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【中文期刊】 Xiaolu Li Ye Yang 等 《中国神经再生研究（英文版）》 2024年19卷12期 2723-2734页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Immune changes and inflammatory responses have been identified as central events in the pathological process of spinal c...
- 概要：
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【中文期刊】 Cunte Chen Yangqiu Li 《中国癌症研究（英文版）》 2023年35卷3期 245-251页SCIMEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 Co-expression of immune checkpoint(IC)molecules can exacerbate T cell exhaustion in patients with hematological malignan...
【关键词】 Immune checkpoint；T cell exhaustion；co-expression pattern；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 蔡溦 朱御坤 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷18期 3747-3757页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:低度慢性炎症被认为在骨关节炎的发病机制中起着核心作用,但是具体的分子机制目前仍不清楚.目的:筛选和探讨骨关节炎中的潜在枢纽基因及免疫细胞的浸润情况.方法:将来自GPL570平台的GSE206848数据集与来自GPL96平台的GSE55...
- 概要：
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【中文期刊】 李鑫 慈百全 等 《微生物学杂志》 2025年45卷1期 24-33页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 研究噬菌体裂解酶对细菌生物被膜(Bacterial biofilm,BBF)的作用效果及转录机制.细菌生物被膜的形成是细菌耐药性产生的重要原因之一.金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)是常见的易形成生物被膜的致病微生...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 何田田 李泓毅 等 《中国肿瘤生物治疗杂志》 2025年32卷7期 716-722页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)探讨贝沙罗汀治疗双打击淋巴瘤(DHL)的分子机制,为DHL治疗提供潜在靶点和实验依据.方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载GSE44164和GSE43677表达谱数据集,筛选出差异表达基因(...
【关键词】 双打击淋巴瘤；贝沙罗汀；基于加权基因共表达网络分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李晶 鞠苇杭 等 《山东大学学报（医学版）》 2025年63卷9期 31-39页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 基于单细胞转录组学数据,探究多种癌症组织中不同细胞类型的基因共表达规律.方法 依托大规模公共单细胞转录组学数据,运用CS-CORE方法为 6 种常见的细胞类型在 5 种不同的癌症中分别构建了细胞类型特异性的基因共表达图谱.结果 共获得...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 张倩 黄东锋 《中国组织工程研究》 2026年30卷5期 1096-1105页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:脂质代谢异常影响软骨细胞代谢,在骨关节炎的发生和进展中有着重要的作用,但目前其机制尚不明确.目的:采用加权基因共表达网络分析结合机器学习算法鉴定骨关节炎软骨细胞脂质代谢特征基因,并进行初步验证.方法:采用加权基因共表达网络分析和微阵列...
【关键词】 骨关节炎；脂质代谢；加权基因共表达网络分析；
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【中文期刊】 禹志远 董海平 等 《上海交通大学学报（医学版）》 2025年45卷10期 1308-1319页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的·开发一种多算法协同的计算生物学策略,构建吗啡耐受外周神经调控网络的预测模型,并筛选高置信度候选靶标.方法·构建不同吗啡用药时长的小鼠模型,采集其背根神经节(dorsal root ganglion,DRG)组织开展批量RNA测序,以表...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 雷建园 陈琳 等 《临床与实验病理学杂志》 2025年41卷6期 799-802页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 探讨TTF-1/p40共表达非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的临床病理特点.方法 回顾性分析4例TTF-1/p40共表达NSCLC的临床病理资料,采用免疫组化EnVision两步法检测蛋...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘雅妮 杨静欢 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷5期 1091-1100页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:纤维肌痛综合征作为常见风湿病,其发病与中枢敏化及免疫异常有关,但具体过程尚未阐明,缺乏特异性诊断标志物,不断探索该病的发病机制具有重要的临床意义.目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)等生物信息学方法和机器学习算法筛选纤维肌痛...
- 概要：
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【中文期刊】 赖家铭 宋玉玲 等 《中国组织工程研究》 2026年30卷6期 1450-1463页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:放疗显著提高了多种恶性肿瘤患者的生存率.然而,随着治疗后的生存周期延长,许多患者面临放疗相关的心脏毒性风险,尤其是在接受胸部放疗后,放射性心脏损伤的风险显著增加,已成为影响患者生存最为严重的并发症之一.目的:通过系统转录组学分析,确定...
- 概要：
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【中文期刊】 李加根 陈跃平 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷26期 5595-5607页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:类风湿关节炎发病机制至今尚未完全清晰,近来有研究表明线粒体自噬与类风湿关节炎存在关联性,但关键机制有待深入探究.目的:利用多机器学习算法鉴定和验证类风湿关节炎中线粒体自噬过程的核心互作基因并解析其免疫调控过程.方法:从GEO数据库整理...
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【中文期刊】 武英楷 史高龙 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷2期 294-301页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:类风湿关节炎是一种全身的免疫相关性疾病,主要病理特点是关节滑膜炎性增生及关节软骨的破坏,其发病机制目前尚不明确,迫切需要发现新的具有高度敏感性和特异性的诊断标志物.目的:联合使用生物信息学技术及计算机学习算法,识别并筛选类风湿关节炎患...
- 概要：
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【中文期刊】 周未来 李俊 等 《中国免疫学杂志》 2025年41卷2期 287-294页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:利用生物信息学方法寻找与哮喘发病相关的关键基因并讨论其分子机制.方法:对GSE143303芯片数据进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),筛选出与哮喘发病显著相关的模块,并对模块基因进行蛋白质相互作用(PPI)网络分析、功能及通路富...
【关键词】 支气管哮喘；支气管镜管腔内活检；加权基因共表达网络分析；
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【中文期刊】 毛建云 张明婷 等 《心脏杂志》 2025年37卷4期 410-419页ISTICCA
【摘要】 目的 基于 WGCNA法探讨心房颤动(AF)射频消融术后复发的机制.方法 采用 limma法分析GSE2240、GSE41177、GSE115574中AF和窦性心律的差异基因,采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定AF关联性最强的基因...
【关键词】 心房颤动复发；沙库巴曲缬沙坦联合胺碘酮；加权基因共表达网络分析；
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【中文期刊】 方柔柔 张韩香 等 《中西医结合心脑血管病杂志》 2025年23卷18期 2742-2752页ISTIC
【摘要】 目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)和机器学习算法对动脉粥样硬化(AS)血管测序数据集进行分析,探讨AS的潜在靶点,以期为临床治疗和药物研发提供依据.方法:从基因表达综合数据库(GEO)中下载AS基因表达数据集GSE40231.利...
【关键词】 动脉粥样硬化；加权基因共表达网络分析；机器学习；
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【中文期刊】 王彤冉 杨莹 等 《临床肺科杂志》 2025年30卷11期 1690-1699页ISTIC
【摘要】 目的 建立基于基因表达综合(GEO)数据库的慢性阻塞性肺疾病(简称慢阻肺)和肺腺癌(LUAD)共有基因的人工神经网络(ANN)模型并评价其效果,同时采用单细胞分析解析细胞异质性和微环境动态.方法 收集来自GEO数据库的慢阻肺和LUAD患者基...
【关键词】 机器学习；加权基因共表达网络分析；人工神经网络；
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【中文期刊】 麻忠武 彭明晖 等 《肝胆胰外科杂志》 2025年37卷6期 402-410页ISTICCA
【摘要】 目的 探究胰腺导管腺癌(PDAC)微生物亚型及其与宿主基因组、肿瘤微环境的相互作用.方法 整合来源于GEO数据库的PDAC转录组数据和来源于BioProject数据库的PDAC宏基因组数据,通过非负矩阵分解(NMF)聚类确定PDAC肿瘤微生...
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【中文期刊】 李力 何晨江 等 《南昌大学学报（医学版）》 2025年65卷3期 1-14页ISTIC
【摘要】 目的 通过多组学数据挖掘和生物信息学分析,探讨甲状腺癌与牙周炎之间的共有分子网络及炎症-肿瘤交互机制.方法 从公共数据库获取牙周组织(包括牙周炎组织和正常牙周组织)和甲状腺组织(包括甲状腺癌组织和正常甲状腺组织)样本的转录组测序数据,预处理...
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【中文期刊】 王苗茜 马明峰 《中西医结合心脑血管病杂志》 2025年23卷16期 2411-2424页ISTIC
【摘要】 目的:使用生物信息学分析鉴定动脉粥样硬化(AS)中缺氧和铁死亡相关差异基因.方法:对GSE12288、GSE97210和GSE28829进行生物信息学分析.采用"limma"软件包鉴定差异表达基因(DEG).进行不同种类的富集分析,以找出相...
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