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【中文期刊】 蒋爽 滕元文 等 《西北植物学报》 2013年33卷11期 2354-2360页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 反转录转座子是真核生物基因组中普遍存在的一类可移动的遗传因子,它们以RNA为媒介,在基因组中不断自我复制.在高等植物中,反转录转座子是基因组的重要成分之一.反转录转座子可以分为5大类型,其中以长末端重复(LTR)类型报道较多.LTR类型由于...
【关键词】 反转录转座子；长末端重复(LTR)；预测；
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【中文期刊】 侯小改 张曦 等 《遗传》 2012年34卷11期 1491-1500页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 LTR 类反转录转座子(Long terminal repeat retrotransponson)是真核生物中的一类重要转座元件,具有分 布广泛、异质性高等特点,在真核生物基因组进化中起着重要作用,现广泛应用于植物的基因功能分析和遗传 多...
【关键词】 植物LTR类反转录转座子；序列比对；软件分析；
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【中文期刊】 程旭东 凌宏清 《遗传》 2006年28卷6期 731-736页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 反转录转座子是基因组进化的推动者之一,分为LTR和非LTR两种类型.前者是真核基因组的主要组分,结构和转座方式与逆转录病毒类似.后者是最初发现于动物基因组新近发现在植物基因组中也广泛存在的新型重复序列,包括LINEs(long inters...
【关键词】 非LTR反转录转座子；LINEs；SINEs；
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【中文期刊】 李智菲 李卫涛 等 《湖北农业科学》 2013年52卷17期 4235-4237页
【摘要】 采用LTR-FINDER软件对马铃薯(Solanum tuberosum)全基因组中的LTR反转录转座子进行分析,共发现4 725个全长LTR反转录转座子,平均长度约7 393 bp,其中反转录转座子的LTR平均长度为786 bp,全长LT...
【关键词】 LTR反转录转座子；马铃薯(Solanum tuberosum)；基因组；
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【中文期刊】 李卫涛 张焕丽 等 《湖北农业科学》 2013年52卷8期 1953-1955页
【摘要】 运用LTR-FINDER对葡萄(Vitis vinifera)基因组中的19条染色体LTR反转录转座子进行分析.结果表明,葡萄基因组中19条染色体上共检索到5 470个LTR反转录转座子,约占葡萄基因组10.7％.LTR反转录转座子分析为进...
【关键词】 葡萄(Vitis vinifera)；LTR反转录转座子；基因组；
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【中文期刊】 熊发前 刘菁 等 《植物科学学报》 2022年40卷1期 54-65页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 利用简并PCR技术从野生花生种(Arachis ipaensis Krapov.et W.C.Greg.)的基因组中扩增分离Ty1-copia类(1类)和Ty3-gypsy类(2类)反转录转座子RT基因,并对其序列特征、多样性、系统进化关系...
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【中文期刊】 潘飞翔 汤定钦 等 《生物工程学报》 2019年35卷3期 445-457页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为了在毛竹中开发更多的活性LTR反转录转座子,文中分析和鉴定了一个毛竹LTR反转录转座子(Ph-LTR2),系统分析了该转座子在逆境下的表达模式.Ph-LTR2转座子全长6 030 bp,属于Ty3-Gypsy家族中的Reina亚家族.LT...
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【中文期刊】 刘震 张树林 等 《生物技术通报》 2018年34卷5期 124-130页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 棉花是重要的纤维作物,在四个栽培棉种中,海岛棉纤维品质最优,了解LTR反转录转座子的数量与分布,可以促进海岛棉基因组的研究.通过综合不同方法挖掘海岛棉基因组中的LTR反转录转座子序列,并进行家族归类和数据分析.结果表明海岛棉A亚组和D亚组共...
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【中文期刊】 梁琳琳 周明兵 《生物工程学报》 2016年32卷4期 409-429页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 长末端重复序列(Long terminal repeat,LTR)反转录转座子是真核生物基因组中普遍存在的一类可移动的DNA序列,它们以RNA为媒介,通过“复制粘贴”机制在基因组中不断自我复制.在高等植物中,许多活性的LTR反转录转座子已被...
【关键词】 长末端重复序列反转录转座子；转座；LTR；
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【中文期刊】 张曦 侯小改 等 《植物学报》 2014年49卷3期 322-330页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 利用iPBS方法从西北牡丹(Paeonia suffruticosa)品种红绣球和中原牡丹品种洛阳红中扩增出相应片段,经回收、克隆及测序,获得了12条来自牡丹LTR类反转录转座子的LTR序列,并用相关生物信息学软件对序列进行分析.结果表明,...
【关键词】 iPBS；LTR类反转录转座子；序列分析；
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【中文期刊】 张赞一 周明兵 等 《中国细胞生物学学报》 2018年40卷9期 1466-1478页MEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 长末端重复序列(long terminal repeat,LTR)反转录转座子是真核生物基因组中普遍存在的一类可移动的DNA序列,因两端具有长末端重复序列而得名.大多数LTR反转录转座子能够感受外界环境的变化,具有转录激活特性和转座激活特性...
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【学位论文】 作者：侯菲导师：杨光伟 西南大学 基础医学 生理学（硕士） 2018年
【摘要】 水平转移（Horizontal transfer，HT）是在不同物种之间所进行的遗传物质交流的方式，在物种进化中扮演着重要角色。转座子（Transposable element，TE）是一段可以在宿主基因组中自由移动的DNA序列，随着基因组...
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【学位论文】 作者：曾凡春导师：高立志 昆明理工大学 生物学 生物化学与分子生物学（硕士） 2014年
【摘要】 LTR反转录转座子是植物基因组主要成分,是推动基因组大小变异和进化的重要原因.精确、高效的LTR反转录转座子注释对研究基因组大小变异和进化具有非常重要的意义.在本研究中开发了一款基于同源性搜索的LTR反转录转座子注释软件--LTRtype....
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【学位论文】 作者：Jyotsna Shakya导师：刘剑凯 吉林大学 生物学 生物化学（硕士） 2012年
【摘要】 研究背景人类内源性逆转录病毒序列(HERV)源于数百万年前逆转录病毒通过感染生殖细胞整合到人类基因组而被遗传下来,存在于人类基因组中.HERV在人类细胞中通过反转录,插入突变以及癌基因激活等各种方式发挥各种功能作用.在人类基因调控中发挥重要...
【关键词】 人类内源性逆转录病毒序列(HERV) ； 长末端重复序列(LTR) ；
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【学位论文】 作者：虞洪杰导师：郝柏林 浙江大学 生物学 生物信息学（博士） 2011年
【摘要】 反转录转座子(Retrotransposons)是真核生物基因组中普遍存在的一类可移动的遗传因子，它们以RNA作为中间媒介，在基因组中不断自我复制，不断增长自己的拷贝数，在高等植物中，基因组的很大部分由反转录转座子构成。它们的活动为植物基因...
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【会议论文】黄伟超 中国藻类学会第八次会员大会暨第十六次学术讨论会 2011年
【摘要】 <正>硅藻具有特殊的硅质细胞壁,它们贡献了全球初级生产的四分之一,是海洋所有真核微藻中最大的群体,占海洋初级生产的40%.两种已完成测序的硅藻假微型海链藻(Thalassiosira pseudonana)和三角褐指藻(Phaeodacth...
【关键词】 长末端重复反转录转座子(LTR-RTs) ； 三角褐指藻 ； 氮限制 ；
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