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【外文期刊】 Nugent, Timothy ; Ward, Sean ; 等 《Bioinformatics》 2011年27卷10期 1438-1439页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 signal peptide; alpha-helical transmembrane protein; transmembrane topology;
【外文期刊】 Qiua, ZJ ; Wang, XC ; 《Protein and peptide letters》 2009年16卷8期 984-990页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Residue preference; ligand-binding pocket identification; atom-contact-pair;
【外文期刊】 Behle RW ; 《Journal of Economic Entomology》 2006年99卷4期 1120-1128页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Beauveria bassiana; Trichoplusia ni; direct spray contact;
【外文期刊】 Siri C. Keulen ; Alexandre M. J. J. Bonvin ; 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2023年91卷10期 1407-1416页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 docking; false positive filtering; HADDOCK;
【外文期刊】 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2013年81卷1期 149-162页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 CASP; Domain rearrangement; GDT;
【外文期刊】 Sun, Hai-Ping ; Huang, Yan ; 等 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2015年83卷3期 485-496页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 protein structure prediction; residue contact map; residue co-evolution;
【外文期刊】 Monastyrskyy,B. ; D'Andrea,D. ; 等 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2014年82卷S2期 138-153页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 CASP; Residue-residue contact prediction; RR;
【外文期刊】 Miyazawa S. ; Jernigan RL. ; 《Journal of Molecular Biology》 1996年256卷3期 623-644页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Hydrophobicity; Contact energy; Residue packing energy;
【外文期刊】 Tu Kien T. Le ; Osamu Hirose ; 等 《Journal of biomedical science and engineering》 2014年7卷1期 28-37页
【关键词】 Residue-Residue Contacts; Domain-Domain Interactions; Protein-Protein Interactions;
【外文期刊】 Chakrabarty, B ; Das, D ; 等 2020年99卷
【关键词】 Protein contact network; Hydroxymethylbilane synthase; Acute intermittent porphyria;
【外文期刊】 Pozzati, Gabriele ; Zhu, Wensi ; 等 2022年38卷4期 954-961页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 PROTEIN-PROTEIN DOCKING; DIRECT-COUPLING ANALYSIS; RESIDUE CONTACTS;
【外文期刊】 Adhikari, Badri ; Bhattacharya, Debswapna ; 等 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2015年83卷8期 1436-1449页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 protein residue-residue contacts; protein structure modeling; ab initio protein folding;
【外文期刊】 Rahmatullah Roche ; Sutanu Bhattacharya ; 等 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2022年90卷12期 2023-2034页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 deep learning; inter‐residue contacts; protein modeling;
【外文期刊】 Horner DS ; Pirovano W ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2008年9卷1期 46-56页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 correlated mutation analysis; amino acid contacts; functional correlation;
【外文期刊】 Tao Shen ; Jiaxiang Wu ; 等 2021年89卷12期 1901-1910页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 CASP14; contact prediction; deep convolutional residual neural network;
【外文期刊】 Lukasz Kurgan ; Fatemeh Miri Disfani ; 《Current Protein and Peptide Science》 2011年12卷6期 470-489页
【关键词】 protein structure; protein structure prediction; structural descriptors;
【外文期刊】 Grewal, Rajdeep K. ; Roy, Soumen ; 《Protein and peptide letters》 2015年22卷10期 923-933页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Allostery; amino acid residues; graph theory;
【外文期刊】 Saravanan, K. M. ; Suvaithenamudhan, S. ; 等 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2017年85卷1期 54-64页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 pairwise residue contact energy; protein folding; molecular dynamics simulation;
【外文期刊】 Huang, He ; Gong, Xinqi ; 《Current Bioinformatics》 2020年15卷8期 821-830页
【关键词】 Machine learning; deep learning; protein structure prediction;