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【中文期刊】 Yinqing Yang Kang Zhang  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年6期 1106-1118页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Rubus corchorifolius(Shanmei or mountain berry,2n=14)is widely distributed in China,and its fruits possess high nutritio...

【关键词】 Rubus corchorifolius； Genome assembly； Resequencing；

【中文期刊】 Liming Zhao Lvfeng Yuan  等 《遗传学报》 2024年51卷8期 866-876页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 The phenotypic diversity resulting from artificial or natural selection of sheep has made a significant contri-bution to...

【关键词】 Hu sheep； Whole-genome resequencing； Selection signature；

【中文期刊】 Bo Song Weidong Ning  等 《分子植物（英文版）》 2023年16卷8期 1252-1268页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Advances in DNA sequencing technology have sparked a genomics revolution,driving breakthroughs in plant genetics and cro...

【关键词】 WGRS； WGS； resequencing；

【中文期刊】 De-Yin Zhang Xiao-Xue Zhang  等 《动物学研究》 2022年43卷5期 695-705页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

【摘要】 The abundance of domesticated sheep varieties and phenotypes is largely the result of long-term natural and artificial s...

【关键词】 Sheep； Whole-genome resequencing； Selection signature analysis；

【中文期刊】 何健 郑伟杰  等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷6期 1010-1027页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 本研究利用选择信号分析方法在美系杜洛克猪和丹系杜洛克猪中筛选与重要经济性状相关的候选基因.选取健康状态良好、饲养管理水平一致的成年美系杜洛克公猪33头、丹系杜洛克公猪11头,提取DNA并重测序,利用Fst&Pi的联合分析,保留候选区域,对注...

【关键词】 选择信号分析方法； 杜洛克猪； 全基因组重测序；

【中文期刊】 王舒闻 王东  等 《四川动物》 2024年43卷1期 24-33页 ISTICPKU

【摘要】 藏羚Pantholops hodgsonii是藏羚属Pantholops现存的唯一物种,由于Y染色体基因较保守,基于近缘物种的Y染色体多态性遗传位点筛选受到了很大的限制.本研究对15份藏羚新鲜组织样品进行基因组重测序,生物信息分析筛选出Y染...

【关键词】 藏羚； 基因组重测序； Y染色体；

【中文期刊】 杜晓蓉 李琦  等 《植物遗传资源学报》 2024年25卷3期 451-461页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 连翘(Forsythia suspensa(Thunb.)Vahl)为多年生木本植物,花柱二型具有自交不亲和性.挖掘连翘异型花柱发育候选基因,利于揭示连翘异型花柱的进化与发育机理.对40株长花柱型与短花柱型连翘植株进行全基因组重测序,检测样...

【关键词】 连翘； 异型花柱； 全基因组重测序；

【中文期刊】 张鑫淼 赵春龙  等 《水生生物学报》 2024年48卷10期 1724-1735页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 为了从全基因组InDel角度进行全国地理尺度细鳞鲑属遗传分化与适应性研究,文章对采自陕西、甘肃、新疆、河北和黑龙江的6个细鳞鲑群体(共90尾样本)进行建库测序及InDel检测分析.结果表明:6个细鳞鲑群体共检测到3056034个高质量InD...

【关键词】 InDel； 全基因组重测序； 种群结构；

【中文期刊】 戎艳花 贾雪纯  等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷1期 160-171页

【摘要】 [目的]阐明晋南牛的遗传结构特征,通过选择信号检测挖掘与晋南牛经济性状相关的候选基因,探究其在进化过程中的受选择情况.[方法]对晋南牛和红安格斯牛全基因组测序数据进行分析,鉴定2个群体的单核苷酸多态性(single nucleotide p...

【关键词】 全基因组重测序； 晋南牛； 红安格斯牛；

【中文期刊】 石兰 马梅兰  等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷2期 624-638页

【摘要】 [目的]皮山红羊是分布于新疆和田地区的新发现多羔性地方绵羊品种.本研究基于全基因组重测序技术从基因组水平上了解皮山红羊的群体遗传结构及产羔性状受选择信号区域,并对候选基因进行验证.[方法]选择30只连续产2～3羔的经产皮山红羊母羊为高繁组(...

【关键词】 皮山红羊； 全基因组重测序； 选择信号；

【中文期刊】 任钰为 陈星  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷2期 502-514页

【摘要】 旨在通过研究文昌鸡进化过程的特征,深入理解影响产蛋性能的因素,为文昌鸡优良品种选育提供基础.本研究采集35只健康文昌鸡(35周龄,15公,20母)和30只健康江汉鸡(35周龄,10公,20母)的血液组织各3 mL提取DNA,采用全基因组重测...

【关键词】 文昌鸡； 全基因组重测序； 遗传选择；

【中文期刊】 张涛 李佳芪  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷8期 3427-3435页

【摘要】 旨在鉴定新疆褐牛基因组结构变异(structure variation,SVs)特征,并在此基础上探索新疆褐牛培育过程中受到影响的结构变异.本研究基于全基因组重测序数据,利用Manta、Delly、Lumpy三款软件对新疆褐牛及其父母本(瑞...

【关键词】 结构变异； 全基因组重测序； 群体结构分析；

【中文期刊】 万伟粲 张旭  等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷11期 4890-4898页

【摘要】 [目的]酃县白鹅是湖南地区优秀的地方鹅种,为了解酃县白鹅的保种效果,对保种场各家系进行保种工作的评估.[方法]从酃县白鹅保种场的42个家系中各选取1只公鹅,翅静脉采血,提取DNA,进行全基因组重测序.基于保种场42只酃县白鹅公鹅的重测序数据...

【关键词】 酃县白鹅； 全基因组重测序； 遗传多样性；

【中文期刊】 Zhen Wang Bangmin Song  等 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2024年15卷5期 1866-1880页

【摘要】 Background Long-term natural and artificial selection has resulted in many genetic footprints within the genomes of pig ...

【关键词】 Environmental adaptation； Local Chinese breeds； Pig；

【中文期刊】 马烨 刘玉强  等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷8期 3438-3446页

【摘要】 [目的]利用全基因组选择信号检测方法探索中国地方猪基因组中与体型相关的候选基因,分析中国地方猪在进化和驯化过程中的受选择情况.[方法]基于310头地方猪的全基因组重测序数据,利用跨群体扩展单倍型纯合(cross population ext...

【关键词】 中国地方猪； 选择信号； 全基因组重测序；

【中文期刊】 靳浩展 肖文婉  等 《广东畜牧兽医科技》 2024年49卷4期 1-8页

【摘要】 为了对E.necatrix ENYS株在生产中进行质控及对临床应用效果的监测,该研究对ENYS株和ENGD株进行全基因组重测序,结合生物信息学分析建立了一种TaqMan qPCR检测技术.结果显示,En-marker5测序结果与预期相符,最...

【关键词】 毒害艾美耳球虫； 减毒活疫苗； 全基因组重测序；

【中文期刊】 石庆珍 徐鸿洋  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷10期 4311-4324页

【摘要】 旨在用不同方法对微量细胞全基因组遗传变异进行检测和比较分析.本研究首先以3、5、7、10个猪耳缘成纤维细胞为试验材料,利用不同方法提取微量细胞基因组,进行全基因组测序(whole genome sequencing,WGS),比较不同细胞数...

【关键词】 微量细胞； 胚胎； 全基因组扩增；

【中文期刊】 刘思宇 张曼  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷9期 3876-3886页

【摘要】 旨在通过遗传多样性和群体结构分析,评估南阳牛的保种效果.本研究基于30头健康南阳牛的全基因组重测序数据,通过变异检测获得单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)信息,综合分析群体遗传多样性、群体...

【关键词】 南阳牛； 全基因组重测序； 遗传多样性；

【中文期刊】 梁慧丽 解玉静  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷11期 4968-4979页

【摘要】 旨在了解大尾寒羊基因组遗传变异特征和群体结构,可以为更好地保护和利用大尾寒羊提供指导.本研究对170只(66只公羊,104只母羊)大尾寒羊进行了全基因组重测序,利用GATK、Manta、Plink等软件对大尾寒羊基因组遗传变异、群体结构和连...

【关键词】 大尾寒羊； 全基因组重测序； 基因组变异；

【中文期刊】 刘珍妮 李建军  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷11期 4992-5002页

【摘要】 为了深入了解赣州番鸭的群体结构和遗传差异,本研究采集20只福建番鸭(FJ)、20只贵州天柱番鸭(TZ)、20只赣西北番鸭(GXB)和40只赣州番鸭(GZ)的血样用于全基因组重测序,测序深度为10 ×.随后,从NCBI数据库下载15只北京鸭(...

【关键词】 全基因组重测序； 赣州番鸭； 群体结构；