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            1. Dynamic DNA Energy Landscapes and Substrate Complexity in Triplet Repeat Expansion and DNA Repair.

            【外文期刊】 Jens,Völker ; G Eric,Plum ; 等 《Biomolecules》 2019年9卷11期

            【关键词】 8oxoG lesion; DNA energy landscapes; abasic site lesion;

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            2. Structure prediction in low dimensions: concepts, issues and examples.

            【外文期刊】 J Christian,Schön ; 《Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences》 2023年381卷2250期 20220246页

            【关键词】 energy landscapes; low-dimensional systems; monolayers;

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            3. Folding kinetics of WW domains with the united residue force field for bridging microscopic motions and experimental measurements. oa

            【外文期刊】 Rui,Zhou ; Gia G,Maisuradze ; 等 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2014年111卷51期 18243-8页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 FBP28 WW domain; folding rates; free-energy landscapes;

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            4. A new heuristic method for approximating the number of local minima in partial RNA energy landscapes.

            【外文期刊】 Andreas A,Albrecht ; Luke,Day ; 等 《Computational biology and chemistry》 2016年60卷 43-52页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Energy landscape analysis; Gamma distribution; Local minima;

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            5. The Genomic Code: the genome instantiates a generative model of the organism.

            【外文期刊】 Kevin J,Mitchell ; Nick,Cheney ; 《Trends in genetics : TIG》 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 attractors; autoencoder; connectionist network;

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            6. The Effect of Pulling and Twisting Forces on Chameleon Sequence Peptides.

            【外文期刊】 James,Meadows ; Konstantin,Röder ; 《Chemphyschem : a European journal of chemical physics and physical chemistry》 2023年24卷24期 e202300351页 SCIMEDLINECA

            【关键词】 chameleon sequences; energy landscapes; mechanical forces;

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            7. Assessing RNA atomistic force fields via energy landscape explorations in implicit solvent.

            【外文期刊】 Konstantin,Röder ; Samuela,Pasquali ; 《Biophysical reviews》 2024年16卷3期 285-295页

            【关键词】 Energy landscapes; Force fields; RNA;

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            8. Telomeric RNA quadruplexes as targets for cancer prevention: The therapeutic potential of agonodepsides. oa

            【外文期刊】 Gourav,Choudhir ; Sushil,Kumar ; 等 《Journal, genetic engineering & biotechnology》 2025年23卷1期 100454页 MEDLINE

            【关键词】 Free Energy Landscapes; Fungal Metabolites; Genome Stability;

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            9. Minimization-Aware Recursive K*: A Novel, Provable Algorithm that Accelerates Ensemble-Based Protein Design and Provably Approximates the Energy Landscape. oa

            【外文期刊】 Jonathan D,Jou ; Graham T,Holt ; 等 《Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology》 2020年27卷4期 550-564页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 K*; OSPREY; computational protein design;

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            10. Energy Landscapes of Protein Aggregation and Conformation Switching in Intrinsically Disordered Proteins.

            【外文期刊】 Birgit,Strodel ; 《Journal of molecular biology》 2021年433卷20期 167182页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 IDPs; amyloid aggregation; disconnectivity graphs;

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            11. Energy-based step selection analysis: Modelling the energetic drivers of animal movement and habitat use.

            【外文期刊】 Natasha J,Klappstein ; Jonathan R,Potts ; 等 《The Journal of animal ecology》 2022年91卷5期 946-957页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 animal movement; energetics; energy landscapes;

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            12. Protein Interaction Energy Landscapes are Shaped by Functional and also Non-functional Partners.

            【外文期刊】 Hugo,Schweke ; Marie-Hélène,Mucchielli ; 等 《Journal of molecular biology》 2020年432卷4期 1183-1198页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 cross-docking; interaction energy landscapes; non-functional interactions;

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            13. Microsecond dynamics of H10N7 influenza neuraminidase reveals the plasticity of loop regions and drug resistance due to the R292K mutation.

            【外文期刊】 Md Fulbabu,Sk ; Sunanda,Samanta ; 等 《Journal of computational chemistry》 2024年45卷5期 247-263页 SCIMEDLINECA

            【关键词】 Conformational dynamics; Free energy landscapes; Influenza neuraminidase;

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            14. Photoprotective conformational dynamics of photosynthetic light-harvesting proteins.

            【外文期刊】 Premashis,Manna ; Gabriela S,Schlau-Cohen ; 《Biochimica et biophysica acta. Bioenergetics》 2022年1863卷4期 148543页

            【关键词】 Free-energy landscapes; Photoprotection; Photosynthetic light harvesting;

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            15. Amyloid Polymorphism in the Protein Folding and Aggregation Energy Landscape.

            【外文期刊】 Jozef,Adamcik ; Raffaele,Mezzenga ; 《Angewandte Chemie (International ed. in English)》 2018年57卷28期 8370-8382页 SCIMEDLINECA

            【关键词】 amyloids; energy landscapes; polymorphism;

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            16. An energy-landscape integrated analysis to evaluate agroecological scarcity.

            【外文期刊】 Maryam,Yousefi ; Asef,Darvishi ; 等 《The Science of the total environment》 2020年739卷 139998页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Agroecology; Arid landscapes; Energy flows;

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            17. Kinetic models of hematopoietic differentiation. oa

            【外文期刊】 Victor,Olariu ; Carsten,Peterson ; 《Wiley interdisciplinary reviews. Systems biology and medicine》 2019年11卷1期 e1424页 MEDLINE

            【关键词】 energy landscapes; hematopoiesis; rate equations;

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            18. Conformational distributions of isolated myosin motor domains encode their mechanochemical properties.

            【外文期刊】 Justin R,Porter ; Artur,Meller ; 等 《eLife》 2020年9卷

            【关键词】 biochemistry; chemical biology; chicken;

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            19. Structural insights into conformational stability and binding of thiazolo-[2,3-b] quinazolinone derivatives with EGFR-TKD and in-vitro study. oa

            【外文期刊】 Showkat,Ahmad Mir ; Prajna,Paramita Mohanta ; 等 《Saudi journal of biological sciences》 2022年29卷12期 103478页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Apoptosis; EGFR-TKD; Free energy Landscapes;

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            20. Formamide reaction network in gas phase and solution via a unified theoretical approach: Toward a reconciliation of different prebiotic scenarios. oa

            【外文期刊】 Fabio,Pietrucci ; Antonino Marco,Saitta ; 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2015年112卷49期 15030-5页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 ab initio molecular dynamics; chemical reactions; formamide;

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