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【外文期刊】 Karczynska, Agnieszka ; Mozolewska, Magdalena A. ; 等 《Journal of molecular graphics & modelling》 2018年83卷 92-99页
【关键词】 Protein structure prediction; UNRES force field; Knowledge-based methods;
【外文期刊】 Mozolewska, Magdalena A. ; Krupa, Pawel ; 等 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2015年83卷8期 1414-1426页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 iron-sulfur cluster biogenesis; iron-sulfur protein 1; J-protein;
【外文期刊】 Floudas CA ; 《Biotechnology and Bioengineering》 2007年97卷2期 207-213页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 protein structure prediction; protein folding; computational methods;
【外文期刊】 Liwo A ; Czaplewski C ; 等 《Current Opinion in Structural Biology》 2008年18卷2期 134-139页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 MOLECULAR-DYNAMICS METHOD; FREE-ENERGY CALCULATIONS; UNRES FORCE-FIELD;
【外文期刊】 Lubecka, Emilia A. ; Karczynska, Agnieszka S. ; 等 《Journal of molecular graphics & modelling》 2019年92卷 154-166页
【关键词】 protein structure prediction; Multiscale modeling; UNRES force field;
【外文期刊】 Adam,Liwo ; Adam K,Sieradzan ; 等 《Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)》 2019年1958卷 133-146页
【关键词】 Coarse graining; Coupling terms; Kubo cluster cumulants;
【外文期刊】 Adam K,Sieradzan ; Agnieszka G,Lipska ; 等 《Journal of molecular graphics & modelling》 2018年79卷 118-132页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 Local interactions; Physicochemical properties; Potentials of mean force;
【外文期刊】 Agnieszka,Karczyńska ; Magdalena A,Mozolewska ; 等 《Journal of molecular graphics & modelling》 2018年83卷 92-99页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 Knowledge-based methods; Protein structure prediction; Replica exchange molecular dynamics;
【外文期刊】 Magdalena A,Mozolewska ; Adam K,Sieradzan ; 等 《Journal of biomolecular structure & dynamics》 2017年35卷13期 2868-2879页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 UNRES force field; molecular dynamics simulations; protein folding;
【外文期刊】 Anna,Antoniak ; Iga,Biskupek ; 等 《Journal of molecular graphics & modelling》 2021年108卷 108008页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 Free and bioinformatics-assisted modeling; Multiscale modeling; Protein structure prediction;
【外文期刊】 Ana V,Rojas ; Gia G,Maisuradze ; 等 《Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)》 2022年2340卷 79-104页
【关键词】 Coarse graining; Molecular dynamics; Protein aggregation;
【外文期刊】 Agnieszka S,Karczyńska ; Cezary,Czaplewski ; 等 《Journal of computational chemistry》 2017年38卷31期 2730-2746页 SCIMEDLINECA
【关键词】 UNRES force field; ergodicity; multiplexed replica exchange molecular dynamics;
【外文期刊】 Agnieszka G,Lipska ; Anna M,Antoniak ; 等 《Journal of molecular modeling》 2022年28卷7期 201页 SCIMEDLINE
【关键词】 Metal ions; Protein-ion binding; Proteins;
【外文期刊】 Emilia A,Lubecka ; Agnieszka S,Karczyńska ; 等 《Journal of molecular graphics & modelling》 2019年92卷 154-166页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 Free and data-assisted modeling; Multiscale modeling; Replica-exchange molecular dynamics;
【外文期刊】 Magdalena A,Mozolewska ; Paweł,Krupa ; 等 《Proteins》 2015年83卷8期 1414-26页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 Isu1-Jac1 interactions; J-protein; UNited RESidue (UNRES) force field;
【外文期刊】 Hengyi,Xie ; Ana,Rojas ; 等 《ACS chemical neuroscience》 2022年13卷7期 987-1001页 SCIMEDLINECABP
【外文期刊】 Ana,Rojas ; Nika,Maisuradze ; 等 《ACS chemical neuroscience》 2017年8卷1期 201-209页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 Aβ peptide; UNRES force field; amyloids;
【外文期刊】 Emilia A,Lubecka ; Cezary,Czaplewski ; 等 《Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)》 2025年2867卷 19-41页
【关键词】 Energy function; NMR-based restraints; PSIPRED;
【外文期刊】 Mozolewska, Magdalena A. ; Sieradzan, Adam K. ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2017年35卷13/14期 2868-2879页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 protein folding; thermal stability; molecular dynamics simulations;
【外文期刊】 Adam K. Sieradzan ; Agnieszka G. Lipska ; 等 《Journal of molecular graphics & modelling》 2018年79卷 118-132页
【关键词】 Proteins; UNRES force field; Local interactions;
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