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【中文期刊】 于欣萍 王诗尧 等 《中华中医药学刊》 2025年43卷4期 82-89,后插22-后插26页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于生物信息学探究肝癌发生发展的潜在分子机制,筛选并验证鳖甲煎丸对肝癌起调控作用的机制和靶点.方法 下载GEO数据库中的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)单细胞数据,处理后进行通讯分析、富集与代谢分析...
【关键词】 肝癌；鳖甲煎丸；scRNA-seq分析；
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【中文期刊】 徐桂铃 叶青林 等 《中国免疫学杂志》 2025年41卷7期 1673-1687页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:综合生物信息学相关技术,从免疫角度探讨铁死亡参与IgA肾病(IgAN)的发病机制,确定铁死亡相关的枢纽基因和功能通路.方法:获取GSE93798的差异表达铁死亡相关基因(DE-FRGs),进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)、基因...
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【中文期刊】 周蜓蜓 李立 等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷10期 4290-4301页
【摘要】 单细胞转录组代表了某一时刻单个细胞内所有mRNA总表达量,其表达量反映该细胞的总体特征.通过单细胞转录组测序(single cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术对单个细胞的全部RNA进行逆转录、扩增和测序,测序结...
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【中文期刊】 何心勤 张霞 等 《现代妇产科进展》 2023年32卷12期 894-903页ISTIC
【摘要】 目的:利用生物信息学方法研究探讨肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)相关基因在子宫内膜癌(EC)的发生发展,发现新的EC肿瘤生物标志物,构建新的EC风险模型.方法:从公共数据库中获得EC患者的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集.在EC肿瘤...
【关键词】 子宫内膜癌(EC)；肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)；预后模型；
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【中文期刊】 崔宝山 黄飞 等 《中国畜牧兽医》 2022年49卷12期 4573-4581页
【摘要】 [目的]探究牛体内雌性和雄性囊胚在mRNA水平上的特异性差异,挖掘雌性和雄性囊胚发育差异相关候选基因.[方法]参考GenBank中牛牙釉质基因(AMEL)序列(AMELX基因,登录号:NM_001014984.1;AMELY基因,登录号:N...
【关键词】 牛体内囊胚；单细胞转录组测序(scRNA-Seq)；性别特异性基因；
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【中文期刊】 刘洋 池晴佳 等 《西安交通大学学报（医学版）》 2025年46卷1期 169-177页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过单细胞测序(scRNA-Seq)和Bulk转录组测序(Bulk RNA-Seq)技术鉴定出与肝癌CD8+T细胞相关的生物标志物并建立预后模型.方法 从GEO数据库中下载肝癌的单细胞数据集,通过scRNA-Seq技术提取患者与对照组...
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【中文期刊】 张星语 李若谷 《上海交通大学学报（医学版）》 2025年45卷6期 735-744页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的·利用单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术探究主动脉瘤(aortic aneurysm,AA)的单细胞图景.方法·通过系统性检索高通量基因表达数据库(Gene Expressi...
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【中文期刊】 任亚娟 边云飞 等 《中西医结合心脑血管病杂志》 2025年23卷5期 657-668页ISTIC
【摘要】 目的:基于单细胞测序探索靶向microRNA-33治疗对动脉粥样硬化(AS)免疫微环境的影响.方法:于基因表达综合数据库(GEO)下载单细胞RNA测序数据集GSE161494,根据治疗方式分为抗microRNA-33治疗组与对照组,使用R语...
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【中文期刊】 智勇 谢姗珊 等 《新疆医科大学学报》 2024年47卷3期 314-321,328页ISTICCA
【摘要】 目的 观察养阴活胃合剂对 MC细胞(MNNG诱导人胃黏膜上皮细胞GES-1恶性转化)增殖、迁移、侵袭及凋亡的影响,探讨其下调AQP3抑制IL-10/JAK1/STAT3信号通路激活进而阻断或逆转慢性萎缩性胃炎(CAG)病变的作用机制.方法 ...
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【中文期刊】 何佳 王文杰 等 《中国卫生统计》 2023年40卷3期 354-357,362页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 研究Specter聚类的原理和方法,探讨其适用条件,并将其应用于卵巢癌单细胞测序(scRNA-seq)数据的聚类分析,标记得到的细胞亚群.方法 通过模拟试验和实际单细胞RNA数据分析,对Specter聚类和较常用的其他三种方法进行比较...
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【中文期刊】 王正 张倩月 等 《复旦学报（医学版）》 2022年49卷2期 213-225页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 目的 构建轻重症及转归阶段的新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)患者和健康对照的外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)的单细胞转录...
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【中文期刊】 徐曼云 《长治医学院学报》 2023年37卷5期 321-326,344页
【摘要】 目的:探讨人体内红细胞发育过程中的珠蛋白表达调控.方法:基于单细胞转录组公共数据集GSE150774,解析红细胞发育过程中珠蛋白表达调控在骨髓与脐带血样本之间的差异.使用Seurat流程对数据集进行表达矩阵构建、质控和标志基因分析.使用Ha...
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【中文期刊】 赫雪 谷英 等 《中国畜牧兽医》 2022年49卷11期 4296-4306页
【摘要】 [目的]试验旨在解析鄂尔多斯细毛羊胚胎期次级毛囊诱导期形态发生过程中主要细胞类型的分子特征和分化过程.[方法]对采集的3只鄂尔多斯细毛羊(胎龄87 d)体侧部(肩胛骨后缘处)的皮肤样本进行HE染色,鉴定毛囊的发育时期;部分皮肤样本经过混样后...
【关键词】 鄂尔多斯细毛羊；次级毛囊；单细胞转录组测序(scRNA-Seq)；
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