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【中文期刊】 孔韧 徐雪梅  等 《物理化学学报》 2007年23卷9期 1325-1331页

【摘要】 吡咯烷与正丁烷类CCR5(化学趋化因子受体5)拮抗剂可通过抑制人类免疫缺陷病毒(HIV-1)包膜蛋白与CCR5的相互作用而阻断病毒进入细胞.本文使用已知拮抗剂结构和活性信息构建了一个三维药效团模型.按照Catalyst/HypoGen模块的...

【关键词】 CCR5； HIV-1； 药效团模型；

【中文期刊】 Liu Yang Wei He  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年20卷4期 765-779页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Uncovering conserved 3D protein-ligand binding patterns on the basis of functional groups(FGs)shared by a variety of sma...

【关键词】 Protein-ligand interaction； Functional group； Binding motif；

【外文期刊】 Wang, H. ; Blais, J. ; 等 《Chemical biology and drug design》 2010年76卷6期 480-495页

【关键词】 Kinase; Molecular modeling; Phosphatase;

【外文期刊】 Fan EK ; O'Neal CJ ; 等 《International journal of medical microbiology: IJMM》 2004年294卷4期 217-223页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 cholera toxin; heat-labile enterotoxin; structure-based drug design;

【外文期刊】 Huang, Wanqiu ; Zhang, Luyong ; 等 2022年17卷1/6期 461-472页

【关键词】 CADD; type 2 diabetes; ligand-based drug design;

【外文期刊】 Liu CS ; Li JR ; 等 《Inorganica Chimica Acta》 2007年360卷8期 2532-2540页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 3-(2-pyridyl)pyrazole-based ligands; carboxylic acid ligands; Mn(II) complexes;

【外文期刊】 Saio, T. ; Ogura, K. ; 等 《Journal of Biomolecular NMR》 2011年51卷3期 395-408页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Fragment-based drug design (FBDD); Lanthanide-binding peptide tag (LBT); Ligand screening;

【外文期刊】 Arsovska, Emilija ; Mali, Gregor ; 等 《Current medicinal chemistry》 2014年21卷38期 4328-4346页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Antibiotics; drug discovery; fragment based drug design;

【外文期刊】 Pai, Priyadarshini P. ; Mondal, Sukanta ; 《Current topics in medicinal chemistry》 2017年17卷21期 2401-2421页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Catalytic residues; Protein-ligand interaction; Post-translational modifications;

【外文期刊】 Hardcastle IR ; Ahmed SU ; 等 《Journal of Medicinal Chemistry》 2006年49卷21期 6209-6221页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 STRUCTURE-BASED DESIGN; NOVO LIGAND DESIGN; TUMOR-CELL-LINES;

【外文期刊】 Arun K. Ghosh ; W. Sean Fyvie ; 等 《Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters》 2017年27卷21期 4925-4931页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 HIV protease; Drug resistance; P1′-P2′ ligands;

【外文期刊】 Balazs Kramos ; Zsuzsa Hadady ; 等 2024年15卷3期 396-405页

【关键词】 GABAB receptor; PAM; Positive allosteric modulator;

【外文期刊】 Amano,Y. ; Yamaguchi,T. ; 等 《Bioorganic and medicinal chemistry》 2014年22卷8期 2427-2434页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Crystal structure; Fragment-based approach; High-throughput protein crystallography;

【外文期刊】 Reddy,M.R. ; Reddy,C.R. ; 等 《Current pharmaceutical design》 2014年20卷20期 3323-3337页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 FBPase; Free energy calculations; Free energy perturbation;

【外文期刊】 Irwin, JJ ; Shoichet, BK ; 等 《Journal of Medicinal Chemistry》 2009年52卷18期 5712-5720页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 STRUCTURE-BASED DISCOVERY; PROTEIN-LIGAND DOCKING; MOLECULAR DOCKING;

【外文期刊】 Phan J ; Shi ZD ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2005年353卷1期 104-115页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Grb2 SH2; domain-swapped; macrocyclic tetrapeptide mimetic S1s;

【外文期刊】 Shunsuke Tamura ; Tomoyuki Miyao ; 等 2020年39卷12期 2000103-2000103页

【关键词】 activity cliff prediction; applicability domain; drug design;

【外文期刊】 Hengxi Zhang ; Ondrej Danek ; 等 2022年13卷6期 935-942页

【关键词】 Fragment-based ligand design; Lectin; DC-SIGN;

【外文期刊】 Bertleff-Zieschang, Nadja ; Bechold, Julian ; 等 《Chembiochem: A European journal of chemical biology》 2017年18卷15期 1477-1481页

【关键词】 carbohydrates; fragment-based design; ligand design;

【外文期刊】 Katz BA. ; 《Journal of Molecular Biology》 1997年274卷5期 776-800页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Intersubunit conformational equilibrium; Ph-dependent structural changes; Shift in pk(a);