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【中文期刊】 Xiao Wang Shuang Liang  等 《植物学报（英文版）》 2024年66卷11期 2329-2345页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 The utilization of metabolomics approaches to explore the metabolic mechanisms underlying plant fitness and adaptation t...

【关键词】 data mining； iterative WGCNA； metabolomics；

【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2018年16卷2期 144-151页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 High-throughput RNA-seq has revolutionized the process of small RNA(sRNA)discov-ery, leading to a rapid expansion of sRN...

【关键词】 Small RNA； RNA-seq data analysis； tsRNA；

【中文期刊】 李文轲 李丰余  等 《遗传》 2014年6期 620-626页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 二代测序技术的发展对测序数据的处理分析提出了很高的要求。目前二代测序数据分析软件很多,但是绝大多数软件仅能完成单一的分析功能(例如：仅进行序列比对或变异读取或功能注释等),如何能正确高效地选择整合这些软件已成为迫切需求。文章设计了一套基于 ...

【关键词】 二代测序； 自动化数据分析； 流程；

【中文期刊】 Weiran Chen Md Wahiduzzaman  等 《定量生物学（英文版）》 2022年10卷4期 333-340页

【摘要】 Background:Single-cell RNA sequencing(scRNA-seq)technology is now becoming a widely applied method of transcriptome expl...

【关键词】 Single-cell RNA sequencing； cell-type； data processing；

【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2018年16卷5期 365-372页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Interactions between chromatin segments play a large role in functional genomic assays and developments in genomic inter...

【关键词】 Chromatin interaction； Pipeline； Hi-C data normalization；

【外文期刊】 Dinov, Ivo D. ; Petrosyan, Petros ; 等 《Brain imaging and behavior》 2014年8卷2期 311-322页

【关键词】 Aging; Pipeline; Neuroimaging;

【外文期刊】 Gadermayr, Michael ; Gupta, Laxmi ; 等 《IEEE Transactions on Medical Imaging》 2019年38卷10期 2293-2302页

【关键词】 Image segmentation; Training; Adaptation models;

【外文期刊】 Michael R. Hoopmann ; Jason M. Winget ; 等 《Journal of proteome research》 2018年17卷3期 1314-1320页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 automation; data analysis pipeline; label-free quantification;

【外文期刊】 Jochen Singer ; Anja Irmisch ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2019年20卷3期 778-788页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 cancer; molecular tumor board; data analysis pipeline;

【外文期刊】 Bolte, Fabian ; Bruckner, Stefan ; 《Molecular human reproduction.》 2021年27卷7期 3153-3167页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Data visualization; Visualization; Tools;

【外文期刊】 Torkamaneh, Davoud ; Laroche, Jerome ; 等 《Genome》 2020年63卷11期 577-581页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 genotyping-by-sequencing; GBS data analysis; bioinformatics pipeline;

【外文期刊】 Anslan Sten ; Bahram Mohammad ; 等 《Molecular ecology resources》 2017年17卷6期 e234-e240页

【关键词】 high‐throughput sequencing; metabarcoding; pipeline;

【外文期刊】 Weiguang Ding ; Lin, E. ; 等 《IEEE Transactions on Medical Imaging》 2014年33卷8期 1749-1759页

【关键词】 biomedical optical imaging; cardiovascular system; image denoising;

【外文期刊】 Shaw, Rahul ; Tian, Xin ; 等 2021年14卷1期 115-126页

【关键词】 bioinformatics pipelines; cell types and states; plant development and physiology;

【外文期刊】 Arnau Montagud ; Pauline Traynard ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2019年20卷4期 1238-1249页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 pipeline of tools; logical modelling; genetic interaction;

【外文期刊】 Giovanna Nordio ; Rubaida Easmin ; 等 《Journal of Cerebral Blood Flow and Metabolism: Official Journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism》 2023年43卷8期 1285-1300页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 FDOPA PET; dopamine synthesis; data analysis pipeline;

【外文期刊】 Rudnick, Paul A. ; Markey, Sanford P. ; 等 《Journal of proteome research》 2016年15卷3期 1023-1032页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 proteomics data resource; bioinformatics; cancer;

【外文期刊】 Doblmann, Johannes ; Dusberger, Frederico ; 等 《Journal of proteome research》 2019年18卷1期 535-541页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 quantitative proteomics; mass spectrometry; label-free quantification;

【外文期刊】 Stefano,Buratti ; Matteo,Grenzi ; 等 《Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)》 2024年2798卷 45-64页

【关键词】 Data analysis pipeline; Fluorescent biosensors; Glutathione redox status;

【外文期刊】 Andreas,Wilke ; Elizabeth M,Glass ; 等 《Methods in enzymology》 2013年531卷 487-523页 MEDLINE

【关键词】 Automated analysis of metagenomes; Metadata-enabled data discovery; Metatranscriptomes and amplicon data;