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【中文期刊】 Shanni Cao Xue Zhao 等 《植物多样性（英文版）》 2024年46卷3期 372-385页SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 Plant morphogenesis relies on precise gene expression programs at the proper time and position which is orchestrated by ...
【关键词】 Arabidopsis；Single cell transcriptome；Gene regulatory network；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 黄腾腾 陈小玲 等 《动物营养学报》 2026年38卷1期 706-715页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 本研究旨在通过Meta分析探究饲粮添加白藜芦醇对猪肉品质的影响,并整合转录组数据挖掘与计算生物学方法揭示其潜在调控机制.系统检索2000年1月至2025年1月期间在中国知网、万方、Web of Science和Science Direct数...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈心怡 黄鑫 等 《山东大学学报（医学版）》 2026年64卷6期 104-114页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 整合全转录组关联分析和复合零假设下的多效性分析,从转录组学层面探讨冠心病(coronary artery disease,CAD)-慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 傅东升 艾克热木江·木合热木 《中国组织工程研究》 2025年29卷20期 4379-4388页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:多指畸形患者中参与Heghog信号通路的一些转录因子发生异常表达,这些转录因子调控大量靶基因的表达,从而影响细胞的功能.目的:通过单细胞转录组分析多指畸形患者的转录组特征.方法:从GEO公共数据库中下载4例多指畸形患者细胞间质和上皮细...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 任彦学 赵琳琳 等 《中国实验诊断学》 2025年29卷6期 634-642页ISTIC
【摘要】 目的 应用单细胞测序技术探索阿尔茨海默病的发病机制.方法 从单细胞转录组数据库下载疾病组及对照组数据,下载后进行数据质控,利用Seurat软件进行数据整合、聚类,利用T-分布随机邻域嵌入和一致流形逼近与投影软件进行图的可视化.利用Singl...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Ruixue Nie Wenhui Zhang 等 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2024年15卷4期 1449-1465页SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 Background In poultry,the smooth transition of follicles from the preovulatory-to-postovulatory phase impacts egg produc...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 周蜓蜓 李立 等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷10期 4290-4301页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 单细胞转录组代表了某一时刻单个细胞内所有mRNA总表达量,其表达量反映该细胞的总体特征.通过单细胞转录组测序(single cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术对单个细胞的全部RNA进行逆转录、扩增和测序,测序结...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Mang Liang Bingxing An 等 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2023年14卷1期 88-97页SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 Background: Genomic selection (GS) has revolutionized animal and plant breeding after the first implementation via early...
【关键词】 BLUP；Cosine kernel；Genomic prediction；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 冯婷婷 李依桐 等 《实验动物与比较医学》 2024年44卷1期 62-73页ISTICCA
【摘要】 目的 通过系统梳理与分析新冠病毒感染相关的转录组数据,为研究新冠病毒感染过程中的生物学变化和致病机制提供更多的比较医学基础信息.方法 按照检索策略,以COVID-19和SARS-CoV-2为检索词,从GEO、ArrayExpress、GEN...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 尹金宝 唐泽立 等 《现代医药卫生》 2024年40卷11期 1823-1828页
【摘要】 目的 通过转录组数据分析,识别妊娠乳腺癌复发的关键基因.方法 下载GEO数据库中与妊娠乳腺癌相关的基因集GSE53031的基因表达谱.利用"limma"软件包中的Wilcoxon检验方法对妊娠乳腺癌复发组和非复发组患者之间的基因表达差异进行...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 翁军华 《浙江实用医学》 2024年29卷4期 286-294页
【摘要】 目的 在通过分析多组转录组和单细胞数据集,深入探究扩张性心肌病(DCM)的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点.方法 (1)数据获取与预处理.从GEO数据库获取多个转录组和单细胞数据集,并利用SVA软件去除批次效应.(2)差异基因分析.通过PCA...
- 概要：
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【中文期刊】 Sadaf Habib Anders Lindstrom 等 《植物分类学报》 2026年64卷2期 295-312页SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 Encephalartos,an African endemic genus within the Zamiaceae,comprises 65 extant species whose phylogenetic relationships...
【关键词】 biogeography；cycads；Encephalartos；
- 概要：
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【中文期刊】 林长松 邵娇芳 等 《科教导刊》 2023年26期 40-42页
【摘要】 随着大数据时代的到来,单细胞转录组测序作为一种强大的技术,为生物学研究提供了前所未有的机会.然而,传统的课程教学模式已无法满足学生对单细胞转录组测序的需求.文章针对这一问题,探讨了在大数据背景下进行的单细胞转录组测序课程改革的思路和策略,并...
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【中文期刊】 《基因组、蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2007年5卷1期 45-52页SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 We have previously developed a combined signal/variance distribution model that accounts for the particular statistical ...
【关键词】 transcriptome；microarray analysis；signal/variance distribution；
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【中文期刊】 Nan Song Miaomiao Wang 等 《植物分类学报》 2025年63卷3期 693-707页SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 Coccoidea(Hemiptera,Sternorrhyncha)are widely distributed and agriculturally significant insects known for their distinc...
【关键词】 mealybug；phylogenomics；Pseudococcidae；
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【中文期刊】 苏秀秀 龙法宁 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷2期 241-249页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 深度模型在单细胞转录组测序(single-cell transcriptome sequencing,scRNA-seq)中以单细胞分辨率提取基因的特征表达,但是scRNA-seq采集过程中存在"dropout"(数据缺失)问题,造成基因表...
- 概要：
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【中文期刊】 Nan Song Heng Zhang 《植物分类学报》 2023年61卷4期 572-586页SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【关键词】 Hemiptera；phylogeny；Sternorrhyncha；
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【中文期刊】 冯学超 邵雨彤 等 《生命科学》 2024年36卷12期 1572-1587页ISTICCSCD
【摘要】 空间转录组技术是一种通过测序或成像技术,在组织中进行基因空间表达检测的技术手段.该技术结合图像和建模分析算法,可以获得基因表达和各种细胞类型在组织中的空间分布模式.本文总结了空间转录组的实验检测原理和数据分析方法.在实验方法上,将目前的空间...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 马瑄 张华麟 等 《中华疾病控制杂志》 2023年27卷11期 1360-1364页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探索以确定独立筛选(sure independence screening,SIS)与多维尺度变换(multi-dimensional scaling,MDS)为基础的 2 步降维策略,及以支持向量机(support vector m...
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