三代测序...

【关键词】 油棕； 线粒体基因组； 结构特征；

【中文期刊】 李震 黄强  等 《昆虫学报》 2024年67卷11期 1515-1524页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 [目的]油茶地蜂Andrena camellia是油茶Camellia oleifera最关键的授粉者之一.本研究旨在构建油茶地蜂全基因组图谱,并与蜜蜂科(Apidae)其他物种基因组进行比较,以探究油茶地蜂在进化上与蜜蜂科其他物种之间的近...

【关键词】 油茶地蜂； 基因组； 比较基因组；

【中文期刊】 尹以杭 原晓龙  等 《西部林业科学》 2024年53卷3期 1-11页

【摘要】 为了解高黎贡牛樟芝线粒体基因组的特征及系统发育,本研究利用高通量测序技术对高黎贡牛樟芝线粒体基因组进行测序组装、注释并对其组成特征与其他多孔菌目真菌的线粒体基因组进行比较分析.结果显示:(1)获得完整的高黎贡牛樟芝线粒体基因组,其大小为 1...

【关键词】 高黎贡牛樟芝； 线粒体基因组； 比较基因组；

【中文期刊】 罗婷 韩著  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷5期 2154-2167页

【摘要】 旨在进一步完善牛支原体全基因组数据库,阐明其生物学功能和遗传进化关系,对西藏牦牛源牛支原体T10株进行了全基因组测序及其序列分析.使用Nanopore和Illumina PE150测序平台对T10株进行全基因组序列测定,利用生物信息学对其进...

【关键词】 牦牛； 牛支原体； 全基因组测序；

【中文期刊】 张梦洁 杨秀瑶  等 《广西植物》 2023年43卷10期 1849-1860页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 轮叶蒲桃(Syzygium grijsii)系桃金娘科(Myrtaceae)蒲桃属(Syzygium)常绿灌木,其开发前景较好,但其叶绿体基因组特征及系统发育关系尚未有相关报道.为弥补轮叶蒲桃基因组学方面的空缺,该文对轮叶蒲桃的叶绿体基因组...

【关键词】 轮叶蒲桃； 叶绿体基因组； 系统发育关系；

【中文期刊】 夏凯 刘芳美  等 《遗传》 2023年45卷10期 904-921页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 解脂亚罗酵母(Yarrowia lipolytica)是赤藓糖醇生产中使用的主要菌种,复合诱变是选育优良菌株的常用方法.然而,诱变处理所引起的基因组变化尚待探索.本研究对前期获得的高产菌株 CA20 和原始菌株 WT5进行基因组测序,并与已...

【关键词】 解脂亚罗酵母； 赤藓糖醇； 比较基因组；

【中文期刊】 Jacqueline Rehner Georges Pierre Schmartz  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年20卷2期 405-417页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 High-quality DNA extraction is a crucial step in metagenomic studies.Bias by different isolation kits impairs the compar...

【关键词】 Whole-genome analysis； Comparative genomics； Short-read sequencing；

【中文期刊】 郭鑫瑶 季晶焱  等 《贵州医科大学学报》 2023年48卷9期 1003-1012页 ISTIC

【摘要】 目的 探讨41株戈登菌的系统发育学及其基因组中含碳水化合物活性酶、次级代谢产物生物合成基因簇的种类及多样性.方法 以公开发表的41株戈登菌全基因组数据为研究对象,利用原核生物泛基因组学分析的自动化软件对泛基因组特征进行分析,结合直系同源蛋白...

【关键词】 基因组； 戈登菌属； 16S小亚基核糖体RNA；

【中文期刊】 许婷婷 司静  等 《食品研究与开发》 2023年44卷18期 185-192页

【摘要】 长双歧杆菌由于其具有的益生功能而备受关注,该文旨在基于全基因组分析,揭示长双歧杆菌W13(Bifi-dobacterium longum W13)的基因特性,分析其功能基因和代谢通路.结果表明,长双歧杆菌W13隶属于长亚种,通过直系同源蛋白...

【关键词】 益生菌； 长双歧杆菌； 基因组；

【中文期刊】 韩国秀 张多英  等 《黑龙江大学自然科学学报》 2023年40卷3期 300-308页

【摘要】 菌株Y39-6是从哈尔滨周边地区地下水中分离的一株假单胞菌,具有异养反硝化和自养脱氮能力,由于假单胞菌属内的菌种鉴定存在复杂性,对菌株Y39-6的具体分类仍有争议.通过获得菌株Y39-6的全基因组序列,进行比较基因组学分析,分析了菌株的碳源...

【关键词】 反硝化细菌； 假单胞菌； 基因组；

【中文期刊】 Longlong Gao Lijun Hao  等 《针灸和草药（英文）》 2023年3卷4期 323-332页

【摘要】 Objective:This work aimed to report the first complete mitochondrial genome(mitogenome)of Rheum palmatum,summarize the f...

【关键词】 Caryophyllales； Mitochondrial genome； Molecular identification；

【中文期刊】 Shi-Jian Zhang Lei Liu  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2020年18卷3期 321-332页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 The dynamic activity of transposable elements (TEs) contributes to the vast diversity of genome size and architecture am...

【关键词】 Brassicaceae； Comparative genomics； Gypsy retrotransposon；

【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2015年1期 73-76页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Since the proposal for pangenomic study, there have been a dozen software tools actively in use for pangenomic analysis....

【关键词】 Pangenomics； Pangenome； Comparative analysis；

【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2012年10卷2期 58-73页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 In the realm of bioinformatics and computational biology,the most rudimentary data upon which all the analysis is built ...

【关键词】 Genome assembly； Next-generation sequencing； Comparative assembly；

【中文期刊】 《植物分类学报》 2010年48卷2期 77-93页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

【摘要】 More than 190 plastid genomes have been completely sequenced during the past two decades due to advances in DNA sequenci...

【关键词】 chloroplast phylogenomics； comparative genomics； gene loss；

【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2009年7卷3期 143-146页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Circular genomes, being the largest proportion of sequenced genomes, play an important role in genome analysis. However,...

【关键词】 three dimensional； circular map； genome browser；

【中文期刊】 《基因组、蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2007年5卷1期 35-44页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 We have recently cloned a pathogen inducible blast resistance gene Pi-kh from the indica rice line Tetep using a positio...

【关键词】 comparative genomics； blast resistance gene； genome analysis；