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【中文期刊】 么欣彤 孙善月  等 《复旦学报（医学版）》 2022年49卷3期 425-434页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 目的 建立一种适用于低起始量血浆样本的高通量(96样本/批次)、自动化miRNA文库构建方法,并系统评估该方法的可靠性与跨批次一致性.方法 基于PerkinElmer公司的NEXTFLEX?small RNA-seq试剂盒和Sciclone...

【关键词】 二代测序； miRNA测序技术(miRNA-seq)； 文库构建；

【中文期刊】 许昊 刘小亮  等 《第三军医大学学报》 2019年41卷9期 866-870页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 优化Tn5转座酶纯化和组装过程,建立少量细胞高质量转录组深度测序文库(RNA-Seq)的构建策略.方法 构建Tn5转座酶表达载体pSUMO-Tn5,优化Tn5转座酶表达、亲和纯化和组装过程,比较不同组装方式的Tn5转座酶构建少量RAW...

【关键词】 Tn5转座酶； RNA-seq； 文库构建；

【中文期刊】 何雨琦 李桂梅  等 《基因组学与应用生物学》 2017年36卷11期 4607-4615页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 RNA-seq是利用深度测序进行转录组分析的技术,并且在新一代测序的主流平台Illumina上运用广泛.针对Illumina平台的RNA-Seq建库,目前有多个不同类型的建库方法支持该技术,但是在操作步骤和成本上有很大差距.本研究分别试验了...

【关键词】 新一代测序； Illumina测序平台； RNA-seq建库；

【学位论文】 作者： 徐垚 导师：李国亮  华中农业大学  生物学 生物信息学（硕士） 2021年

【摘要】 肺癌的死亡率在全世界癌症中仍居首位，肺癌的早期筛查和治疗是降低其死亡率的有效手段。基于基因分子的筛查和基于分子靶向疗法的治疗手段已经应用于肺癌的研究，发挥出了重要作用，同时也显示出探索分子靶标的实用性。肺癌转录组研究可以为发现分子靶标提供宝...

【关键词】 肺癌； RNA-seq数据；

【中文期刊】 刘洋 池晴佳  等 《西安交通大学学报（医学版）》 2025年46卷1期 169-177页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 通过单细胞测序(scRNA-Seq)和Bulk转录组测序(Bulk RNA-Seq)技术鉴定出与肝癌CD8+T细胞相关的生物标志物并建立预后模型.方法 从GEO数据库中下载肝癌的单细胞数据集,通过scRNA-Seq技术提取患者与对照组...

【关键词】 肝癌； 单细胞测序(scRNA-Seq)； Bulk转录组测序(Bulk RNA-Seq)；

【中文期刊】 刘金婵 许德华  等 《河北医药》 2023年45卷7期 971-975页 ISTICCA

【摘要】 目的 通过整合多组学公共数据,构建由circRNA介导的非小细胞肺癌(NSCLC)特异性ceRNA网络并识别与NSCLC 患者预后相关的生物标志物.方法 首先,按|log2(Foldchange)|>1 和 adj-P<0.05 的标准,对...

【关键词】 非小细胞肺癌； 竞争性内源RNA； 多组学数据；

【中文期刊】 江香梅 伍艳芳  等 《遗传》 2014年36卷1期 58-68页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 樟树(Cinnamomum camphora )是樟科植物的一个代表种,具有材用、药用、香料、油用和生态环境建设等多种用途.叶精油中富含利用价值极高的樟脑、芳樟醇、1,8-桉叶油素、异-橙花叔醇和右旋龙脑等萜类化合物.依据叶精油中主要成分的...

【关键词】 樟树； RNA-Seq； 基因注释；

【中文期刊】 彭骅 李佛生  等 《生命科学仪器》 2017年15卷2期 19-28页

【摘要】 本文应用Perl语言和MySQL数据库构建了小RNA高通量测序数据分析平台,以4个水稻数据集为分析对象,详细介绍了小RNA高通量测序数据的处理方法和流程.我们以MSU 6.1水稻基因组为参考,构建了该版本的全基因组结构及已知ncRNAs位点...

【关键词】 小RNA(small RNAs)； 非编码RNA(ncRNAs)； 微小RNA(microRNAs,miRNAs)内源小干扰RNA(endo-siRNAs)；

【中文期刊】 向瑶 王俊普  等 《中国普通外科杂志》 2023年32卷4期 557-565页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 背景与目的:结肠腺癌(COAD)是癌症相关死亡的主要原因之一,准确预测COAD患者预后,评估COAD生存风险因素尤为重要.微小RNA(miRNA)通过靶向下游mRNA广泛参与肿瘤生物学行为调控,已成为具有应用研究前景的标志物.本研究旨在通过...

【关键词】 结肠肿瘤； 微RNAs； 比例危险度模型；