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【中文期刊】 Ruicai Long Fan Zhang 等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年20卷1期 14-28页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Alfalfa(Medicago sativa L.)is the most important legume forage crop worldwide with high nutritional value and yield.For ...
【关键词】 Alfalfa； Autotetraploid； Genome assembly；
【中文期刊】 Jianjun Lu Cheng Pan 等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年20卷1期 42-59页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Wild castor grows in the high-altitude tropical desert of the African Plateau,a region known for high ultraviolet radiat...
【关键词】 Ricinus communis L.； Adaptive evolution； Selection signature；
【中文期刊】 Yinqing Yang Kang Zhang 等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年6期 1106-1118页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Rubus corchorifolius(Shanmei or mountain berry,2n=14)is widely distributed in China,and its fruits possess high nutritio...
【中文期刊】 Qiang He Yuqing Miao 等 《植物分类学报》 2024年62卷6期 1085-1102页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 Reynoutria multiflora is a widely used medicinal plant in China.Its medicinal compounds are mainly stilbenes and anthraq...
【关键词】 comparative genomics； genome assembly； Reynoutria multiflora；
【中文期刊】 Yong Zhang Hong-Wei Lu 等 《遗传学报》 2023年50卷10期 747-754页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 With the rapid development of sequencing technologies,especially the maturity of third-generation sequencing technologie...
【中文期刊】 李伟 朱明玉 等 《世界科学技术-中医药现代化》 2025年27卷1期 36-55页 ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 使用混合组装技术对采集的5种黄精属植物叶绿体基因组进行组装,利用比较基因组方法分析其种内及种间差异,探究其密码子使用模式及影响因素,并解析黄精属的系统发育关系.方法 本研究使用Unicycler软件混合组装5种黄精属植物的叶绿体基因组...
【中文期刊】 宫少达 谢文召 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷6期 933-942页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 高质量的参考基因组是基因组学研究的基础.目前,大多数的参考基因组仍然是不完整的.随着长读长测序技术的不断发展,完成端粒到端粒(telomere-to-telomere,T2T)基因组组装的物种越来越多.T2T基因组为深入研究着丝粒等复杂区域...
【中文期刊】 张以星 齐浥颖 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷8期 1293-1302页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 植物物种形成和多样化过程中,多倍化发挥着重要作用,它汇聚了新的等位基因,产生了多倍体.自然界中有许多重要作物是多倍体,相关研究发现,与二倍体植物相比,多倍体具有更强的抗逆性,能够适应更广泛的生态环境.本文简要介绍了植物多倍化及其影响,并总结...
【中文期刊】 Dake Zhao Ya Zhang 等 《植物学报（英文版）》 2023年65卷10期 2320-2335页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Diterpenoid alkaloids(DAs)have been often uti-lized in clinical practice due to their analgesic and anti-inflammatory pr...
【关键词】 Aconitum vilmorinianum； acute toxicity； biosynthetic pathway；
【中文期刊】 Yushan Zheng Deming Yang 等 《植物学报（英文版）》 2022年64卷3期 649-670页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Dendrocalamus latiflorus Munro is a woody clumping bamboo with rapid shoot growth. Both genetic transformation and clust...
【关键词】 alternative splicing； bamboo shoots； chromosome conformation capture sequencing；
【中文期刊】 Jie Zhu Liu Tian 等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年20卷2期 246-259页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 The oral cavity of each person is home to hundreds of bacterial species.While taxa for oral diseases have been studied u...
【关键词】 Metagenomics； Human oral microbiome； Metagenome-assembly genome；
【中文期刊】 王宇龙 李珂 等 《中国畜牧兽医》 2023年50卷10期 4085-4095页
【摘要】 第一、二代测序技术曾广泛应用于物种基因组组装,但随着基因组学研究的不断深入,其已无法满足全面检测基因组变异和完整解析基因组未知区域的需求.第三代测序技术使基因组测序迈入了长读长时代,基于三代测序数据的基因组组装已经成为各物种基因组学研究的主...
【中文期刊】 薛倩 邢伟杰 等 《中国畜牧兽医》 2023年50卷10期 3869-3881页
【摘要】 [目的]汶上芦花鸡为中国唯一的芦花羽地方鸡品种资源,芦花基因可伴性遗传,芦花羽性状可用于雏鸡的自别雌雄.试验旨在丰富家鸡基因组信息,获取汶上芦花鸡全基因组序列,为鸡伴性芦花羽分子机制研究提供材料.[方法]以汶上芦花鸡为试验动物,基于BGI ...
【关键词】 汶上芦花鸡； 基因组组装； PacBio三代测序技术；
【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2019年17卷3期 229-247页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 To unravel the genetic mechanisms of disease and physiological traits,it requires comprehensive sequencing analysis of l...
【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2018年16卷5期 373-381页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 The rapid development of high-throughput sequencing technologies has led to a dra-matic decrease in the money and time r...
【关键词】 Variant identification； Genome assembly； Genome annotation；
【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2012年10卷2期 58-73页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 In the realm of bioinformatics and computational biology,the most rudimentary data upon which all the analysis is built ...
【关键词】 Genome assembly； Next-generation sequencing； Comparative assembly；
【中文期刊】 张太奎 苑兆和 《遗传》 2018年40卷1期 44-56页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 植物古基因组学是基因组学一个新兴分支,从现存物种中重建其祖先基因组,推断在古历史中导致形成现存物种的进化或物种形成事件.高通量测序技术的不断革新使测序读长更长、更准确,加快了植物参考基因组序列的组装进程,为古基因组学研究提供了大批量可靠的现...
【中文期刊】 晋家正 李午佼 等 《四川动物》 2018年37卷2期 121-126页 ISTICPKU
【摘要】 以美洲大蠊Periplaneta americana为原料生产的康复新液等药品临床疗效显著,得到了广泛应用.本文以四川好医生攀西药业有限责任公司饲养的药用美洲大蠊为材料,首次采用Illumina HiSeq 2000和PacBio SMRT...
【中文期刊】 《定量生物学（英文版）》 2019年7卷4期 278-292页
【摘要】 Background:De novo genome assembly relies on two kinds of graphs:de Bruijn graphs and overlap graphs.Overlap graphs are ...
【中文期刊】 李智 王硕 等 《山东医药》 2016年56卷24期 5-8页 ISTICCA
【摘要】 目的：观察胃癌组织ATP酶α2亚基（ ATP1A2）表达情况，探讨其与黏着斑通路、细胞黏附分子、钙离子通路、细胞外基质相关信号通路的关系。方法从癌症基因组图谱（ TCGA）数据库下载并预处理胃癌RNASeqV2数据、从人类肿瘤相关基因表达汇...
【关键词】 胃癌； 癌症基因组图谱； 人类肿瘤相关基因表达汇编；
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